Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GTT8

Protein Details
Accession C1GTT8    Localization Confidence High Confidence Score 24.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAKRRTKKRTHLQAGSNSHVAHydrophilic
226-253TTKRTGIPKRIRRLNPKEQRHRDRKTGABasic
369-411LDEAWEKKRKEKEQRRKEQKENIERKRKEKRGRGKGDAIKEGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-250GIPKRIRRLNPKEQRHRDRK
307-317RMKGGEKRSSK
375-404KKRKEKEQRRKEQKENIERKRKEKRGRGKG
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbl:PAAG_01933  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAKRRTKKRTHLQAGSNSHVAPKNASASMTKSPKSMVIRMGAGEVGPSVSQLVKDVRAMMEPDTASRLKERKSNKLKDYTVMTGPLGVTHLLLFSKSSTGNTNFRLALAPRGPTLHFRVENYSLCKDVVKALKHPKGWDKLHLTPPLLVMNNLMSSNTDNEHFSKAVPKHLESLATTVFQSLFPLISPQTTPLSSIRRIMLLNRELSPEQTEDGSYILNLRHYAITTKRTGIPKRIRRLNPKEQRHRDRKTGALPNLGKLDDVADYLLDPSAAGYTSASETELDTDAEVEVLENTAKKVLNKRELQRMKGGEKRSSKPSDPNVEKRAVKLVELGPRMKLKLTKVEEGLCGGKVLWHHVLAKTEAETKELDEAWEKKRKEKEQRRKEQKENIERKRKEKRGRGKGDAIKEGEDGEDDEDLHDEWDGEDFDDGDEDMEDASADY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.8
3 0.72
4 0.61
5 0.56
6 0.5
7 0.42
8 0.35
9 0.31
10 0.3
11 0.28
12 0.3
13 0.26
14 0.27
15 0.36
16 0.4
17 0.37
18 0.34
19 0.34
20 0.39
21 0.43
22 0.42
23 0.38
24 0.35
25 0.36
26 0.36
27 0.35
28 0.28
29 0.22
30 0.18
31 0.13
32 0.09
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.1
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.2
46 0.18
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.22
51 0.21
52 0.2
53 0.26
54 0.29
55 0.28
56 0.35
57 0.41
58 0.47
59 0.58
60 0.67
61 0.68
62 0.73
63 0.72
64 0.7
65 0.69
66 0.63
67 0.54
68 0.47
69 0.38
70 0.29
71 0.27
72 0.22
73 0.17
74 0.12
75 0.1
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.16
86 0.2
87 0.25
88 0.27
89 0.3
90 0.28
91 0.28
92 0.3
93 0.25
94 0.28
95 0.25
96 0.24
97 0.21
98 0.23
99 0.24
100 0.25
101 0.29
102 0.29
103 0.28
104 0.29
105 0.33
106 0.36
107 0.39
108 0.4
109 0.36
110 0.3
111 0.29
112 0.27
113 0.22
114 0.24
115 0.26
116 0.24
117 0.3
118 0.39
119 0.45
120 0.47
121 0.51
122 0.53
123 0.56
124 0.56
125 0.56
126 0.53
127 0.54
128 0.59
129 0.58
130 0.51
131 0.43
132 0.42
133 0.38
134 0.31
135 0.24
136 0.17
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.2
152 0.2
153 0.26
154 0.27
155 0.27
156 0.28
157 0.28
158 0.29
159 0.22
160 0.24
161 0.18
162 0.16
163 0.15
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.14
180 0.18
181 0.19
182 0.21
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.2
187 0.23
188 0.22
189 0.23
190 0.22
191 0.24
192 0.22
193 0.22
194 0.22
195 0.16
196 0.13
197 0.11
198 0.1
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.1
211 0.12
212 0.15
213 0.16
214 0.18
215 0.22
216 0.28
217 0.31
218 0.38
219 0.45
220 0.5
221 0.58
222 0.65
223 0.68
224 0.72
225 0.79
226 0.8
227 0.8
228 0.82
229 0.84
230 0.85
231 0.88
232 0.88
233 0.84
234 0.81
235 0.75
236 0.7
237 0.67
238 0.66
239 0.58
240 0.57
241 0.52
242 0.46
243 0.44
244 0.38
245 0.29
246 0.2
247 0.19
248 0.1
249 0.1
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.08
283 0.09
284 0.12
285 0.2
286 0.28
287 0.36
288 0.44
289 0.49
290 0.57
291 0.62
292 0.63
293 0.63
294 0.6
295 0.58
296 0.57
297 0.57
298 0.54
299 0.56
300 0.57
301 0.58
302 0.59
303 0.56
304 0.57
305 0.61
306 0.63
307 0.64
308 0.68
309 0.64
310 0.65
311 0.62
312 0.55
313 0.55
314 0.44
315 0.37
316 0.33
317 0.33
318 0.33
319 0.36
320 0.36
321 0.31
322 0.33
323 0.34
324 0.32
325 0.31
326 0.27
327 0.33
328 0.37
329 0.39
330 0.39
331 0.41
332 0.39
333 0.38
334 0.35
335 0.26
336 0.21
337 0.16
338 0.14
339 0.12
340 0.16
341 0.15
342 0.16
343 0.18
344 0.2
345 0.23
346 0.23
347 0.24
348 0.22
349 0.26
350 0.24
351 0.23
352 0.22
353 0.2
354 0.22
355 0.21
356 0.2
357 0.19
358 0.24
359 0.29
360 0.37
361 0.37
362 0.42
363 0.51
364 0.6
365 0.66
366 0.73
367 0.77
368 0.8
369 0.9
370 0.94
371 0.94
372 0.94
373 0.93
374 0.92
375 0.92
376 0.92
377 0.91
378 0.91
379 0.87
380 0.87
381 0.88
382 0.88
383 0.87
384 0.87
385 0.87
386 0.87
387 0.91
388 0.9
389 0.89
390 0.87
391 0.84
392 0.81
393 0.72
394 0.63
395 0.53
396 0.45
397 0.35
398 0.28
399 0.21
400 0.14
401 0.13
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.08
409 0.07
410 0.09
411 0.1
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06