FuNGI

W6R1W5

Protein Details

Accession

W6R1W5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-25	MPSNKTDHKRKRSSGNDRPSKKPAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-14	KRKRSS
471-497	RAEAHARRVARLRVPVEFPKVSRGGRR

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 9.666, nucl 8, cyto_nucl 7.833, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSNKTDHKRKRSSGNDRPSKKPALQQLPPLAASVVEDKSELAPVIVDTPGLQSSKSLHWNPYIKNRANVSKSAASTRNPGIVSSEILLQSSDHPKLDFVGREGTGDDTDSQVKHYVAVIDPERKTWKVVEVRRATLRGAVRSRKPEDDSDEEMNTMRAQRTALTNTFGTKQSRKAVQSMAENAQLSNAPTGAVPQAGAALISSLPANTASGLAKALAMQAEVQAAKPLPTPNLAVSHPSDVYTIETLVPGSHSTLSQLNGVDEWKSQVEAGLGVTTVSRYVSNRVGAVVNSENITHLQVLRFIQLLIEFGRCLKNAGANAKGGGPGSKRLPPREDLRRILSNTTGSVTKPKPGAAAPDAASADLLPESVIDAVRRRFAPSGGYVSKNDFTLLQTTICALSLHIPPQPARDGGSSSLGGNAPNELATDPSDLRDDLRLDPNTIHQYFRELGCRIDKPRETEFAKWNIKGGRAEAHARRVARLRVPVEFPKVSRGGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.89
2	0.89
3	0.89
4	0.85
5	0.85
6	0.82
7	0.79
8	0.73
9	0.7
10	0.69
11	0.68
12	0.67
13	0.69
14	0.69
15	0.66
16	0.61
17	0.54
18	0.43
19	0.33
20	0.29
21	0.24
22	0.17
23	0.14
24	0.13
25	0.13
26	0.14
27	0.15
28	0.14
29	0.09
30	0.09
31	0.09
32	0.11
33	0.1
34	0.09
35	0.08
36	0.1
37	0.12
38	0.12
39	0.12
40	0.11
41	0.15
42	0.21
43	0.28
44	0.3
45	0.31
46	0.39
47	0.46
48	0.5
49	0.58
50	0.62
51	0.58
52	0.61
53	0.64
54	0.65
55	0.62
56	0.6
57	0.56
58	0.52
59	0.5
60	0.5
61	0.48
62	0.41
63	0.42
64	0.41
65	0.39
66	0.33
67	0.32
68	0.28
69	0.25
70	0.25
71	0.2
72	0.21
73	0.15
74	0.15
75	0.15
76	0.13
77	0.16
78	0.2
79	0.21
80	0.19
81	0.19
82	0.19
83	0.21
84	0.25
85	0.22
86	0.19
87	0.22
88	0.21
89	0.22
90	0.22
91	0.22
92	0.17
93	0.17
94	0.15
95	0.12
96	0.14
97	0.13
98	0.14
99	0.15
100	0.15
101	0.14
102	0.15
103	0.15
104	0.14
105	0.19
106	0.21
107	0.26
108	0.27
109	0.29
110	0.33
111	0.31
112	0.32
113	0.28
114	0.32
115	0.35
116	0.41
117	0.47
118	0.48
119	0.53
120	0.55
121	0.55
122	0.47
123	0.44
124	0.41
125	0.38
126	0.4
127	0.42
128	0.44
129	0.51
130	0.55
131	0.54
132	0.54
133	0.51
134	0.5
135	0.49
136	0.48
137	0.44
138	0.4
139	0.35
140	0.32
141	0.28
142	0.22
143	0.18
144	0.13
145	0.1
146	0.1
147	0.11
148	0.15
149	0.19
150	0.2
151	0.2
152	0.2
153	0.21
154	0.23
155	0.25
156	0.26
157	0.24
158	0.28
159	0.31
160	0.37
161	0.37
162	0.37
163	0.37
164	0.37
165	0.38
166	0.38
167	0.34
168	0.31
169	0.29
170	0.26
171	0.23
172	0.19
173	0.16
174	0.12
175	0.09
176	0.06
177	0.06
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.04
187	0.04
188	0.03
189	0.04
190	0.04
191	0.03
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.04
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.1
218	0.12
219	0.12
220	0.14
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.15
226	0.14
227	0.13
228	0.11
229	0.12
230	0.1
231	0.09
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.07
242	0.08
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.06
268	0.09
269	0.11
270	0.12
271	0.13
272	0.14
273	0.14
274	0.13
275	0.15
276	0.13
277	0.11
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.08
284	0.08
285	0.07
286	0.1
287	0.1
288	0.11
289	0.1
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.1
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.08
298	0.1
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.13
303	0.16
304	0.19
305	0.2
306	0.19
307	0.19
308	0.18
309	0.18
310	0.15
311	0.14
312	0.12
313	0.14
314	0.17
315	0.22
316	0.26
317	0.29
318	0.33
319	0.35
320	0.42
321	0.48
322	0.53
323	0.52
324	0.54
325	0.55
326	0.54
327	0.51
328	0.46
329	0.37
330	0.3
331	0.27
332	0.22
333	0.16
334	0.22
335	0.21
336	0.23
337	0.23
338	0.22
339	0.23
340	0.23
341	0.28
342	0.22
343	0.26
344	0.22
345	0.24
346	0.24
347	0.22
348	0.21
349	0.14
350	0.13
351	0.08
352	0.07
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.06
358	0.07
359	0.11
360	0.12
361	0.17
362	0.18
363	0.2
364	0.21
365	0.21
366	0.24
367	0.23
368	0.3
369	0.3
370	0.32
371	0.3
372	0.33
373	0.34
374	0.3
375	0.27
376	0.2
377	0.17
378	0.17
379	0.18
380	0.14
381	0.13
382	0.13
383	0.13
384	0.13
385	0.11
386	0.09
387	0.11
388	0.14
389	0.16
390	0.17
391	0.19
392	0.19
393	0.23
394	0.25
395	0.22
396	0.22
397	0.21
398	0.22
399	0.22
400	0.25
401	0.22
402	0.19
403	0.21
404	0.19
405	0.17
406	0.15
407	0.14
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.08
412	0.09
413	0.1
414	0.13
415	0.12
416	0.13
417	0.15
418	0.15
419	0.16
420	0.19
421	0.2
422	0.21
423	0.28
424	0.29
425	0.29
426	0.3
427	0.35
428	0.4
429	0.38
430	0.36
431	0.28
432	0.31
433	0.32
434	0.34
435	0.34
436	0.27
437	0.29
438	0.35
439	0.41
440	0.41
441	0.48
442	0.49
443	0.49
444	0.53
445	0.58
446	0.55
447	0.56
448	0.58
449	0.59
450	0.62
451	0.56
452	0.57
453	0.52
454	0.53
455	0.49
456	0.44
457	0.4
458	0.37
459	0.45
460	0.45
461	0.49
462	0.49
463	0.48
464	0.5
465	0.51
466	0.53
467	0.51
468	0.54
469	0.49
470	0.49
471	0.55
472	0.57
473	0.57
474	0.55
475	0.5
476	0.49
477	0.51

W6R1W5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer