Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6QKZ6

Protein Details
Accession W6QKZ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-444RQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 6, mito 5, plas 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSNKYPKIVSPVIEEQAQVVDGEEIPIDITRPNPNGEEQDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPADEQEMMMEIYKYTDRVVNMVRPRKLLMIAIDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQEAKENDQKKEELQKMLAQQHATKTGEQLMREEVVQKTWDSNVITPGTPFMDILAASLRYWIAYKLNTDPGWENLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPNHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLGTHEPYFRVLREDVFAQDSRPRGCRLCGQNGHKAEECLGRPKEKSGEFDEKQNAAPLKPFIWLHVAVLREYLAVELRVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPAMGSYLTKDGTVELKNAQIILQGLAKQEDAIFARRRQADERKQANEKRRKEQDAARNEERAQKRRRSSPQHDLTAGDRSHGGGEPAPPMELITPGRGHLNKETRELTHSMVINRGAVYRANMENKSAAAVLKSKLMKGNQDVAGDSETPATNGEDVPGETPGQTSPGVLGKRKVDATEQELTEAGTPGRDSPLPVPVAPEKPKQDEPQEDTVKLWEPGYADRYYEQKFGVDPKDLEFRHQVAREYAIGLCWVLQYYFQGCPSWTWYYPRHYAPFAADFVDIGDMDVKFEKGTIFKPFEQLMGVLPASSNHALPKVFHPLMENPDSEIIDFYPEDFPLDLNGKKFAWQGVILLPFIDETRLLNAMAKVYPLLTEDEKSRNSHGQDVLLLSDRNPLYQDLVANFYSKKPGPAQYSIKEDVSGGLAGIVERSDTYIPHSSLVSPLEAHGMPGVDDDRSLTVLYTIPESSHIHKSMLLRGVKLPTPMLDSNDIRATQTRSQNSGRSFGGAPFQGRGRGGRMNYSSDRPNPFAAHLDPKFNSGPSQGGPGGAPMVPPGWVPPGQGYGGYARGPPPPPRGGMPHQYPPQHPPQHGYQQPGDYYAQQNNQYNQGGQYNNSHQSGYGQQDYRGGRGGNRGGRGRGGQNRDHYSNNQGGGGYNRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.52
4 0.52
5 0.47
6 0.44
7 0.45
8 0.44
9 0.4
10 0.38
11 0.3
12 0.27
13 0.25
14 0.17
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.09
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.11
26 0.17
27 0.19
28 0.22
29 0.24
30 0.28
31 0.33
32 0.34
33 0.36
34 0.32
35 0.35
36 0.33
37 0.33
38 0.29
39 0.24
40 0.22
41 0.18
42 0.15
43 0.1
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.17
50 0.2
51 0.2
52 0.28
53 0.36
54 0.42
55 0.47
56 0.47
57 0.5
58 0.51
59 0.54
60 0.46
61 0.41
62 0.36
63 0.31
64 0.28
65 0.22
66 0.17
67 0.13
68 0.15
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.15
73 0.15
74 0.19
75 0.24
76 0.3
77 0.38
78 0.47
79 0.48
80 0.47
81 0.49
82 0.47
83 0.44
84 0.39
85 0.32
86 0.29
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.13
96 0.19
97 0.26
98 0.36
99 0.45
100 0.54
101 0.65
102 0.74
103 0.79
104 0.8
105 0.77
106 0.73
107 0.75
108 0.74
109 0.71
110 0.72
111 0.69
112 0.66
113 0.71
114 0.68
115 0.6
116 0.55
117 0.49
118 0.44
119 0.48
120 0.49
121 0.45
122 0.43
123 0.46
124 0.49
125 0.54
126 0.52
127 0.44
128 0.42
129 0.41
130 0.44
131 0.41
132 0.34
133 0.3
134 0.34
135 0.35
136 0.32
137 0.3
138 0.26
139 0.25
140 0.25
141 0.27
142 0.2
143 0.19
144 0.2
145 0.19
146 0.17
147 0.17
148 0.21
149 0.19
150 0.2
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.21
155 0.22
156 0.19
157 0.17
158 0.15
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.2
175 0.27
176 0.27
177 0.29
178 0.29
179 0.3
180 0.34
181 0.31
182 0.28
183 0.22
184 0.23
185 0.2
186 0.19
187 0.15
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.18
204 0.21
205 0.28
206 0.29
207 0.31
208 0.35
209 0.41
210 0.48
211 0.53
212 0.59
213 0.59
214 0.64
215 0.65
216 0.62
217 0.64
218 0.56
219 0.48
220 0.38
221 0.31
222 0.26
223 0.25
224 0.21
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.18
246 0.19
247 0.18
248 0.2
249 0.2
250 0.18
251 0.21
252 0.23
253 0.24
254 0.25
255 0.27
256 0.25
257 0.27
258 0.34
259 0.37
260 0.44
261 0.5
262 0.53
263 0.58
264 0.6
265 0.62
266 0.54
267 0.48
268 0.4
269 0.37
270 0.34
271 0.34
272 0.33
273 0.33
274 0.32
275 0.35
276 0.39
277 0.36
278 0.38
279 0.37
280 0.44
281 0.41
282 0.47
283 0.49
284 0.44
285 0.41
286 0.42
287 0.36
288 0.26
289 0.28
290 0.22
291 0.18
292 0.2
293 0.19
294 0.16
295 0.19
296 0.18
297 0.17
298 0.19
299 0.19
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.09
310 0.12
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.2
315 0.21
316 0.22
317 0.25
318 0.24
319 0.2
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.19
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.12
346 0.15
347 0.16
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.15
352 0.15
353 0.1
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.13
382 0.12
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.13
396 0.17
397 0.17
398 0.24
399 0.25
400 0.28
401 0.32
402 0.41
403 0.45
404 0.52
405 0.58
406 0.57
407 0.64
408 0.68
409 0.72
410 0.72
411 0.69
412 0.68
413 0.69
414 0.69
415 0.66
416 0.68
417 0.66
418 0.66
419 0.68
420 0.61
421 0.55
422 0.51
423 0.55
424 0.53
425 0.52
426 0.51
427 0.5
428 0.53
429 0.6
430 0.68
431 0.7
432 0.72
433 0.74
434 0.75
435 0.7
436 0.66
437 0.58
438 0.5
439 0.46
440 0.38
441 0.27
442 0.19
443 0.16
444 0.16
445 0.14
446 0.13
447 0.07
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.12
461 0.13
462 0.15
463 0.2
464 0.26
465 0.26
466 0.3
467 0.31
468 0.28
469 0.31
470 0.3
471 0.25
472 0.22
473 0.22
474 0.19
475 0.19
476 0.19
477 0.16
478 0.15
479 0.14
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.12
485 0.15
486 0.15
487 0.16
488 0.16
489 0.15
490 0.15
491 0.12
492 0.1
493 0.07
494 0.09
495 0.09
496 0.13
497 0.13
498 0.14
499 0.17
500 0.18
501 0.2
502 0.21
503 0.26
504 0.24
505 0.24
506 0.23
507 0.2
508 0.2
509 0.18
510 0.15
511 0.1
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.11
532 0.13
533 0.13
534 0.16
535 0.16
536 0.18
537 0.19
538 0.19
539 0.16
540 0.17
541 0.21
542 0.23
543 0.21
544 0.2
545 0.19
546 0.18
547 0.17
548 0.15
549 0.1
550 0.05
551 0.06
552 0.05
553 0.07
554 0.07
555 0.08
556 0.08
557 0.13
558 0.14
559 0.14
560 0.16
561 0.18
562 0.23
563 0.25
564 0.29
565 0.28
566 0.32
567 0.36
568 0.37
569 0.4
570 0.4
571 0.42
572 0.47
573 0.46
574 0.41
575 0.38
576 0.36
577 0.31
578 0.25
579 0.2
580 0.12
581 0.1
582 0.12
583 0.15
584 0.14
585 0.13
586 0.14
587 0.18
588 0.19
589 0.19
590 0.17
591 0.15
592 0.15
593 0.19
594 0.2
595 0.19
596 0.18
597 0.18
598 0.26
599 0.25
600 0.27
601 0.26
602 0.25
603 0.28
604 0.29
605 0.29
606 0.22
607 0.24
608 0.22
609 0.2
610 0.18
611 0.12
612 0.11
613 0.09
614 0.08
615 0.06
616 0.06
617 0.04
618 0.05
619 0.05
620 0.08
621 0.09
622 0.1
623 0.1
624 0.1
625 0.11
626 0.16
627 0.19
628 0.18
629 0.22
630 0.25
631 0.3
632 0.35
633 0.38
634 0.36
635 0.33
636 0.33
637 0.31
638 0.3
639 0.25
640 0.21
641 0.17
642 0.14
643 0.13
644 0.12
645 0.09
646 0.07
647 0.08
648 0.06
649 0.07
650 0.07
651 0.07
652 0.06
653 0.07
654 0.08
655 0.08
656 0.1
657 0.16
658 0.2
659 0.2
660 0.24
661 0.24
662 0.24
663 0.22
664 0.2
665 0.15
666 0.13
667 0.12
668 0.09
669 0.08
670 0.08
671 0.11
672 0.11
673 0.1
674 0.09
675 0.11
676 0.11
677 0.13
678 0.16
679 0.21
680 0.21
681 0.21
682 0.23
683 0.24
684 0.3
685 0.31
686 0.28
687 0.21
688 0.23
689 0.22
690 0.19
691 0.16
692 0.11
693 0.1
694 0.1
695 0.1
696 0.09
697 0.09
698 0.1
699 0.09
700 0.09
701 0.1
702 0.14
703 0.14
704 0.14
705 0.16
706 0.15
707 0.17
708 0.18
709 0.17
710 0.15
711 0.14
712 0.14
713 0.16
714 0.17
715 0.15
716 0.14
717 0.13
718 0.11
719 0.11
720 0.1
721 0.06
722 0.05
723 0.07
724 0.08
725 0.09
726 0.1
727 0.11
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.1
732 0.09
733 0.09
734 0.09
735 0.11
736 0.11
737 0.12
738 0.15
739 0.2
740 0.22
741 0.24
742 0.26
743 0.29
744 0.29
745 0.33
746 0.32
747 0.28
748 0.27
749 0.26
750 0.24
751 0.21
752 0.19
753 0.14
754 0.19
755 0.17
756 0.16
757 0.17
758 0.16
759 0.16
760 0.17
761 0.19
762 0.14
763 0.17
764 0.17
765 0.18
766 0.18
767 0.16
768 0.2
769 0.19
770 0.21
771 0.22
772 0.28
773 0.33
774 0.4
775 0.46
776 0.45
777 0.52
778 0.51
779 0.47
780 0.41
781 0.35
782 0.28
783 0.22
784 0.17
785 0.1
786 0.07
787 0.07
788 0.06
789 0.07
790 0.06
791 0.04
792 0.04
793 0.06
794 0.06
795 0.06
796 0.12
797 0.17
798 0.18
799 0.19
800 0.19
801 0.18
802 0.2
803 0.21
804 0.17
805 0.12
806 0.12
807 0.15
808 0.14
809 0.13
810 0.12
811 0.11
812 0.1
813 0.11
814 0.11
815 0.07
816 0.07
817 0.08
818 0.08
819 0.09
820 0.09
821 0.08
822 0.08
823 0.09
824 0.1
825 0.11
826 0.11
827 0.1
828 0.13
829 0.16
830 0.2
831 0.25
832 0.26
833 0.24
834 0.28
835 0.3
836 0.33
837 0.38
838 0.35
839 0.3
840 0.33
841 0.36
842 0.35
843 0.34
844 0.28
845 0.22
846 0.27
847 0.27
848 0.26
849 0.29
850 0.27
851 0.29
852 0.32
853 0.31
854 0.26
855 0.28
856 0.3
857 0.31
858 0.39
859 0.39
860 0.41
861 0.45
862 0.5
863 0.5
864 0.48
865 0.42
866 0.37
867 0.34
868 0.3
869 0.31
870 0.27
871 0.25
872 0.23
873 0.24
874 0.24
875 0.24
876 0.24
877 0.23
878 0.27
879 0.27
880 0.32
881 0.34
882 0.38
883 0.4
884 0.43
885 0.45
886 0.46
887 0.5
888 0.45
889 0.46
890 0.41
891 0.39
892 0.39
893 0.36
894 0.39
895 0.36
896 0.39
897 0.37
898 0.39
899 0.38
900 0.34
901 0.32
902 0.24
903 0.26
904 0.2
905 0.25
906 0.21
907 0.2
908 0.19
909 0.18
910 0.18
911 0.15
912 0.14
913 0.09
914 0.09
915 0.09
916 0.09
917 0.1
918 0.12
919 0.13
920 0.14
921 0.15
922 0.18
923 0.18
924 0.18
925 0.18
926 0.16
927 0.18
928 0.18
929 0.17
930 0.17
931 0.22
932 0.26
933 0.31
934 0.36
935 0.37
936 0.39
937 0.41
938 0.47
939 0.48
940 0.53
941 0.54
942 0.56
943 0.59
944 0.62
945 0.62
946 0.6
947 0.64
948 0.62
949 0.57
950 0.53
951 0.54
952 0.59
953 0.6
954 0.6
955 0.55
956 0.52
957 0.51
958 0.5
959 0.43
960 0.37
961 0.37
962 0.37
963 0.38
964 0.4
965 0.45
966 0.44
967 0.49
968 0.47
969 0.44
970 0.4
971 0.4
972 0.35
973 0.31
974 0.36
975 0.37
976 0.4
977 0.4
978 0.37
979 0.31
980 0.33
981 0.37
982 0.36
983 0.37
984 0.33
985 0.33
986 0.4
987 0.41
988 0.39
989 0.38
990 0.32
991 0.28
992 0.34
993 0.42
994 0.41
995 0.46
996 0.49
997 0.46
998 0.49
999 0.51
1000 0.52
1001 0.52
1002 0.53
1003 0.53
1004 0.58
1005 0.63
1006 0.63
1007 0.63
1008 0.58
1009 0.56
1010 0.55
1011 0.49
1012 0.42
1013 0.34
1014 0.32