FuNGI

W6PYY9

Protein Details

Accession

W6PYY9

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
338-357	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
451-474	NTSGQAKRHGAKHKRGRNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
342-347	RRKKRK
457-467	KRHGAKHKRGR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKQWIDKKNASKFQLFHRSQNDPLIHDTSAEDRFLYQVGGPAPAPSSNTSKKTLPNLSDLQSEYGDSARKNEGEAANYGVYYDDSSYDYMQHLRELGSGSGDAYFVEAKNEKAKGRAGRGMKLEDALRQVSLVDKDTYGSGASVGPSLYGSQYGDMRSTTSSFIRKPTYQDQQNVPDAIAGFKPDMDPRLREALEALEDEAFVEDGDADGIFGELTANAEEMDEGDWEDSLFDDEVDDEGWESDATEKAPVQPDSTEAHRSMENELPEESVKPPMDAGEMPEPDKPAPDMQPTDQSWMSEFAKFKKDAKAGNAPTPAAPTIAASQTMASTTFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTAGHRLLDDRFDKVEQLYALDEEDEFDDSMSMISGMTGATGMTGMTGMSTTSSIAPSLIDGNGEAVHSSSTFNNVMDDFLSSWDPNTSGQAKRHGAKHKRGRNGNEAIGIRMLDEVRSGLGPARLQGVKGKVSGKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.71
3	0.72
4	0.65
5	0.63
6	0.62
7	0.62
8	0.58
9	0.64
10	0.56
11	0.48
12	0.49
13	0.45
14	0.37
15	0.32
16	0.3
17	0.26
18	0.26
19	0.23
20	0.19
21	0.15
22	0.16
23	0.16
24	0.15
25	0.11
26	0.13
27	0.13
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.16
32	0.16
33	0.18
34	0.17
35	0.24
36	0.29
37	0.33
38	0.37
39	0.39
40	0.44
41	0.51
42	0.56
43	0.51
44	0.5
45	0.51
46	0.5
47	0.5
48	0.46
49	0.4
50	0.32
51	0.29
52	0.23
53	0.2
54	0.2
55	0.16
56	0.18
57	0.2
58	0.2
59	0.21
60	0.26
61	0.26
62	0.26
63	0.27
64	0.27
65	0.23
66	0.23
67	0.22
68	0.16
69	0.13
70	0.12
71	0.11
72	0.08
73	0.09
74	0.11
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.15
79	0.15
80	0.15
81	0.14
82	0.14
83	0.15
84	0.15
85	0.14
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.11
90	0.1
91	0.08
92	0.08
93	0.09
94	0.07
95	0.11
96	0.12
97	0.13
98	0.19
99	0.22
100	0.22
101	0.24
102	0.31
103	0.33
104	0.38
105	0.44
106	0.42
107	0.44
108	0.47
109	0.47
110	0.42
111	0.38
112	0.33
113	0.28
114	0.27
115	0.23
116	0.18
117	0.15
118	0.14
119	0.15
120	0.16
121	0.16
122	0.13
123	0.13
124	0.13
125	0.13
126	0.14
127	0.11
128	0.09
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.06
135	0.06
136	0.07
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.09
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.13
149	0.15
150	0.18
151	0.19
152	0.24
153	0.28
154	0.28
155	0.33
156	0.39
157	0.45
158	0.47
159	0.51
160	0.52
161	0.52
162	0.54
163	0.48
164	0.41
165	0.32
166	0.26
167	0.22
168	0.16
169	0.11
170	0.08
171	0.08
172	0.09
173	0.09
174	0.12
175	0.13
176	0.14
177	0.16
178	0.23
179	0.22
180	0.21
181	0.21
182	0.19
183	0.18
184	0.16
185	0.14
186	0.08
187	0.07
188	0.08
189	0.07
190	0.06
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.02
201	0.02
202	0.03
203	0.02
204	0.03
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.08
238	0.11
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.14
243	0.15
244	0.17
245	0.18
246	0.15
247	0.16
248	0.16
249	0.17
250	0.18
251	0.19
252	0.17
253	0.15
254	0.15
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.12
259	0.13
260	0.13
261	0.12
262	0.11
263	0.11
264	0.12
265	0.11
266	0.13
267	0.14
268	0.15
269	0.16
270	0.17
271	0.18
272	0.16
273	0.17
274	0.15
275	0.12
276	0.13
277	0.16
278	0.17
279	0.18
280	0.24
281	0.24
282	0.27
283	0.25
284	0.23
285	0.2
286	0.22
287	0.22
288	0.19
289	0.2
290	0.19
291	0.25
292	0.26
293	0.28
294	0.32
295	0.34
296	0.34
297	0.38
298	0.45
299	0.42
300	0.47
301	0.46
302	0.39
303	0.35
304	0.33
305	0.28
306	0.18
307	0.15
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.08
324	0.11
325	0.15
326	0.22
327	0.3
328	0.4
329	0.47
330	0.51
331	0.6
332	0.67
333	0.73
334	0.75
335	0.78
336	0.78
337	0.79
338	0.81
339	0.72
340	0.64
341	0.54
342	0.43
343	0.34
344	0.25
345	0.17
346	0.13
347	0.12
348	0.1
349	0.11
350	0.11
351	0.1
352	0.11
353	0.14
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.16
358	0.18
359	0.24
360	0.23
361	0.22
362	0.22
363	0.22
364	0.23
365	0.21
366	0.21
367	0.15
368	0.15
369	0.14
370	0.12
371	0.12
372	0.11
373	0.11
374	0.08
375	0.09
376	0.09
377	0.08
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.05
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.05
402	0.05
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.08
409	0.1
410	0.09
411	0.08
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.09
421	0.08
422	0.12
423	0.13
424	0.13
425	0.15
426	0.14
427	0.15
428	0.13
429	0.15
430	0.11
431	0.12
432	0.14
433	0.13
434	0.13
435	0.14
436	0.14
437	0.13
438	0.19
439	0.22
440	0.25
441	0.3
442	0.38
443	0.43
444	0.48
445	0.55
446	0.6
447	0.65
448	0.7
449	0.76
450	0.77
451	0.81
452	0.85
453	0.84
454	0.83
455	0.81
456	0.75
457	0.72
458	0.63
459	0.55
460	0.47
461	0.39
462	0.3
463	0.24
464	0.2
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.1
469	0.11
470	0.11
471	0.12
472	0.15
473	0.16
474	0.16
475	0.22
476	0.21
477	0.22
478	0.28
479	0.3
480	0.3
481	0.34

W6PYY9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer