FuNGI

W6QTJ0

Protein Details

Accession

W6QTJ0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
310-332	SSTSNEPKKKKTLRNQPPPGKDI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
271-292	RGRGNNRGGGRGGRGGKRGGKG
318-319	KK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MADSGVDSGDDNPNNQSQFLPSGNNNASREIGNTSQPQANTMSSGNGYNEKNQATNLPDISAAKMQKVKALEYNSRNPRGWAIPVKFALAPLRLEYVIDSSMPRPTVGDPKFDRWEYWSRTVASWLYVQVDDTLQERIQNLSYLPEFADTMFDEIMLMVQGSDKAENALNETKKFDEMKRADFNTAKEFIAEYQKQYHVLSRFKIQPHPFHALSQVLRQLDKEISKVQFIIEEISNIEPKKITLEKMDQYCKSLQAVSDREGTANAAQSSRGRGNNRGGGRGGRGGKRGGKGGNSEASSSQDNKSSKDDSSTSNEPKKKKTLRNQPPPGKDIHEYVKEKKEGTQRDESGMCAYCGFGPHKAQKCSYLSEDPPAHWTHSPHVWNYSIALRSEGRSNMAITATARHTDSFNSWLIDTGSDKTLTHDFEDFYTYQEDSPESAYAYRDYSGNRVVTEGHGEVLVKAGLEDGTTYTFLTKGYYSPRGHGKLFGMQKLLEEQDISYDTRTKRLTDGTGKTVGVANTSLGVPYLIGPKEDDSHEEDSSYGSDSDEETGLVNKISAFEAHRRFGHAGKAKLTSTLKQAQELDDEEQYGTEYFDCEACFQGKSKKQISREPQFRVQDVAWKFHVDTQPMKPEGPNGEKYWMPILDDATRYLEGPTLTNKGEAFVKLQAFCEKIKLRTGRYPGIWRLDGGTEFKNFITWGTKKGMTFEVTPPYTAEPNGAVERFGGYVNDIQRTMIIDTKLPEELWPYAVETAIYTINRLTNPKSQTSPLKHWRTELGIDNPDPSLKHLRPWGTTVYVHIPKEKRVQARKAAPRSWKGHLMGYEGDNGHILKIWNPETRKITISRDVSFPQPGDEDQEGGVPVAPKPSKPPGDDDTNEISIPLIDAARTEPRTEIVTVYRQDPVTPSTIHLPTIQGSVSTIPETPVMPRRQRLLPAPRHTRSILGRLQRGTPIPKNTEQLTAQRVNQTLTPIQEETQTVHSENATPQTEQITMTEKLAERKANFQRRLEELTARINAEEMDMLEVHQYADSIEQDLIRETSSPRESTPREDTPSPEQTRTEYQFAVTRLQHRLATPTFSDLEAMRHVVKYLRHNPKTGLIFGKSDELQFIAFTDASHADWTDSKSTEGCIWFFAGVPVAWSTKKQTITANSTTIAEWCALDQPARDAMWLAKVADSLSLPRPDPTVIYTDNINSQLLLTKKGGKSATRWLALRWFFVKDAVAQGHINILRVDTKQNAADGFTKALPKEQFRAFLKLIGMT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.26
3	0.24
4	0.21
5	0.24
6	0.25
7	0.27
8	0.24
9	0.32
10	0.36
11	0.42
12	0.41
13	0.39
14	0.38
15	0.34
16	0.34
17	0.3
18	0.29
19	0.27
20	0.3
21	0.32
22	0.34
23	0.33
24	0.34
25	0.31
26	0.29
27	0.26
28	0.23
29	0.22
30	0.19
31	0.21
32	0.22
33	0.25
34	0.26
35	0.28
36	0.32
37	0.31
38	0.31
39	0.3
40	0.32
41	0.3
42	0.33
43	0.3
44	0.25
45	0.25
46	0.25
47	0.28
48	0.29
49	0.26
50	0.26
51	0.3
52	0.29
53	0.32
54	0.33
55	0.33
56	0.34
57	0.4
58	0.44
59	0.47
60	0.57
61	0.62
62	0.66
63	0.63
64	0.58
65	0.56
66	0.51
67	0.51
68	0.51
69	0.46
70	0.47
71	0.47
72	0.48
73	0.43
74	0.41
75	0.37
76	0.3
77	0.28
78	0.22
79	0.24
80	0.21
81	0.21
82	0.2
83	0.18
84	0.16
85	0.15
86	0.16
87	0.14
88	0.18
89	0.18
90	0.17
91	0.16
92	0.19
93	0.28
94	0.28
95	0.36
96	0.37
97	0.44
98	0.51
99	0.5
100	0.48
101	0.44
102	0.52
103	0.5
104	0.51
105	0.49
106	0.45
107	0.45
108	0.47
109	0.42
110	0.35
111	0.29
112	0.24
113	0.22
114	0.2
115	0.19
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.14
120	0.15
121	0.13
122	0.15
123	0.15
124	0.16
125	0.16
126	0.17
127	0.16
128	0.17
129	0.18
130	0.17
131	0.17
132	0.15
133	0.15
134	0.13
135	0.15
136	0.11
137	0.13
138	0.11
139	0.11
140	0.1
141	0.09
142	0.09
143	0.07
144	0.06
145	0.04
146	0.05
147	0.06
148	0.07
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.12
153	0.12
154	0.17
155	0.23
156	0.26
157	0.27
158	0.3
159	0.3
160	0.32
161	0.35
162	0.33
163	0.36
164	0.37
165	0.43
166	0.49
167	0.5
168	0.51
169	0.51
170	0.52
171	0.47
172	0.45
173	0.37
174	0.29
175	0.27
176	0.24
177	0.31
178	0.29
179	0.26
180	0.29
181	0.31
182	0.32
183	0.32
184	0.36
185	0.33
186	0.37
187	0.37
188	0.39
189	0.44
190	0.46
191	0.54
192	0.53
193	0.55
194	0.56
195	0.61
196	0.54
197	0.49
198	0.48
199	0.44
200	0.4
201	0.36
202	0.35
203	0.29
204	0.29
205	0.28
206	0.27
207	0.27
208	0.27
209	0.25
210	0.26
211	0.26
212	0.27
213	0.27
214	0.24
215	0.21
216	0.2
217	0.21
218	0.15
219	0.14
220	0.14
221	0.15
222	0.19
223	0.17
224	0.17
225	0.14
226	0.14
227	0.19
228	0.21
229	0.21
230	0.24
231	0.31
232	0.37
233	0.44
234	0.51
235	0.46
236	0.47
237	0.47
238	0.42
239	0.36
240	0.31
241	0.26
242	0.26
243	0.29
244	0.28
245	0.31
246	0.29
247	0.28
248	0.26
249	0.26
250	0.2
251	0.2
252	0.18
253	0.14
254	0.15
255	0.16
256	0.21
257	0.24
258	0.29
259	0.28
260	0.33
261	0.4
262	0.46
263	0.47
264	0.45
265	0.42
266	0.38
267	0.37
268	0.38
269	0.37
270	0.33
271	0.34
272	0.36
273	0.39
274	0.39
275	0.41
276	0.37
277	0.34
278	0.34
279	0.36
280	0.37
281	0.32
282	0.31
283	0.27
284	0.28
285	0.27
286	0.26
287	0.23
288	0.24
289	0.24
290	0.25
291	0.29
292	0.29
293	0.27
294	0.29
295	0.3
296	0.27
297	0.33
298	0.39
299	0.42
300	0.48
301	0.53
302	0.53
303	0.57
304	0.63
305	0.66
306	0.68
307	0.71
308	0.74
309	0.79
310	0.86
311	0.91
312	0.9
313	0.86
314	0.79
315	0.71
316	0.65
317	0.56
318	0.49
319	0.44
320	0.44
321	0.42
322	0.46
323	0.5
324	0.48
325	0.46
326	0.48
327	0.5
328	0.49
329	0.51
330	0.54
331	0.47
332	0.49
333	0.49
334	0.43
335	0.38
336	0.32
337	0.26
338	0.16
339	0.15
340	0.12
341	0.14
342	0.15
343	0.14
344	0.19
345	0.27
346	0.35
347	0.37
348	0.38
349	0.42
350	0.43
351	0.44
352	0.44
353	0.41
354	0.35
355	0.4
356	0.4
357	0.34
358	0.35
359	0.32
360	0.29
361	0.25
362	0.26
363	0.22
364	0.28
365	0.29
366	0.27
367	0.29
368	0.28
369	0.26
370	0.26
371	0.26
372	0.21
373	0.19
374	0.2
375	0.18
376	0.18
377	0.21
378	0.2
379	0.18
380	0.16
381	0.17
382	0.15
383	0.15
384	0.14
385	0.11
386	0.14
387	0.13
388	0.13
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.14
393	0.15
394	0.15
395	0.15
396	0.15
397	0.14
398	0.15
399	0.15
400	0.14
401	0.13
402	0.12
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.13
407	0.16
408	0.16
409	0.16
410	0.16
411	0.15
412	0.15
413	0.18
414	0.16
415	0.15
416	0.15
417	0.14
418	0.13
419	0.13
420	0.13
421	0.1
422	0.11
423	0.1
424	0.09
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.14
433	0.17
434	0.17
435	0.16
436	0.16
437	0.16
438	0.15
439	0.17
440	0.15
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.08
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.07
460	0.08
461	0.07
462	0.08
463	0.13
464	0.21
465	0.22
466	0.25
467	0.33
468	0.35
469	0.35
470	0.36
471	0.32
472	0.32
473	0.34
474	0.33
475	0.27
476	0.23
477	0.23
478	0.23
479	0.21
480	0.14
481	0.11
482	0.09
483	0.09
484	0.11
485	0.11
486	0.09
487	0.14
488	0.14
489	0.19
490	0.2
491	0.2
492	0.2
493	0.23
494	0.27
495	0.3
496	0.33
497	0.32
498	0.33
499	0.32
500	0.3
501	0.3
502	0.24
503	0.17
504	0.14
505	0.1
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.05
510	0.05
511	0.04
512	0.05
513	0.09
514	0.08
515	0.09
516	0.09
517	0.1
518	0.12
519	0.13
520	0.14
521	0.14
522	0.17
523	0.17
524	0.17
525	0.16
526	0.15
527	0.15
528	0.14
529	0.09
530	0.06
531	0.06
532	0.07
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.06
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.06
541	0.05
542	0.06
543	0.06
544	0.07
545	0.08
546	0.15
547	0.18
548	0.21
549	0.21
550	0.23
551	0.24
552	0.25
553	0.31
554	0.3
555	0.29
556	0.29
557	0.32
558	0.29
559	0.33
560	0.33
561	0.26
562	0.25
563	0.3
564	0.28
565	0.28
566	0.29
567	0.24
568	0.25
569	0.25
570	0.21
571	0.14
572	0.14
573	0.11
574	0.1
575	0.1
576	0.08
577	0.07
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.08
586	0.08
587	0.09
588	0.16
589	0.2
590	0.26
591	0.33
592	0.37
593	0.41
594	0.49
595	0.56
596	0.59
597	0.62
598	0.61
599	0.62
600	0.59
601	0.54
602	0.49
603	0.4
604	0.37
605	0.31
606	0.29
607	0.22
608	0.2
609	0.2
610	0.22
611	0.24
612	0.19
613	0.21
614	0.21
615	0.27
616	0.27
617	0.27
618	0.22
619	0.23
620	0.26
621	0.27
622	0.26
623	0.21
624	0.23
625	0.22
626	0.23
627	0.23
628	0.18
629	0.14
630	0.12
631	0.13
632	0.13
633	0.13
634	0.13
635	0.12
636	0.12
637	0.12
638	0.11
639	0.11
640	0.09
641	0.09
642	0.11
643	0.12
644	0.12
645	0.12
646	0.12
647	0.11
648	0.12
649	0.12
650	0.12
651	0.12
652	0.14
653	0.13
654	0.15
655	0.15
656	0.16
657	0.16
658	0.2
659	0.19
660	0.19
661	0.26
662	0.29
663	0.3
664	0.35
665	0.4
666	0.37
667	0.38
668	0.41
669	0.39
670	0.39
671	0.36
672	0.3
673	0.26
674	0.23
675	0.21
676	0.18
677	0.16
678	0.12
679	0.13
680	0.13
681	0.12
682	0.11
683	0.11
684	0.14
685	0.13
686	0.16
687	0.19
688	0.21
689	0.21
690	0.23
691	0.25
692	0.2
693	0.22
694	0.22
695	0.25
696	0.23
697	0.23
698	0.21
699	0.21
700	0.19
701	0.17
702	0.14
703	0.09
704	0.11
705	0.12
706	0.11
707	0.1
708	0.09
709	0.1
710	0.09
711	0.09
712	0.07
713	0.06
714	0.09
715	0.11
716	0.12
717	0.12
718	0.11
719	0.11
720	0.12
721	0.12
722	0.12
723	0.11
724	0.11
725	0.12
726	0.14
727	0.14
728	0.12
729	0.12
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.1
734	0.1
735	0.09
736	0.09
737	0.09
738	0.07
739	0.07
740	0.08
741	0.08
742	0.07
743	0.08
744	0.1
745	0.11
746	0.13
747	0.15
748	0.2
749	0.23
750	0.26
751	0.27
752	0.29
753	0.37
754	0.41
755	0.47
756	0.5
757	0.55
758	0.53
759	0.52
760	0.51
761	0.46
762	0.43
763	0.39
764	0.34
765	0.3
766	0.3
767	0.29
768	0.26
769	0.24
770	0.21
771	0.18
772	0.21
773	0.18
774	0.21
775	0.25
776	0.28
777	0.29
778	0.31
779	0.31
780	0.26
781	0.26
782	0.25
783	0.28
784	0.3
785	0.29
786	0.32
787	0.31
788	0.32
789	0.4
790	0.43
791	0.45
792	0.48
793	0.55
794	0.58
795	0.66
796	0.71
797	0.72
798	0.72
799	0.7
800	0.7
801	0.67
802	0.62
803	0.59
804	0.51
805	0.47
806	0.41
807	0.37
808	0.31
809	0.28
810	0.27
811	0.2
812	0.19
813	0.16
814	0.15
815	0.11
816	0.11
817	0.1
818	0.1
819	0.14
820	0.18
821	0.22
822	0.24
823	0.3
824	0.32
825	0.34
826	0.34
827	0.33
828	0.34
829	0.37
830	0.39
831	0.36
832	0.35
833	0.34
834	0.34
835	0.33
836	0.28
837	0.21
838	0.19
839	0.17
840	0.19
841	0.17
842	0.16
843	0.13
844	0.14
845	0.13
846	0.11
847	0.12
848	0.08
849	0.08
850	0.14
851	0.14
852	0.14
853	0.18
854	0.26
855	0.3
856	0.31
857	0.37
858	0.35
859	0.43
860	0.43
861	0.43
862	0.4
863	0.37
864	0.35
865	0.29
866	0.24
867	0.16
868	0.15
869	0.11
870	0.06
871	0.04
872	0.05
873	0.07
874	0.13
875	0.14
876	0.15
877	0.14
878	0.16
879	0.18
880	0.18
881	0.18
882	0.16
883	0.21
884	0.21
885	0.23
886	0.25
887	0.22
888	0.22
889	0.22
890	0.21
891	0.18
892	0.17
893	0.17
894	0.2
895	0.2
896	0.21
897	0.2
898	0.19
899	0.17
900	0.17
901	0.16
902	0.1
903	0.1
904	0.1
905	0.11
906	0.1
907	0.1
908	0.09
909	0.1
910	0.11
911	0.13
912	0.2
913	0.26
914	0.3
915	0.33
916	0.37
917	0.4
918	0.44
919	0.5
920	0.52
921	0.55
922	0.6
923	0.67
924	0.65
925	0.65
926	0.61
927	0.58
928	0.51
929	0.48
930	0.45
931	0.42
932	0.45
933	0.42
934	0.44
935	0.41
936	0.42
937	0.41
938	0.41
939	0.42
940	0.42
941	0.44
942	0.46
943	0.44
944	0.45
945	0.41
946	0.39
947	0.39
948	0.37
949	0.36
950	0.37
951	0.36
952	0.32
953	0.31
954	0.3
955	0.26
956	0.23
957	0.25
958	0.21
959	0.21
960	0.22
961	0.21
962	0.19
963	0.2
964	0.2
965	0.17
966	0.17
967	0.17
968	0.17
969	0.18
970	0.22
971	0.2
972	0.19
973	0.19
974	0.2
975	0.2
976	0.19
977	0.18
978	0.17
979	0.16
980	0.16
981	0.2
982	0.19
983	0.23
984	0.27
985	0.31
986	0.27
987	0.36
988	0.46
989	0.52
990	0.56
991	0.56
992	0.57
993	0.57
994	0.62
995	0.56
996	0.5
997	0.42
998	0.42
999	0.41
1000	0.36
1001	0.31
1002	0.24
1003	0.21
1004	0.17
1005	0.15
1006	0.09
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.08
1013	0.07
1014	0.07
1015	0.06
1016	0.08
1017	0.08
1018	0.09
1019	0.09
1020	0.09
1021	0.1
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.1
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.18
1028	0.21
1029	0.22
1030	0.22
1031	0.3
1032	0.32
1033	0.38
1034	0.45
1035	0.44
1036	0.46
1037	0.47
1038	0.5
1039	0.49
1040	0.57
1041	0.55
1042	0.49
1043	0.44
1044	0.42
1045	0.48
1046	0.48
1047	0.44
1048	0.34
1049	0.32
1050	0.34
1051	0.35
1052	0.37
1053	0.32
1054	0.33
1055	0.34
1056	0.36
1057	0.37
1058	0.33
1059	0.38
1060	0.33
1061	0.34
1062	0.3
1063	0.29
1064	0.27
1065	0.25
1066	0.25
1067	0.19
1068	0.2
1069	0.18
1070	0.19
1071	0.17
1072	0.16
1073	0.17
1074	0.19
1075	0.23
1076	0.31
1077	0.39
1078	0.48
1079	0.5
1080	0.53
1081	0.55
1082	0.59
1083	0.59
1084	0.54
1085	0.49
1086	0.4
1087	0.38
1088	0.37
1089	0.39
1090	0.31
1091	0.27
1092	0.23
1093	0.18
1094	0.15
1095	0.14
1096	0.13
1097	0.11
1098	0.1
1099	0.1
1100	0.12
1101	0.12
1102	0.13
1103	0.14
1104	0.13
1105	0.12
1106	0.15
1107	0.18
1108	0.19
1109	0.19
1110	0.2
1111	0.19
1112	0.21
1113	0.24
1114	0.24
1115	0.21
1116	0.18
1117	0.19
1118	0.17
1119	0.17
1120	0.16
1121	0.13
1122	0.11
1123	0.12
1124	0.12
1125	0.13
1126	0.14
1127	0.15
1128	0.2
1129	0.25
1130	0.28
1131	0.29
1132	0.34
1133	0.4
1134	0.47
1135	0.5
1136	0.47
1137	0.42
1138	0.4
1139	0.38
1140	0.32
1141	0.24
1142	0.17
1143	0.13
1144	0.11
1145	0.13
1146	0.13
1147	0.14
1148	0.14
1149	0.16
1150	0.19
1151	0.19
1152	0.18
1153	0.16
1154	0.17
1155	0.2
1156	0.21
1157	0.19
1158	0.16
1159	0.17
1160	0.17
1161	0.17
1162	0.17
1163	0.15
1164	0.2
1165	0.23
1166	0.23
1167	0.24
1168	0.25
1169	0.24
1170	0.25
1171	0.24
1172	0.23
1173	0.21
1174	0.22
1175	0.23
1176	0.23
1177	0.26
1178	0.26
1179	0.24
1180	0.18
1181	0.17
1182	0.21
1183	0.2
1184	0.22
1185	0.21
1186	0.28
1187	0.29
1188	0.35
1189	0.39
1190	0.37
1191	0.4
1192	0.47
1193	0.53
1194	0.5
1195	0.5
1196	0.47
1197	0.52
1198	0.51
1199	0.51
1200	0.43
1201	0.38
1202	0.33
1203	0.34
1204	0.32
1205	0.25
1206	0.29
1207	0.25
1208	0.25
1209	0.22
1210	0.22
1211	0.27
1212	0.26
1213	0.26
1214	0.2
1215	0.19
1216	0.2
1217	0.22
1218	0.26
1219	0.22
1220	0.25
1221	0.26
1222	0.28
1223	0.27
1224	0.26
1225	0.28
1226	0.26
1227	0.26
1228	0.25
1229	0.28
1230	0.26
1231	0.32
1232	0.35
1233	0.37
1234	0.41
1235	0.42
1236	0.48
1237	0.48
1238	0.55
1239	0.49
1240	0.48

W6QTJ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer