FuNGI

C1H3C8

Protein Details

Accession

C1H3C8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
63-88	VNGANNRQQTRPRKEPQKPGDPATRL	Hydrophilic
404-423	DPLHRSKPPSPKTRRRTVAE	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12.5, nucl 11, cyto_mito 8, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
KEGG	pbl:PAAG_05271 -
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20
CDD	cd22265 UDM1_RNF168

Amino Acid Sequences

MATAVSTKPPLHKIKRPAPSYIQTGLNGMRTSQPSPSPLGSATNRFSGAKQPGAVTPTSAAIVNGANNRQQTRPRKEPQKPGDPATRLQRPPTKPPGMDGPVADCRQLKKFPEPYVKTTSYILKKYSKSPPSLTIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKVIIEHIKAGTVPHDMIEELVKGGVRFYENCLIVRVVDHKSVSSQPHPASNSSSGEKTSPFSLHNYNQHVTPSPFVPYPQQNQSSVNATTNGTSTNSQRADEQSSTEANNGPSESNANTTDSGTSKQKAPKPRIFTTVLHPTPQSLLAELTLLSMTPDPRAVNRRQSQVYSTLRTGSIPQPPTPLSALPSSPVTDRAPPVKRQKMMVEPSELLEAEAKLIHATAPPLYLEPVDGLAASANLLRFLEDPLHRSKPPSPKTRRRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLGPTTSGNGGGAKAPNVDDESGAAPFEPRFSRFKTLEKIRLEHEEKAKLEHEKKLQQDHAKRLQQEAEREKRRANEQRLAEEQSREDNRRQQAAAAAAATAAAAAAAAAAQHAQVQAQVAAAAAQNRRPQSRGNPSMSTPHKPQPQQMIPASQGQQSSPVVRHSTPHSSSPLAGNLMGVQMNQGMPIAMTSTAQGAGSPLQVTSGVQHSHPAVMGHPMTASRSQQGPSRHGTPQMPHGTPGMSHATPTMRNATPTQRMTHASPSISTMAHTPVMSHAIMANPQMNGVMMTPQQQQQAIMQRQKIMLQRSLQAGGQQLNPQQLAQLQASMHAQQNIQHAQQQQQQQHQQQHSIFLQQQQAQQQQQQQQQQQQQQQQPPPHQPQPHQFPSQAAYQAHVIRSQLAQMHMSHQQAIHGQQQGNPQQLPQQQVVAQANGVPQTQVGLQPRYRALYAQRVLPQVQIEVRAKFTQQYGHMTGWPENIRQQFQEQVEKTAKQYLFEIMKREGQQQRAQMAQNQAQAQAQAQAQVQAQVQAQAQALQQQHHQQQMMGNNNMAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.78
3	0.76
4	0.75
5	0.74
6	0.71
7	0.69
8	0.63
9	0.58
10	0.48
11	0.48
12	0.43
13	0.39
14	0.33
15	0.27
16	0.28
17	0.28
18	0.29
19	0.3
20	0.31
21	0.29
22	0.34
23	0.34
24	0.31
25	0.28
26	0.33
27	0.33
28	0.36
29	0.36
30	0.35
31	0.35
32	0.34
33	0.34
34	0.36
35	0.37
36	0.35
37	0.34
38	0.33
39	0.34
40	0.36
41	0.35
42	0.28
43	0.23
44	0.2
45	0.19
46	0.17
47	0.13
48	0.12
49	0.13
50	0.15
51	0.18
52	0.2
53	0.23
54	0.27
55	0.29
56	0.33
57	0.42
58	0.48
59	0.54
60	0.61
61	0.68
62	0.75
63	0.82
64	0.88
65	0.88
66	0.88
67	0.84
68	0.81
69	0.8
70	0.73
71	0.7
72	0.68
73	0.68
74	0.6
75	0.63
76	0.65
77	0.62
78	0.67
79	0.71
80	0.71
81	0.61
82	0.62
83	0.64
84	0.59
85	0.55
86	0.46
87	0.42
88	0.41
89	0.41
90	0.4
91	0.33
92	0.32
93	0.35
94	0.4
95	0.39
96	0.41
97	0.48
98	0.55
99	0.64
100	0.66
101	0.66
102	0.69
103	0.67
104	0.59
105	0.54
106	0.54
107	0.5
108	0.49
109	0.48
110	0.47
111	0.48
112	0.54
113	0.61
114	0.59
115	0.58
116	0.58
117	0.61
118	0.6
119	0.62
120	0.59
121	0.54
122	0.54
123	0.52
124	0.5
125	0.45
126	0.42
127	0.43
128	0.39
129	0.37
130	0.33
131	0.33
132	0.39
133	0.36
134	0.39
135	0.37
136	0.4
137	0.38
138	0.34
139	0.34
140	0.29
141	0.27
142	0.22
143	0.19
144	0.15
145	0.16
146	0.18
147	0.2
148	0.17
149	0.18
150	0.17
151	0.16
152	0.16
153	0.15
154	0.15
155	0.12
156	0.12
157	0.11
158	0.12
159	0.11
160	0.11
161	0.12
162	0.1
163	0.08
164	0.09
165	0.09
166	0.08
167	0.09
168	0.09
169	0.1
170	0.11
171	0.16
172	0.22
173	0.23
174	0.24
175	0.25
176	0.24
177	0.22
178	0.23
179	0.22
180	0.18
181	0.2
182	0.2
183	0.19
184	0.21
185	0.26
186	0.29
187	0.28
188	0.32
189	0.3
190	0.36
191	0.38
192	0.37
193	0.37
194	0.36
195	0.36
196	0.32
197	0.32
198	0.27
199	0.26
200	0.26
201	0.22
202	0.21
203	0.19
204	0.18
205	0.21
206	0.26
207	0.31
208	0.37
209	0.42
210	0.4
211	0.39
212	0.39
213	0.39
214	0.34
215	0.3
216	0.24
217	0.21
218	0.21
219	0.21
220	0.25
221	0.27
222	0.32
223	0.37
224	0.39
225	0.38
226	0.4
227	0.41
228	0.39
229	0.35
230	0.3
231	0.24
232	0.21
233	0.2
234	0.18
235	0.17
236	0.14
237	0.15
238	0.15
239	0.21
240	0.22
241	0.22
242	0.23
243	0.25
244	0.29
245	0.28
246	0.28
247	0.23
248	0.23
249	0.23
250	0.23
251	0.22
252	0.17
253	0.18
254	0.16
255	0.14
256	0.12
257	0.14
258	0.13
259	0.14
260	0.14
261	0.15
262	0.14
263	0.15
264	0.16
265	0.16
266	0.18
267	0.19
268	0.2
269	0.24
270	0.3
271	0.36
272	0.44
273	0.52
274	0.56
275	0.6
276	0.63
277	0.62
278	0.6
279	0.56
280	0.54
281	0.55
282	0.48
283	0.42
284	0.38
285	0.33
286	0.29
287	0.29
288	0.22
289	0.12
290	0.11
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.09
302	0.09
303	0.13
304	0.2
305	0.24
306	0.33
307	0.38
308	0.44
309	0.45
310	0.46
311	0.45
312	0.47
313	0.48
314	0.42
315	0.37
316	0.33
317	0.3
318	0.29
319	0.29
320	0.25
321	0.27
322	0.26
323	0.25
324	0.27
325	0.27
326	0.29
327	0.27
328	0.23
329	0.18
330	0.17
331	0.17
332	0.15
333	0.15
334	0.14
335	0.13
336	0.16
337	0.15
338	0.16
339	0.19
340	0.25
341	0.28
342	0.35
343	0.44
344	0.49
345	0.49
346	0.5
347	0.52
348	0.53
349	0.54
350	0.5
351	0.44
352	0.37
353	0.35
354	0.33
355	0.28
356	0.2
357	0.15
358	0.12
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.07
389	0.11
390	0.11
391	0.14
392	0.19
393	0.24
394	0.23
395	0.26
396	0.32
397	0.38
398	0.45
399	0.53
400	0.58
401	0.65
402	0.72
403	0.79
404	0.8
405	0.75
406	0.73
407	0.66
408	0.64
409	0.56
410	0.49
411	0.4
412	0.32
413	0.27
414	0.2
415	0.16
416	0.07
417	0.05
418	0.04
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.04
427	0.04
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.08
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.07
450	0.07
451	0.08
452	0.07
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.08
458	0.08
459	0.1
460	0.13
461	0.16
462	0.22
463	0.24
464	0.28
465	0.34
466	0.4
467	0.46
468	0.45
469	0.44
470	0.4
471	0.46
472	0.45
473	0.41
474	0.39
475	0.36
476	0.33
477	0.34
478	0.34
479	0.32
480	0.32
481	0.32
482	0.34
483	0.34
484	0.37
485	0.4
486	0.43
487	0.45
488	0.49
489	0.51
490	0.55
491	0.53
492	0.51
493	0.48
494	0.48
495	0.43
496	0.44
497	0.45
498	0.46
499	0.47
500	0.48
501	0.48
502	0.45
503	0.51
504	0.53
505	0.51
506	0.48
507	0.46
508	0.49
509	0.49
510	0.51
511	0.43
512	0.35
513	0.29
514	0.28
515	0.3
516	0.28
517	0.28
518	0.3
519	0.31
520	0.33
521	0.32
522	0.27
523	0.25
524	0.24
525	0.22
526	0.15
527	0.12
528	0.09
529	0.08
530	0.07
531	0.04
532	0.03
533	0.02
534	0.02
535	0.01
536	0.01
537	0.01
538	0.01
539	0.02
540	0.02
541	0.02
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.04
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.04
551	0.05
552	0.05
553	0.08
554	0.08
555	0.12
556	0.15
557	0.18
558	0.19
559	0.2
560	0.23
561	0.29
562	0.39
563	0.43
564	0.44
565	0.44
566	0.44
567	0.51
568	0.51
569	0.47
570	0.41
571	0.41
572	0.43
573	0.42
574	0.45
575	0.47
576	0.47
577	0.48
578	0.46
579	0.42
580	0.37
581	0.39
582	0.36
583	0.29
584	0.25
585	0.19
586	0.2
587	0.18
588	0.18
589	0.15
590	0.17
591	0.17
592	0.17
593	0.19
594	0.21
595	0.27
596	0.27
597	0.29
598	0.29
599	0.27
600	0.28
601	0.27
602	0.25
603	0.18
604	0.16
605	0.13
606	0.1
607	0.1
608	0.09
609	0.07
610	0.06
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.05
619	0.04
620	0.04
621	0.04
622	0.05
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.05
627	0.06
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.07
635	0.1
636	0.1
637	0.1
638	0.12
639	0.12
640	0.12
641	0.13
642	0.12
643	0.09
644	0.12
645	0.12
646	0.1
647	0.1
648	0.1
649	0.12
650	0.14
651	0.14
652	0.13
653	0.15
654	0.16
655	0.2
656	0.25
657	0.27
658	0.29
659	0.33
660	0.32
661	0.35
662	0.36
663	0.33
664	0.38
665	0.41
666	0.37
667	0.33
668	0.32
669	0.28
670	0.25
671	0.26
672	0.23
673	0.15
674	0.15
675	0.16
676	0.17
677	0.18
678	0.2
679	0.22
680	0.17
681	0.2
682	0.23
683	0.27
684	0.33
685	0.34
686	0.35
687	0.32
688	0.35
689	0.36
690	0.39
691	0.36
692	0.29
693	0.27
694	0.27
695	0.26
696	0.22
697	0.2
698	0.15
699	0.14
700	0.15
701	0.14
702	0.12
703	0.11
704	0.14
705	0.13
706	0.12
707	0.11
708	0.1
709	0.11
710	0.12
711	0.13
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.09
716	0.08
717	0.08
718	0.09
719	0.07
720	0.11
721	0.13
722	0.16
723	0.18
724	0.18
725	0.18
726	0.21
727	0.3
728	0.34
729	0.37
730	0.37
731	0.37
732	0.38
733	0.42
734	0.43
735	0.38
736	0.35
737	0.33
738	0.34
739	0.34
740	0.35
741	0.31
742	0.27
743	0.25
744	0.22
745	0.22
746	0.22
747	0.22
748	0.23
749	0.23
750	0.21
751	0.19
752	0.18
753	0.18
754	0.15
755	0.15
756	0.12
757	0.14
758	0.15
759	0.17
760	0.18
761	0.17
762	0.17
763	0.18
764	0.24
765	0.26
766	0.25
767	0.28
768	0.28
769	0.31
770	0.37
771	0.41
772	0.4
773	0.45
774	0.53
775	0.55
776	0.62
777	0.6
778	0.6
779	0.54
780	0.54
781	0.47
782	0.44
783	0.39
784	0.36
785	0.38
786	0.35
787	0.39
788	0.39
789	0.44
790	0.42
791	0.45
792	0.47
793	0.49
794	0.52
795	0.57
796	0.56
797	0.58
798	0.63
799	0.67
800	0.68
801	0.69
802	0.7
803	0.7
804	0.71
805	0.7
806	0.69
807	0.71
808	0.71
809	0.7
810	0.68
811	0.66
812	0.69
813	0.71
814	0.71
815	0.65
816	0.58
817	0.53
818	0.49
819	0.47
820	0.43
821	0.34
822	0.28
823	0.29
824	0.31
825	0.29
826	0.28
827	0.24
828	0.2
829	0.2
830	0.21
831	0.19
832	0.18
833	0.19
834	0.18
835	0.22
836	0.25
837	0.26
838	0.25
839	0.21
840	0.22
841	0.23
842	0.25
843	0.27
844	0.28
845	0.28
846	0.3
847	0.38
848	0.41
849	0.43
850	0.41
851	0.35
852	0.37
853	0.4
854	0.41
855	0.33
856	0.31
857	0.27
858	0.34
859	0.36
860	0.29
861	0.25
862	0.22
863	0.23
864	0.21
865	0.2
866	0.13
867	0.1
868	0.11
869	0.12
870	0.16
871	0.19
872	0.24
873	0.25
874	0.3
875	0.33
876	0.35
877	0.34
878	0.32
879	0.33
880	0.37
881	0.38
882	0.4
883	0.43
884	0.43
885	0.43
886	0.42
887	0.38
888	0.31
889	0.31
890	0.31
891	0.3
892	0.28
893	0.31
894	0.3
895	0.3
896	0.3
897	0.3
898	0.29
899	0.29
900	0.34
901	0.34
902	0.35
903	0.37
904	0.37
905	0.37
906	0.38
907	0.37
908	0.32
909	0.34
910	0.38
911	0.38
912	0.37
913	0.38
914	0.39
915	0.4
916	0.48
917	0.43
918	0.45
919	0.47
920	0.47
921	0.45
922	0.47
923	0.43
924	0.34
925	0.34
926	0.35
927	0.37
928	0.38
929	0.41
930	0.36
931	0.42
932	0.43
933	0.51
934	0.5
935	0.49
936	0.52
937	0.54
938	0.55
939	0.54
940	0.54
941	0.51
942	0.53
943	0.52
944	0.51
945	0.46
946	0.43
947	0.38
948	0.36
949	0.31
950	0.27
951	0.22
952	0.2
953	0.19
954	0.21
955	0.2
956	0.23
957	0.22
958	0.21
959	0.21
960	0.21
961	0.21
962	0.21
963	0.21
964	0.2
965	0.2
966	0.23
967	0.24
968	0.23
969	0.27
970	0.33
971	0.38
972	0.41
973	0.42
974	0.37
975	0.41
976	0.47
977	0.51
978	0.45

C1H3C8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer