Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H1L9

Protein Details
Accession C1H1L9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MFATKRPTKRMRILGPWDLNHydrophilic
611-632QVDTPPKMRTPQKRQSLIKIAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-264RPKLSRTKGRKPLGARKIRSLKRSK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
KEGG pbl:PAAG_04805  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MFATKRPTKRMRILGPWDLNLANIVPEIDVNAARQANDLRLKSRFEDIFEKYGKDFSSVGDEIDLATGRIIIDNGHIEKMRNEQDLGAQKWRYEFDPLGETEATTDRLDKSPNFPTINHSRQNKEPTEVEEVHPRNVISFGEGSHSICSRNSGLRSRNGSPFENGVSPRNGFLHRTSSYLSRERVRTSSQSVEPLWQTSEIDNRLFGSFPAPALTPIFPRNRSVSPPNSGSLWALPQTGRPKLSRTKGRKPLGARKIRSLKRSKSSDCISHSDSDDPLQNAFRSVSTPSKTRTPAKATIAASTLCTNKSSTIIREPTKKSDSSYPSPSYPLQKSELHDHKPEDEMPQSSPQNHDQQKLGILTESPSFQVNDSIENSVESESSTNPENDISLYEPDSISKIPETSKPAKLSTATEPLTPSEIRIILTLRVVQKRPWKEVYRSIPERTSGQLRHWYYVRSVDIKRCRPPEISWTEEVKDALESFKLQSEVSWEDLEAALKGQTRNELQCEWAKICLGEAWEDWKSSYCPPTQQQEWQFKTPTRLPKRTLVIKSPSLVKLLQPARTVSRRPAPLTPFSAPAKQVEQSDESDDSDDPLSEAFDTAWSGAGLSSIQVDTPPKMRTPQKRQSLIKIAASPYKRRTPKEQFDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.78
3 0.7
4 0.64
5 0.53
6 0.44
7 0.35
8 0.27
9 0.17
10 0.12
11 0.11
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.15
19 0.16
20 0.16
21 0.18
22 0.19
23 0.25
24 0.32
25 0.33
26 0.33
27 0.36
28 0.39
29 0.39
30 0.45
31 0.4
32 0.37
33 0.42
34 0.42
35 0.46
36 0.45
37 0.45
38 0.38
39 0.4
40 0.35
41 0.3
42 0.26
43 0.19
44 0.25
45 0.23
46 0.22
47 0.19
48 0.18
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.07
58 0.06
59 0.09
60 0.14
61 0.15
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.21
66 0.29
67 0.32
68 0.29
69 0.28
70 0.26
71 0.32
72 0.4
73 0.42
74 0.42
75 0.37
76 0.36
77 0.38
78 0.39
79 0.33
80 0.3
81 0.28
82 0.24
83 0.28
84 0.27
85 0.28
86 0.26
87 0.25
88 0.21
89 0.22
90 0.21
91 0.16
92 0.17
93 0.15
94 0.18
95 0.21
96 0.22
97 0.25
98 0.3
99 0.37
100 0.37
101 0.35
102 0.4
103 0.47
104 0.52
105 0.55
106 0.53
107 0.51
108 0.56
109 0.64
110 0.6
111 0.55
112 0.5
113 0.46
114 0.49
115 0.46
116 0.41
117 0.42
118 0.41
119 0.38
120 0.37
121 0.32
122 0.25
123 0.24
124 0.22
125 0.14
126 0.13
127 0.11
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.16
133 0.14
134 0.14
135 0.17
136 0.16
137 0.21
138 0.24
139 0.3
140 0.34
141 0.41
142 0.47
143 0.48
144 0.53
145 0.52
146 0.49
147 0.44
148 0.41
149 0.36
150 0.34
151 0.31
152 0.27
153 0.26
154 0.25
155 0.24
156 0.24
157 0.23
158 0.21
159 0.22
160 0.26
161 0.24
162 0.25
163 0.26
164 0.28
165 0.32
166 0.35
167 0.36
168 0.35
169 0.38
170 0.39
171 0.4
172 0.4
173 0.39
174 0.39
175 0.41
176 0.37
177 0.38
178 0.36
179 0.36
180 0.32
181 0.29
182 0.24
183 0.19
184 0.18
185 0.15
186 0.2
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.15
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.18
204 0.23
205 0.23
206 0.25
207 0.29
208 0.29
209 0.34
210 0.38
211 0.38
212 0.38
213 0.39
214 0.37
215 0.34
216 0.32
217 0.27
218 0.22
219 0.18
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.15
224 0.19
225 0.22
226 0.23
227 0.23
228 0.27
229 0.34
230 0.43
231 0.48
232 0.53
233 0.6
234 0.67
235 0.72
236 0.72
237 0.72
238 0.74
239 0.74
240 0.75
241 0.67
242 0.66
243 0.71
244 0.7
245 0.71
246 0.7
247 0.67
248 0.66
249 0.72
250 0.66
251 0.63
252 0.62
253 0.59
254 0.54
255 0.51
256 0.45
257 0.39
258 0.37
259 0.32
260 0.28
261 0.22
262 0.21
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.09
271 0.11
272 0.16
273 0.17
274 0.19
275 0.21
276 0.26
277 0.3
278 0.34
279 0.37
280 0.38
281 0.42
282 0.43
283 0.47
284 0.42
285 0.39
286 0.36
287 0.3
288 0.25
289 0.21
290 0.18
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.13
296 0.13
297 0.14
298 0.19
299 0.24
300 0.26
301 0.34
302 0.36
303 0.39
304 0.41
305 0.4
306 0.35
307 0.38
308 0.41
309 0.38
310 0.42
311 0.38
312 0.36
313 0.38
314 0.37
315 0.35
316 0.31
317 0.28
318 0.26
319 0.26
320 0.27
321 0.34
322 0.39
323 0.37
324 0.38
325 0.37
326 0.34
327 0.33
328 0.32
329 0.25
330 0.21
331 0.18
332 0.17
333 0.21
334 0.21
335 0.2
336 0.22
337 0.23
338 0.3
339 0.32
340 0.32
341 0.28
342 0.27
343 0.29
344 0.27
345 0.23
346 0.14
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.11
356 0.1
357 0.12
358 0.12
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.09
364 0.09
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.14
389 0.21
390 0.25
391 0.31
392 0.33
393 0.33
394 0.34
395 0.34
396 0.33
397 0.31
398 0.33
399 0.28
400 0.26
401 0.26
402 0.25
403 0.26
404 0.22
405 0.18
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.11
412 0.12
413 0.15
414 0.18
415 0.23
416 0.24
417 0.28
418 0.35
419 0.4
420 0.45
421 0.5
422 0.5
423 0.51
424 0.59
425 0.63
426 0.64
427 0.64
428 0.61
429 0.55
430 0.51
431 0.47
432 0.41
433 0.39
434 0.31
435 0.31
436 0.36
437 0.36
438 0.38
439 0.37
440 0.35
441 0.3
442 0.34
443 0.33
444 0.3
445 0.31
446 0.37
447 0.45
448 0.5
449 0.56
450 0.54
451 0.55
452 0.52
453 0.52
454 0.53
455 0.51
456 0.49
457 0.45
458 0.45
459 0.42
460 0.4
461 0.38
462 0.28
463 0.22
464 0.17
465 0.13
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.12
470 0.13
471 0.12
472 0.11
473 0.15
474 0.16
475 0.18
476 0.17
477 0.14
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.11
482 0.09
483 0.09
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.16
488 0.19
489 0.22
490 0.25
491 0.24
492 0.25
493 0.29
494 0.33
495 0.29
496 0.27
497 0.25
498 0.21
499 0.21
500 0.19
501 0.15
502 0.13
503 0.12
504 0.16
505 0.16
506 0.17
507 0.17
508 0.17
509 0.18
510 0.21
511 0.25
512 0.23
513 0.28
514 0.33
515 0.4
516 0.42
517 0.49
518 0.54
519 0.59
520 0.62
521 0.61
522 0.61
523 0.56
524 0.59
525 0.58
526 0.6
527 0.6
528 0.62
529 0.61
530 0.65
531 0.7
532 0.72
533 0.71
534 0.69
535 0.65
536 0.62
537 0.6
538 0.58
539 0.51
540 0.44
541 0.39
542 0.32
543 0.34
544 0.35
545 0.37
546 0.33
547 0.34
548 0.39
549 0.45
550 0.47
551 0.45
552 0.49
553 0.5
554 0.52
555 0.56
556 0.54
557 0.55
558 0.58
559 0.53
560 0.5
561 0.48
562 0.48
563 0.42
564 0.39
565 0.36
566 0.33
567 0.32
568 0.31
569 0.31
570 0.29
571 0.32
572 0.3
573 0.27
574 0.26
575 0.24
576 0.22
577 0.19
578 0.17
579 0.12
580 0.11
581 0.11
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.08
593 0.07
594 0.06
595 0.08
596 0.07
597 0.07
598 0.09
599 0.12
600 0.14
601 0.2
602 0.22
603 0.23
604 0.31
605 0.41
606 0.5
607 0.58
608 0.65
609 0.71
610 0.78
611 0.82
612 0.84
613 0.84
614 0.8
615 0.76
616 0.71
617 0.65
618 0.63
619 0.63
620 0.61
621 0.58
622 0.62
623 0.64
624 0.64
625 0.7
626 0.73