Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H0I6

Protein Details
Accession C1H0I6    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-114SGNARGKKRKKGGAGGRKEKEBasic
370-398QSQPQTQAELKRKQRPPFKPPPNPHRGQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-113ARGKKRKKGGAGGRKEK
380-392KRKQRPPFKPPPN
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 9.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG pbl:PAAG_04280  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSLSPPLPPSPQTPLSLPPSNQNPKKRPLSMPSAVHISHKKARMHPLRQTSFPSSQDSDPRVYSARAASVKSEADGGSATGSVTGLFAGSVDGSGNARGKKRKKGGAGGRKEKETETERDGTASVRGTTVDGGVEVDGGGEEVEEDGDGDEGDMEEVEGEGEDGDGPGTAREAEAERKNLAILIDAFTPAQSTRYDFFKRAKLNKPMVRKIVNQTLSQSVPPNVITTISGYTKVFVGELVEKARTVQEEWAEAADRAAYAEYEAELAREEEKEEEEAPARSREQAVTTASTQSTQLTTTTATNTIMDSPTRTIQLSSSTAATDMPSSKTDLTGNGIAVVKTELSSSSSSTTANDILKSTTTPPSPSTQPQSQPQTQAELKRKQRPPFKPPPNPHRGQLLPSHLREALRRYKRDGEGGGVGFGGLSMGGMGVKGSFSCGIRGVGGRRLFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.45
3 0.49
4 0.46
5 0.46
6 0.52
7 0.59
8 0.65
9 0.69
10 0.68
11 0.71
12 0.79
13 0.79
14 0.76
15 0.73
16 0.74
17 0.72
18 0.69
19 0.63
20 0.6
21 0.53
22 0.52
23 0.49
24 0.47
25 0.46
26 0.49
27 0.51
28 0.52
29 0.63
30 0.66
31 0.7
32 0.73
33 0.76
34 0.74
35 0.72
36 0.72
37 0.68
38 0.63
39 0.57
40 0.54
41 0.47
42 0.46
43 0.49
44 0.46
45 0.43
46 0.37
47 0.37
48 0.34
49 0.3
50 0.29
51 0.24
52 0.27
53 0.26
54 0.26
55 0.26
56 0.27
57 0.27
58 0.24
59 0.24
60 0.17
61 0.15
62 0.14
63 0.12
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.06
81 0.08
82 0.12
83 0.16
84 0.21
85 0.3
86 0.37
87 0.47
88 0.55
89 0.6
90 0.64
91 0.71
92 0.76
93 0.78
94 0.82
95 0.82
96 0.78
97 0.73
98 0.67
99 0.57
100 0.53
101 0.47
102 0.41
103 0.37
104 0.36
105 0.33
106 0.32
107 0.32
108 0.26
109 0.23
110 0.2
111 0.14
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.08
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.02
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.12
161 0.15
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.12
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.16
182 0.19
183 0.21
184 0.25
185 0.3
186 0.38
187 0.43
188 0.5
189 0.53
190 0.6
191 0.63
192 0.68
193 0.67
194 0.65
195 0.62
196 0.57
197 0.53
198 0.52
199 0.5
200 0.41
201 0.37
202 0.34
203 0.31
204 0.28
205 0.24
206 0.16
207 0.14
208 0.14
209 0.12
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.18
275 0.19
276 0.18
277 0.17
278 0.16
279 0.14
280 0.12
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.15
299 0.13
300 0.13
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.14
314 0.14
315 0.15
316 0.16
317 0.15
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.16
322 0.17
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.07
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.15
338 0.16
339 0.17
340 0.16
341 0.15
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.18
346 0.2
347 0.2
348 0.22
349 0.23
350 0.27
351 0.31
352 0.36
353 0.4
354 0.42
355 0.46
356 0.52
357 0.58
358 0.58
359 0.59
360 0.54
361 0.54
362 0.52
363 0.55
364 0.56
365 0.57
366 0.62
367 0.66
368 0.73
369 0.74
370 0.8
371 0.81
372 0.82
373 0.83
374 0.86
375 0.86
376 0.89
377 0.91
378 0.9
379 0.85
380 0.78
381 0.75
382 0.67
383 0.6
384 0.57
385 0.56
386 0.54
387 0.52
388 0.52
389 0.46
390 0.45
391 0.44
392 0.45
393 0.46
394 0.48
395 0.5
396 0.53
397 0.59
398 0.62
399 0.65
400 0.59
401 0.54
402 0.51
403 0.47
404 0.41
405 0.31
406 0.27
407 0.19
408 0.17
409 0.11
410 0.04
411 0.03
412 0.02
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.07
421 0.1
422 0.11
423 0.13
424 0.15
425 0.16
426 0.18
427 0.23
428 0.24
429 0.29