Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6QDM2

Protein Details
Accession W6QDM2    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-55ASIPKKEDRKPTAVRRPPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-46RKP
50-50R
190-230KERLTKVERKRRMMELQAKEKEARLGRKAGSGVSAKGKPAV
339-358KKEKLERQRKLAALASRSKR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSFLDSILSSIQTGKPSQLPVTQVPTSPTPTSPAPASIPKKEDRKPTAVRRPPSTSGNVSGGIKRKADEQLPRPPKPENKVANSSAAMRPTLPTRPAVSSVPPRVVSKPNLPTTSRPTMPKPTPKPSLSATPKVIPPRKEPDPKPASAGAATTSKPPPKGSFAEIMAQAKAKQETAPVGVGLLRHQPGSKERLTKVERKRRMMELQAKEKEARLGRKAGSGVSAKGKPAVRQRDSEGPSYKGTAKPTQTPEPLTYRGTAGLPSNRGGNDRRHQSRNRQNEYLGTDEEDEGDLGGYDDYYSDASSDMEAGMDDVDREEAAALAFAKQEDEKELRQEMAAKKEKLERQRKLAALASRSKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.26
4 0.28
5 0.3
6 0.32
7 0.33
8 0.39
9 0.38
10 0.36
11 0.36
12 0.36
13 0.38
14 0.35
15 0.31
16 0.29
17 0.28
18 0.3
19 0.28
20 0.27
21 0.26
22 0.34
23 0.39
24 0.41
25 0.45
26 0.49
27 0.56
28 0.59
29 0.66
30 0.63
31 0.67
32 0.7
33 0.75
34 0.79
35 0.8
36 0.8
37 0.77
38 0.78
39 0.73
40 0.69
41 0.64
42 0.57
43 0.52
44 0.48
45 0.43
46 0.37
47 0.37
48 0.38
49 0.36
50 0.32
51 0.29
52 0.3
53 0.32
54 0.37
55 0.41
56 0.41
57 0.49
58 0.57
59 0.6
60 0.58
61 0.6
62 0.62
63 0.59
64 0.62
65 0.6
66 0.58
67 0.62
68 0.61
69 0.58
70 0.52
71 0.49
72 0.42
73 0.35
74 0.28
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.23
79 0.21
80 0.21
81 0.22
82 0.24
83 0.27
84 0.27
85 0.29
86 0.33
87 0.35
88 0.36
89 0.35
90 0.35
91 0.36
92 0.39
93 0.38
94 0.38
95 0.42
96 0.45
97 0.47
98 0.47
99 0.48
100 0.5
101 0.52
102 0.48
103 0.43
104 0.42
105 0.47
106 0.52
107 0.58
108 0.58
109 0.58
110 0.63
111 0.6
112 0.59
113 0.52
114 0.55
115 0.52
116 0.5
117 0.46
118 0.41
119 0.44
120 0.5
121 0.52
122 0.45
123 0.45
124 0.46
125 0.51
126 0.58
127 0.56
128 0.58
129 0.58
130 0.55
131 0.53
132 0.47
133 0.39
134 0.3
135 0.28
136 0.19
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.17
141 0.18
142 0.19
143 0.21
144 0.21
145 0.24
146 0.26
147 0.26
148 0.25
149 0.24
150 0.25
151 0.25
152 0.24
153 0.2
154 0.18
155 0.15
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.11
174 0.13
175 0.18
176 0.21
177 0.23
178 0.24
179 0.33
180 0.36
181 0.44
182 0.52
183 0.57
184 0.61
185 0.62
186 0.65
187 0.62
188 0.64
189 0.64
190 0.63
191 0.6
192 0.62
193 0.59
194 0.57
195 0.51
196 0.47
197 0.43
198 0.38
199 0.35
200 0.29
201 0.3
202 0.29
203 0.31
204 0.31
205 0.26
206 0.25
207 0.22
208 0.2
209 0.21
210 0.22
211 0.19
212 0.23
213 0.25
214 0.25
215 0.33
216 0.41
217 0.39
218 0.4
219 0.45
220 0.49
221 0.51
222 0.52
223 0.47
224 0.4
225 0.38
226 0.37
227 0.36
228 0.3
229 0.32
230 0.31
231 0.31
232 0.36
233 0.41
234 0.45
235 0.45
236 0.45
237 0.44
238 0.43
239 0.43
240 0.37
241 0.32
242 0.26
243 0.25
244 0.22
245 0.19
246 0.18
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.22
251 0.21
252 0.24
253 0.26
254 0.3
255 0.34
256 0.42
257 0.48
258 0.54
259 0.6
260 0.68
261 0.75
262 0.77
263 0.77
264 0.71
265 0.65
266 0.63
267 0.6
268 0.53
269 0.44
270 0.35
271 0.28
272 0.24
273 0.24
274 0.18
275 0.14
276 0.1
277 0.09
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.12
314 0.16
315 0.2
316 0.22
317 0.26
318 0.29
319 0.28
320 0.28
321 0.35
322 0.35
323 0.41
324 0.47
325 0.43
326 0.46
327 0.54
328 0.6
329 0.64
330 0.69
331 0.67
332 0.66
333 0.74
334 0.72
335 0.69
336 0.68
337 0.64
338 0.61