Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HCD1

Protein Details
Accession C1HCD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-144SLIKSFFTVKRKLKNCKDKVSFRNTCFHydrophilic
530-555QTVEKRNSSSRQRPPPPPRRNLRLSAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013882  Ctp1_C  
IPR033316  RBBP8-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG pbl:PAAG_08422  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08573  SAE2  
Amino Acid Sequences MEEHDFCTLAEQVGQLVNQCRQWKQGNAELEEKLKHRDSRIIALETENADLERYLENLESNDAVDGLEKRLLDNRQQYAPNMVLHESVGKTEKPVTISYEYYASLAKRYEQLFQENASLIKSFFTVKRKLKNCKDKVSFRNTCFERDSFDVHVRGKRVVFQRVDEITSRVPQNQRHHGQVEEASTTGLATIGRADQIPEPRPHEMATGIEREAIGISDGALEPGSLPLLSSNSRARGIPEELTNQHSSGPTSSDITPTQTQDPRYADEPCMFLSSSPSGSPIFVSERPVRVSARRNCEQPAPSAGTKPLEMGSFTRSVAAKSEPTPRSPLQTMQGTTDDDDDDCLDPSTCETNDIDIGSTNHINPPPLKPPRTKFAVLEEREAVKVEQIDLDGLQIIGTKRRLALQPVNCNISSLRQSHGYTKDQETKRSRYNPKGADAVHLVTEDGEKMSHSKTKTRPATDQLRENARIKNAVCPTTSCLEDPFLGDQSWFRPVLNSPFRIPETMEKLPPGTPSKVSSSSVTPRCSRPQTVEKRNSSSRQRPPPPPRRNLRLSALPQPRDDDEISPESEPFRARPLHRLGFEHFRLNPERNQGLDYAFDEVVRRKDLRKCLPGCIRPECCGKGFRAMAKLKRFGEQTADEKEDLSLEYLDREDRNVLDEYLGDKKVVLESMTNKELQELLLDARTRHLANQFGKHRYVHERARSPPGFWRTDMPSTQELERDWQEARKAEQEKLAERYREAMRPGGLWRFADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.19
4 0.22
5 0.26
6 0.31
7 0.31
8 0.36
9 0.43
10 0.47
11 0.49
12 0.53
13 0.55
14 0.56
15 0.59
16 0.55
17 0.52
18 0.48
19 0.44
20 0.43
21 0.42
22 0.41
23 0.4
24 0.45
25 0.46
26 0.51
27 0.56
28 0.52
29 0.47
30 0.44
31 0.44
32 0.37
33 0.34
34 0.25
35 0.18
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.14
55 0.13
56 0.15
57 0.21
58 0.25
59 0.3
60 0.37
61 0.39
62 0.43
63 0.46
64 0.46
65 0.46
66 0.45
67 0.39
68 0.33
69 0.3
70 0.24
71 0.22
72 0.24
73 0.19
74 0.18
75 0.19
76 0.17
77 0.18
78 0.22
79 0.24
80 0.23
81 0.24
82 0.27
83 0.28
84 0.29
85 0.28
86 0.26
87 0.24
88 0.22
89 0.23
90 0.18
91 0.17
92 0.17
93 0.17
94 0.21
95 0.22
96 0.27
97 0.28
98 0.33
99 0.32
100 0.32
101 0.33
102 0.29
103 0.28
104 0.23
105 0.2
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.17
111 0.24
112 0.32
113 0.39
114 0.49
115 0.57
116 0.67
117 0.75
118 0.81
119 0.83
120 0.85
121 0.86
122 0.87
123 0.87
124 0.87
125 0.85
126 0.76
127 0.77
128 0.68
129 0.64
130 0.58
131 0.49
132 0.43
133 0.38
134 0.39
135 0.33
136 0.36
137 0.35
138 0.35
139 0.39
140 0.35
141 0.36
142 0.33
143 0.35
144 0.37
145 0.41
146 0.39
147 0.37
148 0.43
149 0.41
150 0.43
151 0.38
152 0.34
153 0.28
154 0.3
155 0.3
156 0.28
157 0.31
158 0.36
159 0.43
160 0.51
161 0.52
162 0.54
163 0.54
164 0.49
165 0.48
166 0.43
167 0.37
168 0.28
169 0.24
170 0.18
171 0.16
172 0.14
173 0.11
174 0.08
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.11
183 0.18
184 0.23
185 0.26
186 0.3
187 0.31
188 0.32
189 0.31
190 0.28
191 0.24
192 0.21
193 0.21
194 0.19
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.11
201 0.08
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.07
216 0.08
217 0.11
218 0.14
219 0.16
220 0.18
221 0.18
222 0.19
223 0.22
224 0.24
225 0.23
226 0.22
227 0.24
228 0.25
229 0.29
230 0.28
231 0.24
232 0.22
233 0.21
234 0.19
235 0.15
236 0.16
237 0.12
238 0.14
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.19
243 0.21
244 0.2
245 0.25
246 0.26
247 0.27
248 0.29
249 0.31
250 0.29
251 0.29
252 0.3
253 0.26
254 0.24
255 0.24
256 0.19
257 0.19
258 0.16
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.12
264 0.13
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.1
269 0.13
270 0.13
271 0.18
272 0.2
273 0.22
274 0.23
275 0.25
276 0.25
277 0.26
278 0.35
279 0.37
280 0.43
281 0.44
282 0.45
283 0.45
284 0.49
285 0.45
286 0.38
287 0.35
288 0.32
289 0.29
290 0.28
291 0.28
292 0.23
293 0.21
294 0.2
295 0.16
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.14
308 0.15
309 0.25
310 0.24
311 0.25
312 0.3
313 0.29
314 0.32
315 0.32
316 0.31
317 0.26
318 0.29
319 0.28
320 0.25
321 0.26
322 0.22
323 0.21
324 0.19
325 0.15
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.09
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.15
353 0.22
354 0.27
355 0.31
356 0.35
357 0.38
358 0.42
359 0.46
360 0.45
361 0.37
362 0.4
363 0.45
364 0.4
365 0.4
366 0.36
367 0.32
368 0.3
369 0.3
370 0.21
371 0.12
372 0.11
373 0.09
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.12
389 0.14
390 0.17
391 0.25
392 0.29
393 0.37
394 0.39
395 0.42
396 0.39
397 0.38
398 0.33
399 0.28
400 0.25
401 0.18
402 0.17
403 0.18
404 0.19
405 0.24
406 0.29
407 0.29
408 0.29
409 0.33
410 0.41
411 0.39
412 0.47
413 0.47
414 0.48
415 0.53
416 0.59
417 0.62
418 0.61
419 0.68
420 0.63
421 0.6
422 0.59
423 0.52
424 0.45
425 0.39
426 0.31
427 0.23
428 0.18
429 0.15
430 0.1
431 0.1
432 0.07
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.08
438 0.12
439 0.13
440 0.21
441 0.26
442 0.36
443 0.43
444 0.46
445 0.49
446 0.53
447 0.61
448 0.59
449 0.6
450 0.55
451 0.54
452 0.53
453 0.52
454 0.47
455 0.39
456 0.38
457 0.32
458 0.34
459 0.32
460 0.3
461 0.28
462 0.26
463 0.28
464 0.26
465 0.26
466 0.19
467 0.16
468 0.16
469 0.15
470 0.15
471 0.14
472 0.13
473 0.12
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.14
478 0.13
479 0.11
480 0.11
481 0.13
482 0.23
483 0.28
484 0.29
485 0.28
486 0.31
487 0.32
488 0.32
489 0.32
490 0.28
491 0.3
492 0.3
493 0.3
494 0.27
495 0.27
496 0.27
497 0.3
498 0.28
499 0.23
500 0.22
501 0.24
502 0.28
503 0.29
504 0.3
505 0.27
506 0.28
507 0.34
508 0.38
509 0.39
510 0.37
511 0.39
512 0.45
513 0.48
514 0.46
515 0.44
516 0.49
517 0.56
518 0.64
519 0.69
520 0.67
521 0.69
522 0.74
523 0.74
524 0.73
525 0.72
526 0.71
527 0.73
528 0.75
529 0.79
530 0.83
531 0.87
532 0.87
533 0.87
534 0.86
535 0.84
536 0.82
537 0.77
538 0.72
539 0.7
540 0.64
541 0.65
542 0.64
543 0.59
544 0.53
545 0.5
546 0.45
547 0.4
548 0.37
549 0.29
550 0.25
551 0.25
552 0.25
553 0.23
554 0.22
555 0.19
556 0.19
557 0.19
558 0.15
559 0.17
560 0.22
561 0.23
562 0.31
563 0.38
564 0.43
565 0.45
566 0.47
567 0.47
568 0.5
569 0.5
570 0.48
571 0.4
572 0.39
573 0.41
574 0.41
575 0.4
576 0.39
577 0.39
578 0.34
579 0.35
580 0.31
581 0.27
582 0.25
583 0.22
584 0.18
585 0.16
586 0.15
587 0.16
588 0.18
589 0.2
590 0.22
591 0.23
592 0.25
593 0.32
594 0.42
595 0.5
596 0.56
597 0.56
598 0.62
599 0.7
600 0.71
601 0.7
602 0.7
603 0.64
604 0.58
605 0.62
606 0.55
607 0.48
608 0.45
609 0.4
610 0.4
611 0.4
612 0.4
613 0.42
614 0.47
615 0.52
616 0.56
617 0.61
618 0.54
619 0.56
620 0.54
621 0.46
622 0.45
623 0.43
624 0.41
625 0.4
626 0.41
627 0.36
628 0.35
629 0.33
630 0.27
631 0.22
632 0.18
633 0.13
634 0.09
635 0.11
636 0.11
637 0.14
638 0.14
639 0.15
640 0.15
641 0.14
642 0.17
643 0.18
644 0.17
645 0.15
646 0.16
647 0.17
648 0.21
649 0.21
650 0.17
651 0.16
652 0.16
653 0.17
654 0.18
655 0.16
656 0.15
657 0.2
658 0.26
659 0.29
660 0.29
661 0.27
662 0.27
663 0.26
664 0.22
665 0.18
666 0.13
667 0.12
668 0.16
669 0.17
670 0.17
671 0.19
672 0.22
673 0.21
674 0.24
675 0.26
676 0.3
677 0.35
678 0.44
679 0.5
680 0.52
681 0.55
682 0.52
683 0.54
684 0.54
685 0.56
686 0.56
687 0.58
688 0.61
689 0.62
690 0.72
691 0.67
692 0.61
693 0.62
694 0.6
695 0.54
696 0.48
697 0.49
698 0.45
699 0.5
700 0.49
701 0.46
702 0.42
703 0.42
704 0.42
705 0.39
706 0.34
707 0.33
708 0.33
709 0.31
710 0.29
711 0.3
712 0.34
713 0.35
714 0.38
715 0.4
716 0.42
717 0.42
718 0.46
719 0.48
720 0.48
721 0.51
722 0.55
723 0.49
724 0.46
725 0.49
726 0.48
727 0.48
728 0.45
729 0.43
730 0.36
731 0.37
732 0.41
733 0.41
734 0.39