Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Q277

Protein Details
Accession W6Q277    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-310ATVTKKSKGKGKRGAATRRGSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-308KKSKGKGKRGAATRRG
318-320KKR
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSAKRTGQAAKRVSFSLPPYASPLPLKPSHTGLSTLNTWTRTPICPFETTISAPPNAHLQAPSTFSSTSKTDSSNPTRNPSRQPSSKTLVSELSPNWGFDEQDTVLNCAGYGPKWTLSSPDTASTSTRKDKKESTTKPTMAEPRARTARHKGQMNFQNELRLLLLAYGDPSPHPSFPNEPLPETVRVLDEIVTDFVLELCHGAAQVAHHARRQKIKVEDFRFALRRDQNKLGRVQELLRMERELKEARKAFDQNDDQVAKEAGKKGAAAAAAAAAAGEDPVAAEAAAAATVTKKSKGKGKRGAATRRGSDATEESVSKKRKTIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.42
3 0.42
4 0.36
5 0.33
6 0.37
7 0.36
8 0.37
9 0.35
10 0.35
11 0.32
12 0.35
13 0.38
14 0.34
15 0.38
16 0.38
17 0.36
18 0.36
19 0.31
20 0.31
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.28
25 0.27
26 0.28
27 0.29
28 0.28
29 0.31
30 0.33
31 0.33
32 0.33
33 0.35
34 0.34
35 0.35
36 0.34
37 0.34
38 0.31
39 0.3
40 0.27
41 0.26
42 0.27
43 0.25
44 0.23
45 0.19
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.23
50 0.2
51 0.2
52 0.19
53 0.22
54 0.21
55 0.22
56 0.2
57 0.21
58 0.23
59 0.32
60 0.39
61 0.45
62 0.47
63 0.51
64 0.57
65 0.59
66 0.63
67 0.63
68 0.64
69 0.62
70 0.65
71 0.64
72 0.63
73 0.62
74 0.55
75 0.49
76 0.42
77 0.36
78 0.33
79 0.26
80 0.26
81 0.23
82 0.21
83 0.21
84 0.19
85 0.18
86 0.14
87 0.19
88 0.13
89 0.16
90 0.16
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.11
96 0.1
97 0.07
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.12
102 0.12
103 0.14
104 0.15
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.2
111 0.2
112 0.23
113 0.28
114 0.33
115 0.33
116 0.36
117 0.41
118 0.48
119 0.56
120 0.58
121 0.58
122 0.61
123 0.6
124 0.58
125 0.58
126 0.55
127 0.48
128 0.48
129 0.42
130 0.4
131 0.43
132 0.43
133 0.41
134 0.43
135 0.48
136 0.47
137 0.52
138 0.47
139 0.5
140 0.57
141 0.57
142 0.51
143 0.43
144 0.39
145 0.32
146 0.31
147 0.23
148 0.15
149 0.11
150 0.08
151 0.08
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.16
163 0.2
164 0.28
165 0.25
166 0.25
167 0.26
168 0.28
169 0.28
170 0.26
171 0.23
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.1
193 0.15
194 0.16
195 0.19
196 0.24
197 0.28
198 0.35
199 0.38
200 0.4
201 0.44
202 0.52
203 0.59
204 0.59
205 0.6
206 0.54
207 0.57
208 0.53
209 0.46
210 0.45
211 0.43
212 0.43
213 0.45
214 0.52
215 0.52
216 0.53
217 0.57
218 0.52
219 0.47
220 0.43
221 0.38
222 0.35
223 0.35
224 0.32
225 0.28
226 0.27
227 0.26
228 0.26
229 0.29
230 0.29
231 0.27
232 0.34
233 0.36
234 0.36
235 0.41
236 0.43
237 0.4
238 0.44
239 0.45
240 0.39
241 0.43
242 0.41
243 0.35
244 0.33
245 0.32
246 0.24
247 0.24
248 0.25
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.17
253 0.19
254 0.18
255 0.14
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.02
266 0.02
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.03
276 0.05
277 0.08
278 0.1
279 0.16
280 0.19
281 0.23
282 0.32
283 0.42
284 0.52
285 0.59
286 0.67
287 0.71
288 0.78
289 0.84
290 0.85
291 0.83
292 0.76
293 0.72
294 0.64
295 0.56
296 0.51
297 0.43
298 0.39
299 0.34
300 0.31
301 0.29
302 0.36
303 0.41
304 0.39