Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GQT0

Protein Details
Accession C1GQT0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-28VNIPTSKSRIYQRRHQQVQKANIPLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017383  ARPC1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005885  C:Arp2/3 protein complex  
GO:0003779  F:actin binding  
GO:0034314  P:Arp2/3 complex-mediated actin nucleation  
KEGG pbl:PAAG_00875  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MESVNIPTSKSRIYQRRHQQVQKANIPLAIVESSSYRKLDTSSMAAPEVHHLFHNPIADHSFSSDKQTLAVAKDNIVSLYQKSGSKYALSDELKGHDKTVTGVDIAPISGKIVTCSQDRNAYVWERTATGWKPTLVLLRIHRAATYVRWSPSEQKFAVGSGARVIAVCYFEEENDWWISKHLKKPIRSTITTLAWHPNSVLLAAGSTDSHARVFSSFIKGIDERPEPSAWGERLPFNTVCGEFLNDSAGWIHGCAFSPSGNSLAFTAHDSSITVVYPSAPEQPPRAMLNISTRLLPFMSLIWNGDDEIIAAGHDCEAFRFRGSVNGWQLVGSIDAKAQPGAGSAREESALNKFRQMDIKGSTKNDTQLQTVHQNTISTLRVYEEVGGKVRKFSSKEPPIPCLVSFLNAVRIERADSSTQQQAVLMEESSCGARDMPPIQW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.66
3 0.74
4 0.81
5 0.84
6 0.84
7 0.84
8 0.87
9 0.85
10 0.8
11 0.7
12 0.61
13 0.52
14 0.42
15 0.35
16 0.26
17 0.17
18 0.12
19 0.13
20 0.15
21 0.18
22 0.18
23 0.16
24 0.17
25 0.18
26 0.21
27 0.22
28 0.24
29 0.25
30 0.26
31 0.27
32 0.27
33 0.25
34 0.27
35 0.25
36 0.21
37 0.18
38 0.18
39 0.19
40 0.21
41 0.25
42 0.2
43 0.2
44 0.22
45 0.23
46 0.21
47 0.22
48 0.24
49 0.2
50 0.26
51 0.27
52 0.24
53 0.23
54 0.25
55 0.25
56 0.24
57 0.3
58 0.24
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.22
63 0.2
64 0.18
65 0.13
66 0.16
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.23
71 0.23
72 0.23
73 0.23
74 0.22
75 0.27
76 0.26
77 0.27
78 0.26
79 0.29
80 0.32
81 0.31
82 0.29
83 0.22
84 0.21
85 0.19
86 0.2
87 0.17
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.13
101 0.15
102 0.18
103 0.19
104 0.25
105 0.26
106 0.26
107 0.28
108 0.29
109 0.28
110 0.27
111 0.26
112 0.2
113 0.2
114 0.24
115 0.22
116 0.22
117 0.23
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.25
122 0.21
123 0.24
124 0.24
125 0.28
126 0.3
127 0.29
128 0.27
129 0.24
130 0.23
131 0.21
132 0.24
133 0.22
134 0.21
135 0.23
136 0.25
137 0.32
138 0.36
139 0.4
140 0.34
141 0.32
142 0.31
143 0.29
144 0.31
145 0.23
146 0.18
147 0.12
148 0.12
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.11
165 0.16
166 0.2
167 0.25
168 0.31
169 0.37
170 0.41
171 0.49
172 0.57
173 0.59
174 0.56
175 0.55
176 0.53
177 0.5
178 0.46
179 0.41
180 0.36
181 0.3
182 0.28
183 0.23
184 0.18
185 0.14
186 0.12
187 0.11
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.08
201 0.09
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.15
206 0.16
207 0.17
208 0.2
209 0.19
210 0.16
211 0.18
212 0.18
213 0.16
214 0.17
215 0.19
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.16
221 0.19
222 0.18
223 0.15
224 0.17
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.13
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.13
266 0.13
267 0.15
268 0.17
269 0.18
270 0.21
271 0.21
272 0.22
273 0.16
274 0.17
275 0.23
276 0.26
277 0.25
278 0.23
279 0.22
280 0.21
281 0.21
282 0.19
283 0.13
284 0.08
285 0.1
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.07
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.16
309 0.19
310 0.25
311 0.27
312 0.29
313 0.28
314 0.27
315 0.27
316 0.21
317 0.2
318 0.13
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.21
336 0.26
337 0.24
338 0.28
339 0.28
340 0.3
341 0.36
342 0.37
343 0.35
344 0.34
345 0.41
346 0.41
347 0.43
348 0.44
349 0.4
350 0.42
351 0.42
352 0.39
353 0.34
354 0.31
355 0.33
356 0.38
357 0.38
358 0.36
359 0.32
360 0.3
361 0.29
362 0.31
363 0.28
364 0.2
365 0.18
366 0.17
367 0.17
368 0.17
369 0.19
370 0.18
371 0.19
372 0.24
373 0.27
374 0.26
375 0.29
376 0.32
377 0.35
378 0.35
379 0.39
380 0.45
381 0.52
382 0.6
383 0.61
384 0.63
385 0.62
386 0.61
387 0.54
388 0.48
389 0.38
390 0.31
391 0.29
392 0.26
393 0.28
394 0.27
395 0.27
396 0.24
397 0.25
398 0.25
399 0.24
400 0.27
401 0.23
402 0.24
403 0.28
404 0.32
405 0.32
406 0.3
407 0.29
408 0.26
409 0.25
410 0.23
411 0.19
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.11
418 0.1
419 0.11
420 0.16