Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HA12

Protein Details
Accession C1HA12    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-327KGGGETRPRQRRPSKSSRIPQPGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-320RPRQRRPSKSS
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013964  DASH_Ask1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0042729  C:DASH complex  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0072686  C:mitotic spindle  
GO:0008608  P:attachment of spindle microtubules to kinetochore  
GO:0051301  P:cell division  
KEGG pbl:PAAG_07741  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08655  DASH_Ask1  
Amino Acid Sequences MSRPNPVQRNLTLTEELERLEQSITLTLQEIDHNFSRAHRIVTTSILPIVEQYAAQSREVWEGSKFWKQFFESSANVSLSGYEEHHPSESGQEGTFTEDSTFNTRNSTDDDVTESYATTSSGSLDHHRDDAPDLSSLTITPSHSTPRPRVHLERGNDDDITSSSINYPNPYEALHKVPQETPSRSRIAEPVTPGRTQRTHGVTHHGSQAPTFSVLAPSPTRGVPSTAKKAGKLTDPVLHRILDKTYRIQATPLASSRKQYYNPTRIITTPKSKPRSGYLDSSPISSPEFEVPKLHSEVFSSPIKGGGETRPRQRRPSKSSRIPQPGISVLTPAKHKQNASKPKSSRGWDSDDLDDGDDDDATSLFGNSPPKTIQFHIPQSRLLKTPAKEASKRIVSDLLYTAGGGEDNTDEFENSPSIVRRAAGLEDESL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.33
3 0.3
4 0.25
5 0.22
6 0.18
7 0.15
8 0.15
9 0.12
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.14
14 0.13
15 0.14
16 0.17
17 0.17
18 0.19
19 0.21
20 0.22
21 0.21
22 0.22
23 0.29
24 0.28
25 0.29
26 0.25
27 0.27
28 0.27
29 0.31
30 0.32
31 0.26
32 0.25
33 0.22
34 0.2
35 0.17
36 0.17
37 0.13
38 0.1
39 0.1
40 0.16
41 0.17
42 0.18
43 0.19
44 0.19
45 0.23
46 0.24
47 0.23
48 0.17
49 0.19
50 0.24
51 0.31
52 0.3
53 0.27
54 0.32
55 0.33
56 0.35
57 0.36
58 0.37
59 0.3
60 0.33
61 0.36
62 0.31
63 0.28
64 0.25
65 0.21
66 0.17
67 0.17
68 0.15
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.17
82 0.17
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.2
88 0.22
89 0.18
90 0.2
91 0.2
92 0.19
93 0.23
94 0.26
95 0.22
96 0.2
97 0.24
98 0.23
99 0.24
100 0.22
101 0.18
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.13
111 0.16
112 0.17
113 0.18
114 0.18
115 0.18
116 0.2
117 0.2
118 0.18
119 0.15
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.15
130 0.19
131 0.24
132 0.29
133 0.35
134 0.4
135 0.45
136 0.49
137 0.54
138 0.57
139 0.56
140 0.57
141 0.53
142 0.5
143 0.44
144 0.38
145 0.3
146 0.23
147 0.23
148 0.15
149 0.11
150 0.1
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.12
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.19
161 0.21
162 0.22
163 0.23
164 0.25
165 0.29
166 0.33
167 0.35
168 0.33
169 0.34
170 0.35
171 0.34
172 0.33
173 0.3
174 0.28
175 0.26
176 0.26
177 0.28
178 0.29
179 0.3
180 0.29
181 0.3
182 0.27
183 0.26
184 0.29
185 0.26
186 0.27
187 0.27
188 0.33
189 0.31
190 0.31
191 0.35
192 0.31
193 0.27
194 0.23
195 0.23
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.1
209 0.13
210 0.16
211 0.21
212 0.27
213 0.32
214 0.33
215 0.33
216 0.35
217 0.34
218 0.32
219 0.3
220 0.26
221 0.25
222 0.26
223 0.29
224 0.28
225 0.26
226 0.23
227 0.21
228 0.21
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.22
233 0.23
234 0.23
235 0.22
236 0.23
237 0.21
238 0.22
239 0.23
240 0.24
241 0.23
242 0.25
243 0.28
244 0.3
245 0.3
246 0.36
247 0.42
248 0.45
249 0.49
250 0.49
251 0.46
252 0.44
253 0.48
254 0.45
255 0.43
256 0.43
257 0.48
258 0.52
259 0.52
260 0.52
261 0.52
262 0.54
263 0.5
264 0.47
265 0.41
266 0.43
267 0.42
268 0.42
269 0.35
270 0.29
271 0.26
272 0.2
273 0.18
274 0.15
275 0.17
276 0.15
277 0.16
278 0.18
279 0.2
280 0.22
281 0.21
282 0.17
283 0.17
284 0.18
285 0.21
286 0.21
287 0.18
288 0.16
289 0.18
290 0.18
291 0.16
292 0.17
293 0.21
294 0.29
295 0.33
296 0.43
297 0.5
298 0.54
299 0.63
300 0.7
301 0.73
302 0.73
303 0.79
304 0.8
305 0.8
306 0.86
307 0.87
308 0.87
309 0.79
310 0.72
311 0.65
312 0.58
313 0.5
314 0.41
315 0.34
316 0.25
317 0.25
318 0.27
319 0.25
320 0.29
321 0.31
322 0.34
323 0.4
324 0.49
325 0.57
326 0.61
327 0.68
328 0.65
329 0.69
330 0.74
331 0.7
332 0.68
333 0.62
334 0.62
335 0.57
336 0.57
337 0.5
338 0.45
339 0.41
340 0.33
341 0.28
342 0.2
343 0.15
344 0.11
345 0.09
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.09
353 0.14
354 0.15
355 0.18
356 0.19
357 0.22
358 0.26
359 0.28
360 0.34
361 0.37
362 0.46
363 0.52
364 0.53
365 0.56
366 0.57
367 0.57
368 0.52
369 0.49
370 0.47
371 0.39
372 0.46
373 0.49
374 0.53
375 0.53
376 0.55
377 0.59
378 0.59
379 0.59
380 0.53
381 0.49
382 0.41
383 0.41
384 0.38
385 0.3
386 0.23
387 0.21
388 0.19
389 0.14
390 0.13
391 0.09
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.16
403 0.17
404 0.18
405 0.19
406 0.18
407 0.18
408 0.2
409 0.22
410 0.21