Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GTN1

Protein Details
Accession C1GTN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MASSPTRRSRRRRTAAPRYVTDVSHydrophilic
47-68SEPFEDTRRDKRRKDDDEEYEEAcidic
300-321MSRIENVSKRRPRRNREGWILNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-278PKGKRAGLSKK
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 11.5, cyto 4.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_01876  -  
Amino Acid Sequences MASSPTRRSRRRRTAAPRYVTDVSEVAGLEIESSQGERFSDEEDEASEPFEDTRRDKRRKDDDEEYEENGDNHVEGLAEEDDLISALDSDIKEYKAPKARSIPIGRVDEQDALATHSRGLYKSSAHGAKVTYLKLTFGASDEDLLPMVYARVRWTKGRDVTFPSRETLRGAFSMSTDEIGAAFGVNGDLFRKEATTGWDWYYDENTGGRFKKRQRTGTLTAEEGKKYLPRANAKKHTVLMGPASSQKVFEVGVGESLDFGEAWNEIRPKGKRAGLSKKGDRQSPEMPDIQGPSPLEAEQMSRIENVSKRRPRRNREGWILNLGNKIQCLSWAPNCSGTSQYLAIAVPISDLQKQLIDGTSSQGAPAFTPSAPYPSAIQIWSFESTKEEDDVRQLDMTVKPRLRQVICTDNGDVRRLSWCSMGREKREEDETDEKVNIGLLAGIWGDGTVKVLDVQLNKAASEAEYVHVHVPAFVSKPPSTLCTCFCWLSPSDLAVGTANGFVGVWSLSSPSNVNEPEATPLPYMYIPVHSSYILNITSSYPTYPHMIVTTGMDGKTKLFSLLDPRADVTEASRSRLGSYEVSYSPLLRTYICSDDTEFVRIQPLRRFFSTSSILQTYDLVSAIASGNLCHPSFLAGNVSGTVSVTNPLRRLMNPKEKHWQQTWFTHEWVPDKTVESGAEQKGALVGPGVSKFYDGFKAEIPGLIRKLTGDRRIVNGNLPMSIFEEGTAITGLAWNPNNECAGWACAGMGCGLLRVEDVTLQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.93
3 0.91
4 0.84
5 0.8
6 0.73
7 0.63
8 0.54
9 0.43
10 0.33
11 0.27
12 0.22
13 0.15
14 0.12
15 0.11
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.06
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.12
27 0.15
28 0.14
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.16
33 0.17
34 0.14
35 0.12
36 0.12
37 0.15
38 0.17
39 0.2
40 0.31
41 0.41
42 0.49
43 0.56
44 0.65
45 0.73
46 0.78
47 0.82
48 0.82
49 0.8
50 0.8
51 0.77
52 0.7
53 0.62
54 0.54
55 0.45
56 0.36
57 0.27
58 0.18
59 0.14
60 0.1
61 0.07
62 0.06
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.07
75 0.07
76 0.1
77 0.13
78 0.14
79 0.16
80 0.18
81 0.26
82 0.33
83 0.36
84 0.4
85 0.46
86 0.52
87 0.59
88 0.63
89 0.61
90 0.6
91 0.63
92 0.58
93 0.52
94 0.49
95 0.41
96 0.35
97 0.3
98 0.22
99 0.2
100 0.2
101 0.17
102 0.15
103 0.16
104 0.17
105 0.16
106 0.19
107 0.17
108 0.17
109 0.2
110 0.28
111 0.28
112 0.27
113 0.29
114 0.27
115 0.3
116 0.32
117 0.3
118 0.26
119 0.23
120 0.23
121 0.21
122 0.21
123 0.16
124 0.14
125 0.15
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.1
138 0.16
139 0.19
140 0.24
141 0.29
142 0.38
143 0.44
144 0.48
145 0.49
146 0.51
147 0.58
148 0.59
149 0.55
150 0.48
151 0.43
152 0.39
153 0.38
154 0.31
155 0.25
156 0.2
157 0.2
158 0.18
159 0.16
160 0.19
161 0.16
162 0.15
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.14
182 0.16
183 0.18
184 0.2
185 0.22
186 0.21
187 0.22
188 0.22
189 0.18
190 0.16
191 0.14
192 0.14
193 0.18
194 0.21
195 0.24
196 0.29
197 0.36
198 0.45
199 0.53
200 0.6
201 0.62
202 0.68
203 0.7
204 0.72
205 0.67
206 0.59
207 0.55
208 0.5
209 0.42
210 0.34
211 0.28
212 0.21
213 0.21
214 0.23
215 0.26
216 0.33
217 0.42
218 0.52
219 0.6
220 0.62
221 0.64
222 0.61
223 0.56
224 0.48
225 0.41
226 0.33
227 0.25
228 0.22
229 0.21
230 0.21
231 0.18
232 0.17
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.17
254 0.18
255 0.22
256 0.28
257 0.31
258 0.33
259 0.41
260 0.51
261 0.54
262 0.61
263 0.65
264 0.67
265 0.68
266 0.66
267 0.6
268 0.55
269 0.52
270 0.48
271 0.45
272 0.38
273 0.35
274 0.32
275 0.32
276 0.26
277 0.23
278 0.18
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.13
291 0.16
292 0.22
293 0.3
294 0.37
295 0.45
296 0.56
297 0.65
298 0.7
299 0.78
300 0.81
301 0.8
302 0.81
303 0.79
304 0.71
305 0.69
306 0.62
307 0.53
308 0.44
309 0.36
310 0.27
311 0.21
312 0.19
313 0.11
314 0.1
315 0.11
316 0.13
317 0.16
318 0.18
319 0.19
320 0.22
321 0.23
322 0.23
323 0.21
324 0.19
325 0.16
326 0.14
327 0.14
328 0.1
329 0.1
330 0.09
331 0.07
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.11
364 0.11
365 0.09
366 0.11
367 0.12
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.09
376 0.12
377 0.13
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.12
382 0.14
383 0.17
384 0.21
385 0.21
386 0.21
387 0.24
388 0.29
389 0.28
390 0.28
391 0.29
392 0.32
393 0.32
394 0.34
395 0.32
396 0.3
397 0.3
398 0.28
399 0.24
400 0.16
401 0.17
402 0.15
403 0.15
404 0.16
405 0.18
406 0.21
407 0.3
408 0.35
409 0.36
410 0.41
411 0.41
412 0.39
413 0.4
414 0.36
415 0.33
416 0.33
417 0.32
418 0.29
419 0.27
420 0.25
421 0.21
422 0.2
423 0.13
424 0.08
425 0.05
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.08
440 0.08
441 0.1
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.09
448 0.1
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.11
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.14
462 0.14
463 0.15
464 0.16
465 0.18
466 0.2
467 0.21
468 0.22
469 0.22
470 0.25
471 0.24
472 0.23
473 0.23
474 0.21
475 0.23
476 0.21
477 0.17
478 0.15
479 0.15
480 0.15
481 0.12
482 0.11
483 0.08
484 0.07
485 0.06
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.03
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.07
497 0.08
498 0.12
499 0.13
500 0.14
501 0.13
502 0.14
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.14
507 0.14
508 0.14
509 0.13
510 0.14
511 0.11
512 0.12
513 0.11
514 0.13
515 0.14
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.14
520 0.12
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.12
526 0.12
527 0.1
528 0.11
529 0.14
530 0.14
531 0.13
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.13
536 0.14
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.12
541 0.12
542 0.13
543 0.12
544 0.1
545 0.09
546 0.1
547 0.18
548 0.23
549 0.24
550 0.24
551 0.24
552 0.24
553 0.24
554 0.23
555 0.17
556 0.2
557 0.19
558 0.22
559 0.23
560 0.22
561 0.23
562 0.24
563 0.25
564 0.18
565 0.19
566 0.21
567 0.19
568 0.22
569 0.22
570 0.21
571 0.19
572 0.18
573 0.17
574 0.13
575 0.15
576 0.16
577 0.2
578 0.21
579 0.21
580 0.21
581 0.24
582 0.25
583 0.25
584 0.21
585 0.18
586 0.23
587 0.24
588 0.26
589 0.3
590 0.35
591 0.37
592 0.39
593 0.44
594 0.38
595 0.42
596 0.43
597 0.37
598 0.36
599 0.33
600 0.32
601 0.27
602 0.27
603 0.21
604 0.17
605 0.15
606 0.1
607 0.08
608 0.08
609 0.08
610 0.08
611 0.07
612 0.07
613 0.09
614 0.13
615 0.13
616 0.12
617 0.12
618 0.13
619 0.14
620 0.14
621 0.15
622 0.12
623 0.13
624 0.13
625 0.14
626 0.11
627 0.11
628 0.1
629 0.07
630 0.1
631 0.13
632 0.15
633 0.16
634 0.19
635 0.21
636 0.24
637 0.31
638 0.39
639 0.47
640 0.49
641 0.54
642 0.62
643 0.66
644 0.71
645 0.68
646 0.66
647 0.61
648 0.64
649 0.66
650 0.58
651 0.55
652 0.51
653 0.49
654 0.44
655 0.41
656 0.35
657 0.3
658 0.29
659 0.28
660 0.26
661 0.24
662 0.23
663 0.27
664 0.26
665 0.26
666 0.23
667 0.22
668 0.21
669 0.2
670 0.16
671 0.1
672 0.09
673 0.1
674 0.12
675 0.13
676 0.11
677 0.12
678 0.13
679 0.15
680 0.21
681 0.19
682 0.2
683 0.21
684 0.24
685 0.23
686 0.25
687 0.25
688 0.25
689 0.25
690 0.24
691 0.22
692 0.21
693 0.28
694 0.34
695 0.39
696 0.4
697 0.41
698 0.45
699 0.5
700 0.5
701 0.47
702 0.45
703 0.39
704 0.33
705 0.3
706 0.27
707 0.24
708 0.23
709 0.18
710 0.12
711 0.12
712 0.1
713 0.11
714 0.1
715 0.08
716 0.06
717 0.09
718 0.09
719 0.14
720 0.16
721 0.17
722 0.19
723 0.21
724 0.22
725 0.2
726 0.21
727 0.18
728 0.19
729 0.18
730 0.16
731 0.14
732 0.13
733 0.14
734 0.12
735 0.11
736 0.08
737 0.08
738 0.08
739 0.08
740 0.08
741 0.08