Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6QDA3

Protein Details
Accession W6QDA3    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-178PVQPGKKMPAKKRAHNVIEKRYRAHydrophilic
957-985VHTAPDRAMSKKRRTRRRKGESQSSESDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
160-167KKMPAKKR
966-976SKKRRTRRRKG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, plas 11, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR019006  Sre1_C  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0032933  P:SREBP signaling pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF09427  DUF2014  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11399  bHLHzip_scHMS1_like  
Amino Acid Sequences MSGPNMENDFQLFSSRNPGGDETRGNGHLFTHPVGENVNQDWTQWMRWDEPMFSEGDQKPMASSIDLPSISPQTDMSSPSHLNYGDFSPNLPLGLMEIPSEPNAGNNVGYTHRLPGPNRTSQQQPYGLVSPISSVGTSRKRKTGSDDDATTVTGPVQPGKKMPAKKRAHNVIEKRYRANLNDKIAELRDSVPSLRSPKNPNGGSADDDDEAEGANAANKLNKASILSKATEYIKHLEIRNQRLEDENTDLKNRLRQADKVADQAATSSGSVSSPSNYASTDSNSGTSPSVFSQAEDVSSESSPTSPNPPEGLLPVPDAWKRMRAETAKQGVFAESYIKYPSSSSSSHQPQYAREDTSTRRSRMPNKYMLGALAGLMVLEGMGSDDSESESKGLFSLPISLLGRFQTPTLAHCEFYLKQFWYSWQARAFSHFLILATLVVGSAFIVFVYLFNAQPITRRGPSKLATEGPAAPLTSSDFRRQAWLTSMQRVGVPRHRFFREWYVVTSRCFEYVLRCFMGWKVYSWATGITEEDEKGRVKTWDIAIDAQLTGGDAEISKSRLVLTIFAAGTLPCTPARMIIKALHVRILLWNVGEAGSWSFHVSNDIARALARFQWGVAREINSALPEGHPDQLPPHLAALIKLDCEDVMIDNIIQRAVNLTWNRPTQEGTGDDEVLLDVVDEDPAIQCSQDALAAWWSSHLLQTALLNYFEASGKGPVSKASRDAFKEKIRMSLDVAPVLSAAHTRALVMKAVFFEHNRIENVGAVLAALPKEKRKGSHSHSSNFLDSSLPVSVRDEISIAVRCAMIATIVTERSTGGVSSLPDSFTMEKAVSWFNQLPIDPVELSLIGFSSVYHLLHLLASDVDYIASSDSSPSAPASEAAISSADDEAEEKPRPNQKLSLCPRDIPNLGRVSAELIYWARNAYTPAFYGFSSTLVEVIVNSCTAICQNAGINVEDFVHTAPDRAMSKKRRTRRRKGESQSSESDADQDLIDYPVERPPLRRARSASNDTGYGSLSVEEDGRPIPHAPSNVQEVPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.24
4 0.25
5 0.28
6 0.29
7 0.33
8 0.34
9 0.3
10 0.34
11 0.35
12 0.33
13 0.3
14 0.27
15 0.26
16 0.26
17 0.24
18 0.23
19 0.21
20 0.22
21 0.23
22 0.24
23 0.23
24 0.21
25 0.26
26 0.21
27 0.21
28 0.24
29 0.25
30 0.24
31 0.26
32 0.27
33 0.25
34 0.3
35 0.33
36 0.3
37 0.3
38 0.29
39 0.26
40 0.24
41 0.3
42 0.26
43 0.28
44 0.27
45 0.24
46 0.23
47 0.24
48 0.24
49 0.16
50 0.18
51 0.15
52 0.21
53 0.21
54 0.21
55 0.22
56 0.24
57 0.23
58 0.21
59 0.19
60 0.17
61 0.18
62 0.21
63 0.2
64 0.23
65 0.24
66 0.24
67 0.28
68 0.24
69 0.23
70 0.23
71 0.24
72 0.23
73 0.22
74 0.22
75 0.21
76 0.21
77 0.2
78 0.18
79 0.13
80 0.11
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.12
89 0.11
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.14
96 0.17
97 0.17
98 0.19
99 0.23
100 0.28
101 0.29
102 0.37
103 0.42
104 0.49
105 0.51
106 0.51
107 0.53
108 0.53
109 0.59
110 0.54
111 0.49
112 0.45
113 0.45
114 0.42
115 0.34
116 0.29
117 0.23
118 0.19
119 0.17
120 0.12
121 0.11
122 0.17
123 0.27
124 0.35
125 0.38
126 0.44
127 0.47
128 0.49
129 0.57
130 0.6
131 0.59
132 0.58
133 0.57
134 0.52
135 0.5
136 0.47
137 0.39
138 0.29
139 0.21
140 0.15
141 0.13
142 0.15
143 0.18
144 0.18
145 0.21
146 0.28
147 0.34
148 0.41
149 0.5
150 0.56
151 0.61
152 0.69
153 0.76
154 0.8
155 0.81
156 0.82
157 0.83
158 0.83
159 0.84
160 0.79
161 0.73
162 0.69
163 0.65
164 0.6
165 0.6
166 0.56
167 0.54
168 0.53
169 0.5
170 0.46
171 0.43
172 0.39
173 0.32
174 0.26
175 0.21
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.21
180 0.26
181 0.3
182 0.35
183 0.39
184 0.45
185 0.54
186 0.53
187 0.52
188 0.51
189 0.48
190 0.44
191 0.4
192 0.35
193 0.26
194 0.25
195 0.21
196 0.16
197 0.13
198 0.1
199 0.07
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.16
211 0.21
212 0.23
213 0.24
214 0.23
215 0.27
216 0.28
217 0.27
218 0.28
219 0.26
220 0.26
221 0.29
222 0.3
223 0.34
224 0.4
225 0.45
226 0.49
227 0.47
228 0.44
229 0.44
230 0.46
231 0.41
232 0.39
233 0.36
234 0.31
235 0.32
236 0.33
237 0.3
238 0.32
239 0.33
240 0.33
241 0.32
242 0.33
243 0.38
244 0.45
245 0.45
246 0.44
247 0.42
248 0.36
249 0.32
250 0.29
251 0.23
252 0.14
253 0.12
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.12
266 0.14
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.17
272 0.16
273 0.15
274 0.13
275 0.11
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.15
292 0.15
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.18
297 0.19
298 0.2
299 0.15
300 0.16
301 0.15
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.22
307 0.22
308 0.22
309 0.28
310 0.29
311 0.34
312 0.41
313 0.48
314 0.42
315 0.42
316 0.4
317 0.34
318 0.3
319 0.25
320 0.19
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.17
331 0.24
332 0.3
333 0.32
334 0.35
335 0.34
336 0.33
337 0.39
338 0.41
339 0.34
340 0.29
341 0.31
342 0.31
343 0.4
344 0.44
345 0.38
346 0.41
347 0.45
348 0.54
349 0.6
350 0.63
351 0.61
352 0.56
353 0.56
354 0.5
355 0.44
356 0.35
357 0.25
358 0.18
359 0.09
360 0.07
361 0.05
362 0.04
363 0.03
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.02
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.08
383 0.08
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.13
388 0.14
389 0.15
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.18
396 0.18
397 0.17
398 0.17
399 0.21
400 0.18
401 0.2
402 0.23
403 0.18
404 0.18
405 0.18
406 0.19
407 0.24
408 0.25
409 0.27
410 0.26
411 0.27
412 0.26
413 0.3
414 0.3
415 0.22
416 0.21
417 0.17
418 0.13
419 0.12
420 0.12
421 0.07
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.02
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.03
433 0.03
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.09
441 0.12
442 0.15
443 0.18
444 0.19
445 0.21
446 0.26
447 0.28
448 0.29
449 0.3
450 0.26
451 0.25
452 0.26
453 0.24
454 0.21
455 0.19
456 0.16
457 0.12
458 0.1
459 0.11
460 0.12
461 0.13
462 0.15
463 0.16
464 0.16
465 0.2
466 0.2
467 0.2
468 0.2
469 0.26
470 0.25
471 0.27
472 0.28
473 0.25
474 0.26
475 0.26
476 0.26
477 0.26
478 0.3
479 0.29
480 0.34
481 0.36
482 0.36
483 0.36
484 0.42
485 0.4
486 0.35
487 0.35
488 0.35
489 0.34
490 0.34
491 0.34
492 0.26
493 0.2
494 0.19
495 0.17
496 0.15
497 0.17
498 0.19
499 0.17
500 0.17
501 0.17
502 0.17
503 0.2
504 0.16
505 0.13
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.13
510 0.13
511 0.1
512 0.1
513 0.09
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.13
525 0.14
526 0.16
527 0.16
528 0.16
529 0.15
530 0.16
531 0.14
532 0.11
533 0.09
534 0.06
535 0.05
536 0.04
537 0.03
538 0.03
539 0.04
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.08
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.12
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.09
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.06
558 0.07
559 0.07
560 0.11
561 0.13
562 0.13
563 0.14
564 0.15
565 0.22
566 0.24
567 0.25
568 0.23
569 0.21
570 0.21
571 0.2
572 0.19
573 0.13
574 0.1
575 0.1
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.05
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.09
594 0.08
595 0.09
596 0.1
597 0.08
598 0.08
599 0.11
600 0.13
601 0.14
602 0.15
603 0.15
604 0.14
605 0.15
606 0.16
607 0.12
608 0.12
609 0.1
610 0.09
611 0.09
612 0.1
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.11
617 0.13
618 0.14
619 0.12
620 0.11
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.13
625 0.11
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.08
630 0.09
631 0.08
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.06
637 0.07
638 0.07
639 0.06
640 0.05
641 0.07
642 0.07
643 0.13
644 0.14
645 0.16
646 0.21
647 0.23
648 0.25
649 0.24
650 0.25
651 0.2
652 0.23
653 0.22
654 0.21
655 0.21
656 0.2
657 0.19
658 0.17
659 0.16
660 0.12
661 0.1
662 0.05
663 0.03
664 0.03
665 0.03
666 0.03
667 0.03
668 0.04
669 0.05
670 0.05
671 0.04
672 0.04
673 0.05
674 0.05
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.09
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.07
687 0.07
688 0.08
689 0.1
690 0.11
691 0.11
692 0.1
693 0.09
694 0.1
695 0.1
696 0.09
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.09
701 0.1
702 0.13
703 0.16
704 0.17
705 0.21
706 0.22
707 0.27
708 0.31
709 0.35
710 0.38
711 0.4
712 0.46
713 0.42
714 0.46
715 0.42
716 0.39
717 0.39
718 0.39
719 0.35
720 0.29
721 0.28
722 0.21
723 0.19
724 0.17
725 0.14
726 0.08
727 0.07
728 0.06
729 0.06
730 0.07
731 0.09
732 0.1
733 0.12
734 0.12
735 0.12
736 0.12
737 0.14
738 0.15
739 0.14
740 0.16
741 0.17
742 0.2
743 0.2
744 0.2
745 0.19
746 0.18
747 0.18
748 0.14
749 0.11
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.08
755 0.09
756 0.12
757 0.17
758 0.2
759 0.23
760 0.27
761 0.36
762 0.42
763 0.51
764 0.54
765 0.54
766 0.58
767 0.59
768 0.55
769 0.46
770 0.39
771 0.29
772 0.23
773 0.21
774 0.16
775 0.13
776 0.11
777 0.13
778 0.14
779 0.14
780 0.14
781 0.12
782 0.1
783 0.13
784 0.15
785 0.14
786 0.13
787 0.12
788 0.11
789 0.11
790 0.11
791 0.08
792 0.05
793 0.07
794 0.08
795 0.09
796 0.09
797 0.09
798 0.09
799 0.1
800 0.1
801 0.08
802 0.07
803 0.09
804 0.09
805 0.11
806 0.12
807 0.12
808 0.11
809 0.14
810 0.14
811 0.13
812 0.14
813 0.12
814 0.12
815 0.13
816 0.16
817 0.14
818 0.18
819 0.19
820 0.19
821 0.22
822 0.21
823 0.22
824 0.21
825 0.23
826 0.17
827 0.16
828 0.15
829 0.12
830 0.12
831 0.1
832 0.08
833 0.06
834 0.06
835 0.05
836 0.07
837 0.09
838 0.09
839 0.09
840 0.09
841 0.1
842 0.1
843 0.1
844 0.08
845 0.06
846 0.07
847 0.07
848 0.06
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.07
857 0.07
858 0.08
859 0.08
860 0.09
861 0.09
862 0.09
863 0.11
864 0.11
865 0.1
866 0.1
867 0.11
868 0.1
869 0.1
870 0.1
871 0.08
872 0.07
873 0.08
874 0.09
875 0.14
876 0.16
877 0.16
878 0.23
879 0.31
880 0.35
881 0.38
882 0.43
883 0.45
884 0.54
885 0.61
886 0.65
887 0.6
888 0.6
889 0.59
890 0.59
891 0.56
892 0.48
893 0.46
894 0.4
895 0.37
896 0.33
897 0.3
898 0.26
899 0.23
900 0.2
901 0.16
902 0.13
903 0.14
904 0.14
905 0.15
906 0.12
907 0.12
908 0.15
909 0.15
910 0.16
911 0.15
912 0.17
913 0.19
914 0.18
915 0.2
916 0.18
917 0.17
918 0.16
919 0.15
920 0.13
921 0.12
922 0.12
923 0.09
924 0.09
925 0.09
926 0.07
927 0.07
928 0.07
929 0.07
930 0.08
931 0.09
932 0.08
933 0.08
934 0.1
935 0.13
936 0.15
937 0.16
938 0.16
939 0.15
940 0.16
941 0.15
942 0.14
943 0.11
944 0.13
945 0.12
946 0.12
947 0.12
948 0.16
949 0.19
950 0.24
951 0.33
952 0.39
953 0.5
954 0.59
955 0.69
956 0.75
957 0.83
958 0.89
959 0.91
960 0.92
961 0.93
962 0.93
963 0.94
964 0.93
965 0.89
966 0.84
967 0.77
968 0.68
969 0.57
970 0.49
971 0.39
972 0.3
973 0.22
974 0.17
975 0.13
976 0.12
977 0.12
978 0.11
979 0.11
980 0.14
981 0.19
982 0.2
983 0.22
984 0.32
985 0.42
986 0.45
987 0.52
988 0.53
989 0.58
990 0.67
991 0.71
992 0.68
993 0.62
994 0.59
995 0.53
996 0.48
997 0.39
998 0.3
999 0.23
1000 0.16
1001 0.12
1002 0.12
1003 0.11
1004 0.1
1005 0.11
1006 0.12
1007 0.12
1008 0.14
1009 0.15
1010 0.18
1011 0.21
1012 0.25
1013 0.26
1014 0.28
1015 0.36