FuNGI

C1GSM8

Protein Details

Accession

C1GSM8

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-54	NADPLVRPKKKPIPRPPGQGQPGG	Hydrophilic
530-553	SGTDTSRKKPKSKHHDAQPESRPI	Hydrophilic
562-581	QTQRKQGPDQHGRKRARNGP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-81	GPFIKIRRLNADPLVRPKKKPIPRPPGQGQPGGQAANGTAAPRPRPPLAVPRPKPLAKPK
424-432	FGKRVRKAL
470-483	KLEERAKKERAKES
500-521	RPKHTDPLNKKGAASHSTRKRP
536-543	RKKPKSKH
574-576	RKR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	pbl:PAAG_01523 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSATPPNPPTPARHPPPPGPNGPFIKIRRLNADPLVRPKKKPIPRPPGQGQPGGQAANGTAAPRPRPPLAVPRPKPLAKPKPITPSADDLTVNGFSGPLLSETYVDYPLITTKRAWREGLKHHIARFASKKNIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRTLNTGPATEKEGQVPRKQSELNEAEREELEAKKAAREKERAENLAQIAPSAATAPKKANAPKQRTQQVFKSEMTPEEMARARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETHAMFVLQNDGKMRMVPIDKWYKFITKNPFRTLSIEEAEKHMAKKNKDPRWFIEKEQVRIQKKALEQYAKQSRLFTGKREGFLGAGDGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGMFDEDEDVKTAEKRIKEDQLKANIFDLKDEKMYDEEENQEKKEKEELKNFGKRVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDEESSDDTETERLKEEQRKLEERAKKERAKESDKNSGVSTKGTNTPSGRPKHTDPLNKKGAASHSTRKRPGSPNLSEASGTDTSRKKPKSKHHDAQPESRPISPGPAAALQTQRKQGPDQHGRKRARNGPGSGSDGERAAGSGAEMSDGTTTVASKKLKLNPPAVKSRAGTPHGSRAGSPAVPAPTTRPSTPVPAPVGMPSNLTFPTASEIHSAIPAMGIASGELLKIFRPRIGDSKENHRKFIAIVRDVSIYGKEDRLLRPGVLKEGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.67
3	0.75
4	0.75
5	0.74
6	0.69
7	0.71
8	0.67
9	0.64
10	0.64
11	0.57
12	0.6
13	0.58
14	0.57
15	0.56
16	0.54
17	0.56
18	0.56
19	0.62
20	0.58
21	0.62
22	0.69
23	0.67
24	0.66
25	0.7
26	0.72
27	0.73
28	0.77
29	0.77
30	0.77
31	0.81
32	0.88
33	0.86
34	0.86
35	0.82
36	0.77
37	0.67
38	0.62
39	0.56
40	0.47
41	0.39
42	0.29
43	0.23
44	0.19
45	0.18
46	0.14
47	0.13
48	0.16
49	0.19
50	0.23
51	0.28
52	0.28
53	0.31
54	0.35
55	0.43
56	0.5
57	0.58
58	0.59
59	0.62
60	0.68
61	0.68
62	0.71
63	0.71
64	0.71
65	0.7
66	0.73
67	0.72
68	0.74
69	0.75
70	0.73
71	0.66
72	0.62
73	0.54
74	0.5
75	0.42
76	0.32
77	0.31
78	0.26
79	0.22
80	0.14
81	0.12
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.07
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.1
90	0.12
91	0.13
92	0.12
93	0.11
94	0.1
95	0.15
96	0.16
97	0.16
98	0.17
99	0.24
100	0.32
101	0.37
102	0.39
103	0.41
104	0.48
105	0.56
106	0.64
107	0.65
108	0.62
109	0.59
110	0.62
111	0.56
112	0.55
113	0.53
114	0.5
115	0.5
116	0.49
117	0.54
118	0.58
119	0.65
120	0.61
121	0.6
122	0.57
123	0.58
124	0.58
125	0.54
126	0.49
127	0.49
128	0.46
129	0.46
130	0.45
131	0.45
132	0.52
133	0.57
134	0.62
135	0.65
136	0.73
137	0.76
138	0.75
139	0.72
140	0.69
141	0.64
142	0.6
143	0.53
144	0.47
145	0.39
146	0.37
147	0.36
148	0.3
149	0.28
150	0.28
151	0.32
152	0.34
153	0.38
154	0.43
155	0.39
156	0.43
157	0.44
158	0.39
159	0.41
160	0.42
161	0.42
162	0.41
163	0.4
164	0.36
165	0.34
166	0.35
167	0.27
168	0.22
169	0.18
170	0.17
171	0.17
172	0.2
173	0.25
174	0.29
175	0.34
176	0.39
177	0.42
178	0.48
179	0.54
180	0.52
181	0.49
182	0.48
183	0.42
184	0.39
185	0.34
186	0.24
187	0.18
188	0.15
189	0.13
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.11
194	0.12
195	0.15
196	0.21
197	0.26
198	0.34
199	0.42
200	0.49
201	0.56
202	0.63
203	0.69
204	0.7
205	0.7
206	0.67
207	0.65
208	0.61
209	0.54
210	0.49
211	0.41
212	0.37
213	0.36
214	0.3
215	0.22
216	0.22
217	0.23
218	0.21
219	0.22
220	0.21
221	0.17
222	0.18
223	0.19
224	0.16
225	0.17
226	0.19
227	0.19
228	0.23
229	0.23
230	0.22
231	0.22
232	0.21
233	0.18
234	0.15
235	0.16
236	0.14
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.08
251	0.09
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.11
259	0.1
260	0.11
261	0.12
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.11
267	0.13
268	0.13
269	0.19
270	0.28
271	0.28
272	0.3
273	0.32
274	0.33
275	0.34
276	0.39
277	0.44
278	0.43
279	0.5
280	0.52
281	0.53
282	0.5
283	0.51
284	0.47
285	0.41
286	0.33
287	0.28
288	0.24
289	0.22
290	0.23
291	0.21
292	0.19
293	0.2
294	0.24
295	0.24
296	0.33
297	0.41
298	0.47
299	0.54
300	0.57
301	0.57
302	0.61
303	0.61
304	0.54
305	0.54
306	0.5
307	0.46
308	0.49
309	0.52
310	0.46
311	0.45
312	0.44
313	0.39
314	0.37
315	0.39
316	0.36
317	0.33
318	0.31
319	0.39
320	0.47
321	0.44
322	0.43
323	0.37
324	0.34
325	0.37
326	0.38
327	0.31
328	0.32
329	0.31
330	0.31
331	0.32
332	0.3
333	0.22
334	0.21
335	0.2
336	0.1
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.02
345	0.03
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.09
372	0.11
373	0.12
374	0.16
375	0.19
376	0.28
377	0.32
378	0.38
379	0.43
380	0.48
381	0.48
382	0.46
383	0.43
384	0.38
385	0.33
386	0.28
387	0.23
388	0.15
389	0.15
390	0.15
391	0.13
392	0.11
393	0.13
394	0.12
395	0.12
396	0.15
397	0.2
398	0.21
399	0.21
400	0.26
401	0.25
402	0.25
403	0.31
404	0.35
405	0.35
406	0.42
407	0.48
408	0.51
409	0.58
410	0.58
411	0.57
412	0.58
413	0.54
414	0.54
415	0.55
416	0.56
417	0.58
418	0.68
419	0.72
420	0.74
421	0.78
422	0.78
423	0.73
424	0.7
425	0.61
426	0.53
427	0.48
428	0.4
429	0.36
430	0.3
431	0.27
432	0.23
433	0.21
434	0.19
435	0.14
436	0.13
437	0.12
438	0.1
439	0.11
440	0.11
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.13
445	0.12
446	0.14
447	0.14
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.19
452	0.26
453	0.32
454	0.38
455	0.43
456	0.47
457	0.5
458	0.58
459	0.59
460	0.58
461	0.62
462	0.64
463	0.63
464	0.65
465	0.68
466	0.67
467	0.69
468	0.7
469	0.67
470	0.68
471	0.64
472	0.59
473	0.52
474	0.46
475	0.37
476	0.32
477	0.27
478	0.19
479	0.23
480	0.23
481	0.26
482	0.26
483	0.33
484	0.39
485	0.43
486	0.44
487	0.43
488	0.46
489	0.51
490	0.56
491	0.6
492	0.58
493	0.62
494	0.66
495	0.62
496	0.57
497	0.52
498	0.49
499	0.43
500	0.43
501	0.43
502	0.45
503	0.52
504	0.57
505	0.57
506	0.6
507	0.63
508	0.66
509	0.66
510	0.61
511	0.58
512	0.54
513	0.52
514	0.44
515	0.37
516	0.33
517	0.26
518	0.22
519	0.22
520	0.24
521	0.27
522	0.36
523	0.42
524	0.44
525	0.51
526	0.61
527	0.67
528	0.74
529	0.79
530	0.81
531	0.86
532	0.84
533	0.84
534	0.81
535	0.79
536	0.7
537	0.61
538	0.53
539	0.42
540	0.41
541	0.33
542	0.25
543	0.19
544	0.2
545	0.2
546	0.21
547	0.29
548	0.28
549	0.31
550	0.36
551	0.36
552	0.35
553	0.37
554	0.41
555	0.45
556	0.51
557	0.57
558	0.62
559	0.69
560	0.74
561	0.78
562	0.8
563	0.78
564	0.77
565	0.74
566	0.68
567	0.65
568	0.62
569	0.6
570	0.52
571	0.45
572	0.37
573	0.29
574	0.25
575	0.18
576	0.14
577	0.1
578	0.08
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.07
588	0.06
589	0.07
590	0.08
591	0.14
592	0.15
593	0.18
594	0.25
595	0.34
596	0.42
597	0.49
598	0.57
599	0.6
600	0.65
601	0.71
602	0.67
603	0.63
604	0.56
605	0.56
606	0.55
607	0.5
608	0.5
609	0.44
610	0.51
611	0.5
612	0.5
613	0.42
614	0.38
615	0.38
616	0.33
617	0.3
618	0.24
619	0.22
620	0.22
621	0.22
622	0.23
623	0.26
624	0.3
625	0.3
626	0.29
627	0.29
628	0.36
629	0.38
630	0.41
631	0.38
632	0.35
633	0.35
634	0.34
635	0.36
636	0.29
637	0.28
638	0.22
639	0.21
640	0.2
641	0.2
642	0.17
643	0.14
644	0.18
645	0.16
646	0.17
647	0.16
648	0.17
649	0.16
650	0.17
651	0.17
652	0.12
653	0.11
654	0.1
655	0.07
656	0.07
657	0.06
658	0.05
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.07
664	0.08
665	0.13
666	0.15
667	0.16
668	0.2
669	0.24
670	0.33
671	0.4
672	0.45
673	0.46
674	0.56
675	0.65
676	0.64
677	0.63
678	0.55
679	0.49
680	0.44
681	0.48
682	0.46
683	0.4
684	0.39
685	0.38
686	0.39
687	0.38
688	0.37
689	0.3
690	0.24
691	0.21
692	0.21
693	0.21
694	0.25
695	0.27
696	0.3
697	0.31
698	0.3
699	0.33
700	0.34

C1GSM8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer