Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDK0

Protein Details
Accession C1HDK0    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-110SSIQQQQQQQQKQKQKNPASNVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003323  OTU_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
KEGG pbl:PAAG_08841  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02338  OTU  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50802  OTU  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd22745  OTU_OTU1  
Amino Acid Sequences MRIRIRGPGGQSTIFLDENATIRDLQTKINEKTALASYDIKYGYPPKPLHLDQLDPAEFIRGIGTNLNGEQLIISKRETGPAAAVTSASSIQQQQQQQQKQKQKNPASNVALPGNSNRPVQTPQTAQTAQTTPSKSDIPKPLSLTRKENTTIENDPPEIPSPDHRGTVVLRIMPDDNSCLFRAVSSAVIGAMDAVTELRSIIAQTIQEQPELYTAAVLEKSPDDYCRWIQTEDSWGGGIELSILSKHFDVEICSIDVQSLRVDRFNEGRPTRCIVVYSGIHYDTIALSPSDEPYTHAYAPPEFDTKIFDAVDLVILERAVELCQILQAKHYFTDTASFRIRCNMCGGEFVGERGATKHATETGHYDFGEAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.26
3 0.19
4 0.17
5 0.18
6 0.18
7 0.17
8 0.13
9 0.13
10 0.19
11 0.19
12 0.21
13 0.28
14 0.35
15 0.37
16 0.43
17 0.44
18 0.38
19 0.41
20 0.4
21 0.34
22 0.28
23 0.3
24 0.25
25 0.29
26 0.29
27 0.25
28 0.25
29 0.3
30 0.3
31 0.34
32 0.34
33 0.32
34 0.4
35 0.41
36 0.47
37 0.44
38 0.44
39 0.38
40 0.45
41 0.41
42 0.34
43 0.32
44 0.26
45 0.22
46 0.19
47 0.17
48 0.09
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.11
56 0.1
57 0.09
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.15
63 0.15
64 0.19
65 0.19
66 0.17
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.14
71 0.14
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.12
79 0.18
80 0.22
81 0.28
82 0.37
83 0.45
84 0.53
85 0.61
86 0.68
87 0.72
88 0.77
89 0.8
90 0.8
91 0.8
92 0.78
93 0.77
94 0.73
95 0.66
96 0.61
97 0.53
98 0.44
99 0.36
100 0.32
101 0.27
102 0.24
103 0.22
104 0.19
105 0.2
106 0.22
107 0.25
108 0.27
109 0.25
110 0.25
111 0.31
112 0.31
113 0.29
114 0.29
115 0.28
116 0.25
117 0.28
118 0.27
119 0.21
120 0.23
121 0.25
122 0.23
123 0.29
124 0.35
125 0.34
126 0.36
127 0.4
128 0.44
129 0.48
130 0.51
131 0.5
132 0.43
133 0.42
134 0.41
135 0.37
136 0.32
137 0.3
138 0.29
139 0.26
140 0.27
141 0.24
142 0.22
143 0.22
144 0.21
145 0.18
146 0.15
147 0.16
148 0.21
149 0.21
150 0.21
151 0.2
152 0.2
153 0.19
154 0.23
155 0.21
156 0.15
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.13
162 0.11
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.12
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.14
212 0.16
213 0.19
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.2
218 0.24
219 0.21
220 0.2
221 0.15
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.13
249 0.15
250 0.17
251 0.21
252 0.26
253 0.33
254 0.34
255 0.37
256 0.38
257 0.41
258 0.4
259 0.37
260 0.32
261 0.24
262 0.27
263 0.24
264 0.24
265 0.22
266 0.21
267 0.2
268 0.18
269 0.18
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.16
281 0.21
282 0.2
283 0.22
284 0.22
285 0.22
286 0.25
287 0.26
288 0.24
289 0.2
290 0.19
291 0.22
292 0.21
293 0.23
294 0.2
295 0.17
296 0.15
297 0.14
298 0.16
299 0.11
300 0.11
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.09
311 0.11
312 0.11
313 0.15
314 0.17
315 0.19
316 0.2
317 0.22
318 0.19
319 0.18
320 0.25
321 0.22
322 0.26
323 0.31
324 0.31
325 0.3
326 0.39
327 0.4
328 0.34
329 0.38
330 0.35
331 0.29
332 0.31
333 0.32
334 0.27
335 0.27
336 0.26
337 0.23
338 0.19
339 0.19
340 0.18
341 0.19
342 0.15
343 0.16
344 0.18
345 0.19
346 0.21
347 0.23
348 0.27
349 0.29
350 0.32
351 0.31