FuNGI

W4JZD1

Protein Details

Accession

W4JZD1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
366-388	TSSSTSYRRSRPPRKQYKCDFCG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, cysk 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	hir:HETIRDRAFT_323844 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MDAIWVPPLGLIDYSPLQLGAALQPLPKQPTEAVRCDVIDTPDQPPGGAFDRFLKYPWSQGDSFLRLLPSGPQSCRYRASFGHSLCANRFVVTALNRLWALRSSDFALHRFIDTFWSPICCATPFWPHPIAATSSPLLSLPFPSSHIASNTFPSLCHSCHTMSDPSFALPSVFPLNNRNYPSWSKEIKAWLRLKGLWLLVSGDETAPVGTKEKPADPREVAEWKRNAQKAAGALLLSVEDQFRGILDGIEDDPIAIWTKLEEQFNKKSAGSRFNAMEDLFSIKKRNDESLQSLIHRVDESMRVLKNLRDWLRSQEAGRGAHLHGPLVVSSLRLEDAFRREDLNRARRSDPTDSAQALVASFPSSSTSSSTSYRRSRPPRKQYKCDFCGATGHTDDRCFKRINEELKKFKPQQAHSVQAPEASGPMQFAGNASFRSPAPSPSSTVPSLVTDLDWNADTGATSHMTPHRHWLRNYRPFVVPIRLADSSVIYSAGVGTVVFNPVVGGKRAQSVEFSNVLHVPDLGCNLLSVLYLTQHKHFSVLIEGSSMHFSRDGAVWFMAVVPDGSNNAYLQGTTSTVVLQSAGATSTLPLDLSLWHRRLCHHHHAGVQRMVKERLVTGLQLDSDVQPDPVCEPCLSGKMHAHPFPSTGSVTSKLLELVHSDLHGPLPVATHSGMRYWITFIDEFTKLKVVYVLRLKSDAFEAFKRYKAYVENLTGERILTLQDDKGGEYMSNAWDMFCLEHRIARRHTARNRP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.12
4	0.11
5	0.11
6	0.12
7	0.1
8	0.12
9	0.13
10	0.14
11	0.17
12	0.22
13	0.26
14	0.25
15	0.26
16	0.26
17	0.35
18	0.41
19	0.43
20	0.41
21	0.4
22	0.4
23	0.4
24	0.4
25	0.33
26	0.31
27	0.29
28	0.29
29	0.3
30	0.29
31	0.27
32	0.23
33	0.24
34	0.23
35	0.21
36	0.19
37	0.22
38	0.26
39	0.27
40	0.27
41	0.28
42	0.26
43	0.32
44	0.36
45	0.35
46	0.32
47	0.37
48	0.43
49	0.42
50	0.42
51	0.38
52	0.33
53	0.27
54	0.27
55	0.26
56	0.27
57	0.29
58	0.29
59	0.35
60	0.38
61	0.42
62	0.48
63	0.46
64	0.43
65	0.4
66	0.46
67	0.47
68	0.44
69	0.47
70	0.44
71	0.45
72	0.41
73	0.43
74	0.35
75	0.27
76	0.27
77	0.2
78	0.22
79	0.21
80	0.24
81	0.2
82	0.22
83	0.22
84	0.22
85	0.22
86	0.2
87	0.23
88	0.2
89	0.21
90	0.21
91	0.27
92	0.29
93	0.29
94	0.29
95	0.25
96	0.25
97	0.24
98	0.21
99	0.21
100	0.2
101	0.2
102	0.18
103	0.2
104	0.19
105	0.19
106	0.21
107	0.16
108	0.17
109	0.19
110	0.28
111	0.27
112	0.33
113	0.34
114	0.32
115	0.32
116	0.33
117	0.33
118	0.25
119	0.26
120	0.21
121	0.18
122	0.19
123	0.18
124	0.16
125	0.12
126	0.13
127	0.12
128	0.12
129	0.14
130	0.16
131	0.17
132	0.18
133	0.2
134	0.22
135	0.21
136	0.23
137	0.23
138	0.22
139	0.2
140	0.23
141	0.24
142	0.21
143	0.21
144	0.21
145	0.2
146	0.22
147	0.26
148	0.27
149	0.25
150	0.27
151	0.26
152	0.24
153	0.23
154	0.21
155	0.18
156	0.11
157	0.13
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.21
162	0.27
163	0.32
164	0.35
165	0.35
166	0.35
167	0.39
168	0.43
169	0.44
170	0.41
171	0.37
172	0.38
173	0.46
174	0.46
175	0.51
176	0.5
177	0.47
178	0.48
179	0.48
180	0.45
181	0.4
182	0.35
183	0.27
184	0.23
185	0.19
186	0.15
187	0.15
188	0.13
189	0.09
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.06
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.12
198	0.14
199	0.2
200	0.28
201	0.3
202	0.36
203	0.36
204	0.37
205	0.38
206	0.44
207	0.42
208	0.41
209	0.42
210	0.4
211	0.47
212	0.47
213	0.43
214	0.36
215	0.36
216	0.3
217	0.29
218	0.25
219	0.17
220	0.14
221	0.13
222	0.12
223	0.09
224	0.08
225	0.06
226	0.04
227	0.05
228	0.05
229	0.04
230	0.05
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.08
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.1
246	0.14
247	0.17
248	0.2
249	0.25
250	0.3
251	0.33
252	0.35
253	0.32
254	0.34
255	0.35
256	0.39
257	0.35
258	0.33
259	0.32
260	0.31
261	0.32
262	0.26
263	0.22
264	0.15
265	0.17
266	0.14
267	0.14
268	0.15
269	0.14
270	0.18
271	0.2
272	0.24
273	0.23
274	0.26
275	0.3
276	0.33
277	0.34
278	0.31
279	0.31
280	0.27
281	0.25
282	0.2
283	0.16
284	0.12
285	0.12
286	0.14
287	0.16
288	0.16
289	0.17
290	0.18
291	0.19
292	0.21
293	0.27
294	0.27
295	0.26
296	0.27
297	0.31
298	0.35
299	0.36
300	0.32
301	0.29
302	0.3
303	0.28
304	0.27
305	0.24
306	0.19
307	0.21
308	0.21
309	0.16
310	0.12
311	0.12
312	0.11
313	0.1
314	0.1
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.08
322	0.12
323	0.13
324	0.13
325	0.15
326	0.15
327	0.22
328	0.3
329	0.36
330	0.37
331	0.4
332	0.41
333	0.42
334	0.47
335	0.45
336	0.4
337	0.35
338	0.34
339	0.3
340	0.29
341	0.26
342	0.21
343	0.16
344	0.12
345	0.09
346	0.05
347	0.05
348	0.04
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.08
353	0.1
354	0.12
355	0.15
356	0.18
357	0.23
358	0.28
359	0.32
360	0.4
361	0.49
362	0.57
363	0.65
364	0.73
365	0.78
366	0.82
367	0.86
368	0.87
369	0.87
370	0.8
371	0.74
372	0.64
373	0.53
374	0.48
375	0.4
376	0.32
377	0.23
378	0.21
379	0.17
380	0.18
381	0.21
382	0.19
383	0.21
384	0.2
385	0.19
386	0.24
387	0.3
388	0.38
389	0.45
390	0.5
391	0.54
392	0.57
393	0.65
394	0.61
395	0.59
396	0.57
397	0.49
398	0.52
399	0.5
400	0.5
401	0.44
402	0.44
403	0.4
404	0.33
405	0.3
406	0.2
407	0.15
408	0.1
409	0.08
410	0.05
411	0.06
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.13
422	0.13
423	0.14
424	0.18
425	0.19
426	0.21
427	0.22
428	0.26
429	0.23
430	0.23
431	0.21
432	0.16
433	0.16
434	0.14
435	0.12
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.05
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.09
449	0.13
450	0.15
451	0.16
452	0.25
453	0.33
454	0.37
455	0.4
456	0.48
457	0.55
458	0.62
459	0.66
460	0.6
461	0.53
462	0.5
463	0.52
464	0.46
465	0.37
466	0.28
467	0.29
468	0.25
469	0.23
470	0.2
471	0.17
472	0.14
473	0.12
474	0.11
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.03
481	0.04
482	0.04
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.07
488	0.08
489	0.09
490	0.09
491	0.09
492	0.13
493	0.14
494	0.15
495	0.15
496	0.16
497	0.19
498	0.2
499	0.2
500	0.18
501	0.18
502	0.18
503	0.16
504	0.14
505	0.11
506	0.09
507	0.1
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.07
517	0.1
518	0.12
519	0.14
520	0.16
521	0.16
522	0.17
523	0.17
524	0.16
525	0.17
526	0.17
527	0.14
528	0.13
529	0.13
530	0.13
531	0.15
532	0.14
533	0.11
534	0.1
535	0.1
536	0.11
537	0.12
538	0.12
539	0.11
540	0.11
541	0.1
542	0.1
543	0.1
544	0.09
545	0.07
546	0.06
547	0.04
548	0.05
549	0.06
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.08
558	0.09
559	0.08
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.08
578	0.14
579	0.21
580	0.23
581	0.25
582	0.26
583	0.3
584	0.38
585	0.44
586	0.48
587	0.49
588	0.5
589	0.55
590	0.6
591	0.64
592	0.63
593	0.59
594	0.53
595	0.51
596	0.48
597	0.43
598	0.37
599	0.3
600	0.27
601	0.24
602	0.2
603	0.17
604	0.17
605	0.15
606	0.15
607	0.15
608	0.12
609	0.12
610	0.12
611	0.11
612	0.09
613	0.1
614	0.11
615	0.12
616	0.14
617	0.12
618	0.14
619	0.16
620	0.2
621	0.21
622	0.23
623	0.26
624	0.31
625	0.39
626	0.4
627	0.4
628	0.37
629	0.37
630	0.35
631	0.33
632	0.27
633	0.21
634	0.22
635	0.22
636	0.22
637	0.21
638	0.19
639	0.17
640	0.17
641	0.15
642	0.14
643	0.14
644	0.14
645	0.14
646	0.14
647	0.13
648	0.14
649	0.14
650	0.12
651	0.1
652	0.1
653	0.1
654	0.12
655	0.12
656	0.14
657	0.14
658	0.14
659	0.17
660	0.16
661	0.17
662	0.16
663	0.17
664	0.18
665	0.18
666	0.18
667	0.21
668	0.23
669	0.22
670	0.23
671	0.26
672	0.22
673	0.22
674	0.25
675	0.22
676	0.27
677	0.35
678	0.36
679	0.34
680	0.36
681	0.36
682	0.32
683	0.35
684	0.31
685	0.27
686	0.27
687	0.31
688	0.32
689	0.36
690	0.38
691	0.35
692	0.35
693	0.36
694	0.38
695	0.4
696	0.42
697	0.44
698	0.42
699	0.44
700	0.4
701	0.35
702	0.29
703	0.21
704	0.17
705	0.13
706	0.14
707	0.12
708	0.16
709	0.16
710	0.17
711	0.18
712	0.18
713	0.15
714	0.14
715	0.16
716	0.14
717	0.16
718	0.15
719	0.14
720	0.14
721	0.15
722	0.15
723	0.15
724	0.19
725	0.18
726	0.22
727	0.29
728	0.36
729	0.39
730	0.47
731	0.53
732	0.57

W4JZD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer