Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KFM5

Protein Details
Accession W4KFM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-270PSQPPPPKPRAPPKPKAKPASNKRVHDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
209-267QKRPAPAQPPRPPPPKPKPALPHKPTPAEKPPLALPSQPPPPKPRAPPKPKAKPASNKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027093  EAF_fam  
IPR019194  Tscrpt_elong_fac_Eaf_N  
Gene Ontology GO:0032783  C:super elongation complex  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG hir:HETIRDRAFT_473198  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09816  EAF  
Amino Acid Sequences MSSSTSPWSPAPGRYEVQMGQSLVKDLKMRMGTYNAKRALPEKDFYSFRYNFKPESIDPTKPGTIEVQQGKEGTGVRVERPTSQLNEAHEFEGDEKPAKDFECVLIYDPGMGTYTLEKLDSLISLNHKRRVTTRARPSASASPLPHAPEPPSNARSAFKAPTTEEIEAELLEGLEDADGEPDDEVPTRPLPQEEEEEEEEDIPIAAKFQKRPAPAQPPRPPPPKPKPALPHKPTPAEKPPLALPSQPPPPKPRAPPKPKAKPASNKRVHDDPDVEELEINRPSPVKRARASPPPPPPPPVQPTFSLALPTASGPDPLAHQAAFAPPVSPAPPLPAPLADSDDDEWDEVAAPITATMQPLTIVMTEDNGDDNDGGDDEDDEDEEGEEFDDIFQAQMEAVEMDEDDGDGLFPPDEPQPVSTGRPISMNALARGVADEDSDDYSSSSESDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.35
4 0.35
5 0.35
6 0.3
7 0.27
8 0.27
9 0.28
10 0.24
11 0.25
12 0.24
13 0.2
14 0.26
15 0.27
16 0.28
17 0.28
18 0.35
19 0.42
20 0.46
21 0.55
22 0.51
23 0.49
24 0.49
25 0.5
26 0.51
27 0.46
28 0.43
29 0.37
30 0.4
31 0.4
32 0.43
33 0.48
34 0.43
35 0.43
36 0.48
37 0.48
38 0.44
39 0.45
40 0.47
41 0.39
42 0.45
43 0.47
44 0.42
45 0.41
46 0.45
47 0.44
48 0.38
49 0.38
50 0.31
51 0.28
52 0.32
53 0.35
54 0.32
55 0.32
56 0.32
57 0.31
58 0.3
59 0.28
60 0.21
61 0.2
62 0.2
63 0.2
64 0.25
65 0.26
66 0.25
67 0.28
68 0.32
69 0.3
70 0.33
71 0.34
72 0.33
73 0.38
74 0.37
75 0.33
76 0.29
77 0.26
78 0.24
79 0.23
80 0.2
81 0.18
82 0.16
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.15
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.1
110 0.16
111 0.25
112 0.3
113 0.37
114 0.37
115 0.39
116 0.41
117 0.47
118 0.5
119 0.51
120 0.57
121 0.6
122 0.61
123 0.62
124 0.63
125 0.62
126 0.57
127 0.52
128 0.43
129 0.35
130 0.35
131 0.36
132 0.32
133 0.26
134 0.25
135 0.23
136 0.27
137 0.3
138 0.3
139 0.28
140 0.29
141 0.29
142 0.29
143 0.29
144 0.26
145 0.21
146 0.22
147 0.22
148 0.25
149 0.29
150 0.26
151 0.23
152 0.21
153 0.2
154 0.17
155 0.16
156 0.11
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.13
178 0.14
179 0.17
180 0.17
181 0.21
182 0.2
183 0.21
184 0.2
185 0.18
186 0.15
187 0.12
188 0.1
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.07
193 0.09
194 0.11
195 0.16
196 0.22
197 0.23
198 0.28
199 0.35
200 0.43
201 0.47
202 0.56
203 0.6
204 0.63
205 0.69
206 0.71
207 0.69
208 0.68
209 0.71
210 0.7
211 0.64
212 0.63
213 0.64
214 0.68
215 0.74
216 0.69
217 0.68
218 0.63
219 0.67
220 0.62
221 0.6
222 0.56
223 0.51
224 0.47
225 0.4
226 0.37
227 0.32
228 0.31
229 0.26
230 0.21
231 0.21
232 0.29
233 0.3
234 0.31
235 0.33
236 0.38
237 0.43
238 0.49
239 0.55
240 0.57
241 0.64
242 0.71
243 0.78
244 0.82
245 0.84
246 0.84
247 0.83
248 0.82
249 0.83
250 0.84
251 0.82
252 0.75
253 0.71
254 0.7
255 0.64
256 0.57
257 0.5
258 0.42
259 0.38
260 0.35
261 0.3
262 0.24
263 0.22
264 0.2
265 0.18
266 0.15
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.19
271 0.25
272 0.28
273 0.3
274 0.36
275 0.42
276 0.51
277 0.55
278 0.57
279 0.6
280 0.62
281 0.62
282 0.6
283 0.57
284 0.54
285 0.55
286 0.5
287 0.43
288 0.37
289 0.37
290 0.35
291 0.32
292 0.26
293 0.2
294 0.17
295 0.14
296 0.13
297 0.11
298 0.09
299 0.1
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.1
317 0.13
318 0.14
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.19
325 0.15
326 0.16
327 0.15
328 0.16
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.1
333 0.1
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.08
398 0.1
399 0.12
400 0.13
401 0.14
402 0.17
403 0.2
404 0.22
405 0.25
406 0.26
407 0.25
408 0.26
409 0.26
410 0.27
411 0.31
412 0.32
413 0.29
414 0.27
415 0.26
416 0.24
417 0.24
418 0.21
419 0.15
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.14
424 0.14
425 0.13
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.12