Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HA40

Protein Details
Accession C1HA40    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-102IDLVAVPRTHRRRREKKLMSMDEVNHydrophilic
351-378SGFPRATSEPRPRRQRPPAQPNPPDSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-93RRRREK
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5, golg 3, mito 2, extr 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG pbl:PAAG_07769  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16473  RING-H2_RNF103  
Amino Acid Sequences MVTSTPTATSPIGVTTSAASGGEGGGGGGPTSSPLLFFIALGFGVVFTNLWIIVGVKYCFRYNQRNRQIRAEDAGEPIDLVAVPRTHRRRREKKLMSMDEVNSRFPLMKYKAWRASRADEGLPTSGGIQAPSSRSASLNEGLNISVRAATPSESKGHAALADPTDTIESSRETKLEPESESAILPAEQMEIRTSGVESRLSSEHLKESSGGLEDDDDHDEHISNAVPTELLANPGDTCAICLDIIEDDDDIRGLSCGHAFHASCVDPWLTSRRACCPLCKKDYYVPKPQPEGAEGTTQNISTNRSRRNGNRNNDITEPERAFIGDRGNPFVSRLALPGRFISVVPADERVSGFPRATSEPRPRRQRPPAQPNPPDSTTNPGSPTSWRSRLNSFRFPSPSLPNIRLPGRSRSADEPPSNASMQPTPRQLEAGPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.09
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.04
16 0.04
17 0.05
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.08
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.05
34 0.04
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.07
41 0.11
42 0.12
43 0.14
44 0.17
45 0.18
46 0.24
47 0.3
48 0.39
49 0.46
50 0.57
51 0.65
52 0.72
53 0.74
54 0.78
55 0.77
56 0.69
57 0.64
58 0.57
59 0.48
60 0.41
61 0.38
62 0.28
63 0.23
64 0.18
65 0.14
66 0.1
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.21
72 0.3
73 0.39
74 0.49
75 0.59
76 0.68
77 0.77
78 0.86
79 0.86
80 0.88
81 0.9
82 0.87
83 0.82
84 0.77
85 0.69
86 0.67
87 0.58
88 0.49
89 0.38
90 0.32
91 0.27
92 0.22
93 0.28
94 0.23
95 0.28
96 0.34
97 0.43
98 0.51
99 0.53
100 0.59
101 0.55
102 0.56
103 0.56
104 0.53
105 0.45
106 0.37
107 0.35
108 0.3
109 0.25
110 0.2
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.13
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.15
123 0.18
124 0.19
125 0.19
126 0.17
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.14
131 0.11
132 0.09
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.14
161 0.16
162 0.18
163 0.17
164 0.16
165 0.18
166 0.18
167 0.17
168 0.15
169 0.13
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.1
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.06
216 0.05
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.13
252 0.12
253 0.09
254 0.11
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.18
259 0.23
260 0.3
261 0.31
262 0.38
263 0.44
264 0.5
265 0.55
266 0.56
267 0.55
268 0.54
269 0.65
270 0.62
271 0.63
272 0.62
273 0.61
274 0.62
275 0.6
276 0.54
277 0.45
278 0.43
279 0.34
280 0.31
281 0.26
282 0.25
283 0.23
284 0.21
285 0.21
286 0.18
287 0.2
288 0.21
289 0.28
290 0.32
291 0.35
292 0.42
293 0.49
294 0.59
295 0.65
296 0.66
297 0.69
298 0.67
299 0.68
300 0.63
301 0.58
302 0.5
303 0.46
304 0.39
305 0.29
306 0.25
307 0.21
308 0.2
309 0.18
310 0.2
311 0.18
312 0.18
313 0.23
314 0.24
315 0.24
316 0.24
317 0.23
318 0.21
319 0.18
320 0.19
321 0.19
322 0.19
323 0.2
324 0.2
325 0.2
326 0.19
327 0.18
328 0.18
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.16
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.16
337 0.17
338 0.18
339 0.17
340 0.16
341 0.18
342 0.23
343 0.27
344 0.33
345 0.41
346 0.49
347 0.59
348 0.69
349 0.72
350 0.78
351 0.84
352 0.87
353 0.87
354 0.88
355 0.89
356 0.89
357 0.9
358 0.86
359 0.83
360 0.75
361 0.68
362 0.59
363 0.55
364 0.49
365 0.44
366 0.4
367 0.34
368 0.32
369 0.32
370 0.37
371 0.38
372 0.42
373 0.43
374 0.45
375 0.53
376 0.61
377 0.65
378 0.68
379 0.63
380 0.64
381 0.64
382 0.64
383 0.61
384 0.57
385 0.57
386 0.54
387 0.54
388 0.51
389 0.52
390 0.52
391 0.54
392 0.51
393 0.52
394 0.52
395 0.51
396 0.5
397 0.5
398 0.55
399 0.57
400 0.55
401 0.51
402 0.48
403 0.49
404 0.45
405 0.4
406 0.36
407 0.32
408 0.36
409 0.39
410 0.42
411 0.41
412 0.4
413 0.42