Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JSX2

Protein Details
Accession W4JSX2    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-45QNARRAKALGEQKRRRAQRIEHydrophilic
109-140IPDASMEVRKKQKKRKGHTKAQPQPKVKKPSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-40QKRRR
117-138RKKQKKRKGHTKAQPQPKVKKP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017336  Snurportin-1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0061015  P:snRNA import into nucleus  
KEGG hir:HETIRDRAFT_330264  -  
Amino Acid Sequences MNAFTERKASYKQPPNSITDRMLSQNARRAKALGEQKRRRAQRIESERHIDLFADLTLGPSDDEVDIKRRGHQSTADEDTIVREGVGQFATLLQPGPSVSAPEPHVEDIPDASMEVRKKQKKRKGHTKAQPQPKVKKPSPWADRCMYAELLEMKEMEPWVMASERGEGHADGLPDDLQTGWVAVAPVPVGKRCLAVSHFGSGVVGVVPNTTLRSRVLGKPLMPRFPSPLPSDTVLDCILDQNWKVNGVIHVLDVLKWKGQDVADCETSFRFWWRDTRLSELPPPRPPTNVAPIAPTSNTLGGVAEGYHFPYPTSFLPVSYHVDTTAANLISHVIPLARSPYTVSVSVPVSAPHPQSEAAMDVETTQPTVRSIQTDVKSDGLLLYVAQAIYEPGTSPLSSWVPITGPIQEDVKAGESGLEMPIDQAESASRSPLDVFERLVNLMSVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.67
3 0.68
4 0.66
5 0.59
6 0.51
7 0.47
8 0.41
9 0.43
10 0.42
11 0.41
12 0.44
13 0.48
14 0.48
15 0.46
16 0.43
17 0.39
18 0.43
19 0.48
20 0.5
21 0.54
22 0.61
23 0.7
24 0.78
25 0.83
26 0.82
27 0.79
28 0.78
29 0.78
30 0.79
31 0.78
32 0.76
33 0.76
34 0.7
35 0.63
36 0.54
37 0.44
38 0.33
39 0.25
40 0.17
41 0.12
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.07
48 0.09
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.15
53 0.19
54 0.2
55 0.26
56 0.31
57 0.33
58 0.35
59 0.39
60 0.39
61 0.42
62 0.47
63 0.42
64 0.36
65 0.34
66 0.32
67 0.28
68 0.22
69 0.15
70 0.1
71 0.09
72 0.11
73 0.11
74 0.09
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.11
86 0.11
87 0.15
88 0.16
89 0.18
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.17
94 0.17
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.09
99 0.08
100 0.12
101 0.13
102 0.19
103 0.28
104 0.36
105 0.45
106 0.56
107 0.65
108 0.71
109 0.81
110 0.86
111 0.87
112 0.89
113 0.9
114 0.91
115 0.91
116 0.91
117 0.9
118 0.87
119 0.86
120 0.84
121 0.84
122 0.76
123 0.76
124 0.72
125 0.73
126 0.75
127 0.72
128 0.68
129 0.61
130 0.61
131 0.54
132 0.5
133 0.4
134 0.3
135 0.26
136 0.22
137 0.19
138 0.16
139 0.14
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.09
155 0.1
156 0.12
157 0.12
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.12
181 0.12
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.11
189 0.1
190 0.06
191 0.05
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.09
201 0.13
202 0.15
203 0.2
204 0.21
205 0.24
206 0.31
207 0.34
208 0.36
209 0.34
210 0.32
211 0.32
212 0.32
213 0.33
214 0.27
215 0.26
216 0.23
217 0.23
218 0.24
219 0.19
220 0.19
221 0.16
222 0.13
223 0.11
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.15
249 0.18
250 0.19
251 0.2
252 0.2
253 0.18
254 0.18
255 0.16
256 0.15
257 0.12
258 0.12
259 0.18
260 0.23
261 0.29
262 0.3
263 0.37
264 0.38
265 0.39
266 0.45
267 0.46
268 0.45
269 0.46
270 0.5
271 0.44
272 0.42
273 0.43
274 0.4
275 0.41
276 0.41
277 0.35
278 0.31
279 0.31
280 0.31
281 0.28
282 0.24
283 0.18
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.11
299 0.11
300 0.17
301 0.15
302 0.15
303 0.18
304 0.21
305 0.25
306 0.24
307 0.24
308 0.17
309 0.18
310 0.17
311 0.17
312 0.19
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.13
319 0.11
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.14
328 0.17
329 0.18
330 0.17
331 0.17
332 0.18
333 0.18
334 0.17
335 0.14
336 0.13
337 0.17
338 0.18
339 0.16
340 0.17
341 0.16
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.14
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.18
359 0.25
360 0.28
361 0.33
362 0.33
363 0.32
364 0.3
365 0.28
366 0.24
367 0.17
368 0.13
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.15
384 0.16
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.15
389 0.17
390 0.18
391 0.16
392 0.17
393 0.18
394 0.19
395 0.18
396 0.18
397 0.17
398 0.19
399 0.15
400 0.13
401 0.12
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.11
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.11
414 0.12
415 0.14
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.18
420 0.21
421 0.2
422 0.22
423 0.23
424 0.25
425 0.25
426 0.25