Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JZC6

Protein Details
Accession W4JZC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-262IDATRKRNAESQKRKFDGKRTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
KEGG hir:HETIRDRAFT_172497  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MSGQASTSTDPPSATVQPRRGKVKLPDNYTGNRIESQKFMLQCLLLFAAESDRYKTNQDKISLVLSCMRYGMAGAWAENFLLKSVGADPPADLGTWRDFLTKFKLQFREMGKTDKARSALMAFSQGRMMVDEYSNQFILIAADADISDKEQVPYFQRGLDPRVMDKIYDKEVQPKDTIQDWINTACEIDGRLRARSAQKAILANSTSFHSDYLNHFHSQPTVHYNSTNAPRKMNNQVVDMDIDATRKRNAESQKRKFDGKRTASCSNCGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.38
3 0.44
4 0.51
5 0.58
6 0.64
7 0.61
8 0.63
9 0.65
10 0.67
11 0.67
12 0.66
13 0.67
14 0.64
15 0.66
16 0.61
17 0.55
18 0.47
19 0.43
20 0.39
21 0.34
22 0.31
23 0.32
24 0.33
25 0.31
26 0.3
27 0.27
28 0.24
29 0.22
30 0.21
31 0.17
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.16
40 0.17
41 0.22
42 0.27
43 0.31
44 0.35
45 0.36
46 0.35
47 0.35
48 0.38
49 0.34
50 0.3
51 0.28
52 0.23
53 0.21
54 0.2
55 0.18
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.14
87 0.21
88 0.25
89 0.26
90 0.32
91 0.36
92 0.35
93 0.4
94 0.42
95 0.43
96 0.4
97 0.41
98 0.37
99 0.37
100 0.38
101 0.36
102 0.33
103 0.25
104 0.24
105 0.2
106 0.18
107 0.14
108 0.18
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.06
127 0.05
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.08
139 0.11
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.17
144 0.18
145 0.21
146 0.23
147 0.21
148 0.19
149 0.22
150 0.21
151 0.19
152 0.2
153 0.2
154 0.2
155 0.22
156 0.21
157 0.27
158 0.29
159 0.31
160 0.3
161 0.28
162 0.27
163 0.26
164 0.28
165 0.2
166 0.2
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.16
171 0.13
172 0.1
173 0.1
174 0.08
175 0.09
176 0.13
177 0.14
178 0.16
179 0.16
180 0.21
181 0.25
182 0.3
183 0.32
184 0.3
185 0.32
186 0.34
187 0.35
188 0.36
189 0.32
190 0.27
191 0.24
192 0.22
193 0.2
194 0.17
195 0.16
196 0.12
197 0.13
198 0.16
199 0.23
200 0.24
201 0.23
202 0.24
203 0.24
204 0.25
205 0.25
206 0.24
207 0.24
208 0.24
209 0.25
210 0.25
211 0.26
212 0.31
213 0.39
214 0.46
215 0.4
216 0.41
217 0.43
218 0.48
219 0.56
220 0.57
221 0.51
222 0.44
223 0.44
224 0.41
225 0.39
226 0.33
227 0.26
228 0.18
229 0.18
230 0.16
231 0.17
232 0.18
233 0.19
234 0.2
235 0.26
236 0.35
237 0.45
238 0.54
239 0.62
240 0.71
241 0.73
242 0.81
243 0.8
244 0.79
245 0.79
246 0.78
247 0.77
248 0.74
249 0.79
250 0.73