Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GVL2

Protein Details
Accession C1GVL2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-108TLNQVRRGCRKGKRKRKPTSPALVGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-103CRKGKRKRKPTSP
122-129KPKKPNSG
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 5.5, cyto_nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006032  Ribosomal_S12/S23  
IPR005679  Ribosomal_S12_bac  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG pbl:PAAG_02289  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00164  Ribosom_S12_S23  
CDD cd03368  Ribosomal_S12  
Amino Acid Sequences MSPATPSAGTLRLLRHFIARTPSSLSPLSTSAKRTFSLLCRPPTTATPTSTFRKPAYHLKIPNPISLSPQARQFSTTPCQNATLNQVRRGCRKGKRKRKPTSPALVGRPQMRGVCLKTGITKPKKPNSGERKTARIRLTNGAVVTGYIPGEGHNIQQHSVVLIRGGRAQDCPGVRYHLVRGALDLSGVGNRITSRSKYGTKKPKSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.29
4 0.31
5 0.36
6 0.33
7 0.31
8 0.35
9 0.35
10 0.34
11 0.33
12 0.31
13 0.25
14 0.27
15 0.29
16 0.26
17 0.3
18 0.3
19 0.31
20 0.31
21 0.3
22 0.31
23 0.33
24 0.4
25 0.42
26 0.44
27 0.44
28 0.45
29 0.45
30 0.45
31 0.47
32 0.4
33 0.36
34 0.34
35 0.37
36 0.39
37 0.4
38 0.41
39 0.35
40 0.35
41 0.36
42 0.42
43 0.45
44 0.49
45 0.52
46 0.54
47 0.61
48 0.59
49 0.58
50 0.51
51 0.43
52 0.38
53 0.39
54 0.37
55 0.29
56 0.34
57 0.32
58 0.29
59 0.31
60 0.28
61 0.27
62 0.29
63 0.31
64 0.26
65 0.26
66 0.28
67 0.26
68 0.26
69 0.28
70 0.32
71 0.31
72 0.35
73 0.39
74 0.4
75 0.44
76 0.47
77 0.48
78 0.47
79 0.56
80 0.61
81 0.67
82 0.75
83 0.81
84 0.87
85 0.9
86 0.9
87 0.88
88 0.86
89 0.82
90 0.77
91 0.71
92 0.66
93 0.57
94 0.5
95 0.42
96 0.35
97 0.27
98 0.23
99 0.21
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.17
105 0.22
106 0.3
107 0.34
108 0.4
109 0.46
110 0.53
111 0.6
112 0.6
113 0.65
114 0.66
115 0.68
116 0.7
117 0.66
118 0.67
119 0.65
120 0.69
121 0.62
122 0.57
123 0.52
124 0.48
125 0.47
126 0.4
127 0.36
128 0.29
129 0.24
130 0.19
131 0.16
132 0.11
133 0.08
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.13
146 0.14
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.16
156 0.2
157 0.2
158 0.21
159 0.19
160 0.24
161 0.24
162 0.25
163 0.26
164 0.27
165 0.28
166 0.26
167 0.26
168 0.22
169 0.21
170 0.18
171 0.15
172 0.11
173 0.09
174 0.1
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.12
179 0.16
180 0.18
181 0.23
182 0.29
183 0.38
184 0.45
185 0.56
186 0.63