FuNGI

W4KHL9

Protein Details

Accession

W4KHL9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
680-699	IDQLKGPRRQKSTQRLKDVH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
KEGG	hir:HETIRDRAFT_314642 -
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MDYGDEWSSILTDHPIFSRSTGPAQDETSFELSTSTLPNFTNLDPEDDSLAPSGRRQTMVIKDSEVILAVGREMRVAALGDAKFNRGPKAYKVLHTPNVQFEIHQLALNPSGKLLAVAGAFQVAVVVLPRPGFTRLVPATIDCKSIQVGQFYHGSMSAAPIAKVEWHPWGEAGSTLMVMTVDGKLREYDISVDTEEPQQVVSFVPEKKGTSFVASAQSEREVASFTLGKGRADWGPLTMYVVMKSGDVFAKCPYMPHNASIPSAYIHSLECFVAAKKEYLSQSISIEAKDLSTTYDYQHKYVSALLKQLPPGTLFPAPSRSVLVHPPTTIKSPSIRHGPFLLQPSPRILEGSESGDATDIMYMSFGSSAEDDEGETERLGIILIGYQDGKVDICLDVEKVEARWESKQHQSKDLPMLAVYESIDLGLLSALSSYHPPLLDLLKANHLVFHADPIHDDTIYVYHAFGVHALHLNNMLRSLAIALRGDDEGNSLIASLRNPEQTDVKPIVTTFSVERRVSNPVIAVAVPNDVYLTYSIFILTSAMRVVSFSLNLRSDIPLSHPIGPTPQRERIIDEPLLKPVDGPAAYISLLGSNPFEPPPVFSRSSGLPSNPHLALPASETSKEFRLTPDTLRFLGQTVERFTTQIRDVQLADREVQLRAALQKQEHQRQSDKFQEMKMLIDQLKGPRRQKSTQRLKDVHDAQTLLLSRLSRVLQAMMKKASPELSDHETKWFEELKRMKAEVLGQGRYDEAALLPRSRMLQHEFNRLIPHLKVERDKESNRSRILQEQNQDLGASQAFELGQHFTKEELRIRKMQKELVNLASKLEVSLVRPPNRSRAAVRNQVME

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.17
4	0.18
5	0.23
6	0.22
7	0.26
8	0.28
9	0.31
10	0.32
11	0.35
12	0.35
13	0.31
14	0.32
15	0.3
16	0.26
17	0.22
18	0.2
19	0.17
20	0.17
21	0.19
22	0.15
23	0.14
24	0.15
25	0.17
26	0.2
27	0.19
28	0.25
29	0.23
30	0.27
31	0.26
32	0.27
33	0.28
34	0.25
35	0.26
36	0.2
37	0.22
38	0.17
39	0.18
40	0.24
41	0.23
42	0.25
43	0.25
44	0.31
45	0.38
46	0.42
47	0.42
48	0.37
49	0.35
50	0.34
51	0.33
52	0.26
53	0.17
54	0.13
55	0.11
56	0.09
57	0.1
58	0.09
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.13
66	0.14
67	0.18
68	0.19
69	0.23
70	0.24
71	0.26
72	0.29
73	0.28
74	0.31
75	0.32
76	0.41
77	0.43
78	0.44
79	0.51
80	0.55
81	0.58
82	0.61
83	0.59
84	0.55
85	0.54
86	0.5
87	0.41
88	0.35
89	0.34
90	0.28
91	0.25
92	0.2
93	0.18
94	0.24
95	0.26
96	0.24
97	0.17
98	0.17
99	0.16
100	0.15
101	0.13
102	0.09
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.06
110	0.04
111	0.04
112	0.04
113	0.05
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.09
118	0.12
119	0.13
120	0.13
121	0.22
122	0.22
123	0.24
124	0.24
125	0.24
126	0.26
127	0.26
128	0.28
129	0.19
130	0.19
131	0.18
132	0.22
133	0.22
134	0.22
135	0.22
136	0.22
137	0.24
138	0.23
139	0.22
140	0.18
141	0.16
142	0.12
143	0.13
144	0.15
145	0.13
146	0.13
147	0.12
148	0.12
149	0.15
150	0.16
151	0.16
152	0.17
153	0.18
154	0.18
155	0.18
156	0.19
157	0.16
158	0.15
159	0.14
160	0.09
161	0.08
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.05
166	0.06
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.12
177	0.14
178	0.14
179	0.15
180	0.15
181	0.17
182	0.17
183	0.14
184	0.13
185	0.11
186	0.1
187	0.09
188	0.1
189	0.13
190	0.14
191	0.17
192	0.19
193	0.2
194	0.21
195	0.24
196	0.22
197	0.21
198	0.21
199	0.2
200	0.26
201	0.25
202	0.25
203	0.23
204	0.23
205	0.2
206	0.19
207	0.17
208	0.11
209	0.1
210	0.12
211	0.12
212	0.11
213	0.18
214	0.18
215	0.18
216	0.17
217	0.19
218	0.17
219	0.19
220	0.19
221	0.13
222	0.14
223	0.14
224	0.15
225	0.13
226	0.13
227	0.11
228	0.12
229	0.11
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.11
234	0.11
235	0.12
236	0.12
237	0.15
238	0.15
239	0.16
240	0.17
241	0.22
242	0.23
243	0.24
244	0.27
245	0.26
246	0.27
247	0.26
248	0.24
249	0.17
250	0.16
251	0.14
252	0.11
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.11
261	0.11
262	0.12
263	0.11
264	0.16
265	0.16
266	0.18
267	0.19
268	0.18
269	0.17
270	0.21
271	0.2
272	0.16
273	0.16
274	0.13
275	0.12
276	0.1
277	0.1
278	0.07
279	0.09
280	0.09
281	0.1
282	0.18
283	0.19
284	0.2
285	0.21
286	0.2
287	0.18
288	0.21
289	0.24
290	0.18
291	0.21
292	0.23
293	0.24
294	0.25
295	0.25
296	0.22
297	0.2
298	0.19
299	0.18
300	0.17
301	0.16
302	0.16
303	0.19
304	0.2
305	0.19
306	0.19
307	0.17
308	0.17
309	0.21
310	0.24
311	0.2
312	0.2
313	0.22
314	0.22
315	0.24
316	0.23
317	0.2
318	0.21
319	0.22
320	0.26
321	0.33
322	0.32
323	0.31
324	0.32
325	0.32
326	0.31
327	0.33
328	0.33
329	0.25
330	0.25
331	0.26
332	0.25
333	0.23
334	0.19
335	0.14
336	0.12
337	0.12
338	0.14
339	0.13
340	0.11
341	0.11
342	0.11
343	0.11
344	0.09
345	0.07
346	0.04
347	0.03
348	0.04
349	0.03
350	0.03
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.06
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.04
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.04
378	0.05
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.06
386	0.05
387	0.07
388	0.08
389	0.09
390	0.11
391	0.13
392	0.17
393	0.25
394	0.33
395	0.33
396	0.39
397	0.39
398	0.41
399	0.44
400	0.41
401	0.33
402	0.25
403	0.24
404	0.17
405	0.16
406	0.12
407	0.07
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.04
412	0.03
413	0.03
414	0.02
415	0.02
416	0.02
417	0.02
418	0.03
419	0.04
420	0.04
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.07
425	0.08
426	0.09
427	0.1
428	0.1
429	0.12
430	0.14
431	0.13
432	0.13
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.13
437	0.11
438	0.1
439	0.1
440	0.12
441	0.13
442	0.11
443	0.11
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.08
448	0.06
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.05
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.1
460	0.1
461	0.1
462	0.09
463	0.06
464	0.06
465	0.07
466	0.06
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.07
474	0.08
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.05
479	0.05
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.09
484	0.11
485	0.11
486	0.13
487	0.16
488	0.16
489	0.21
490	0.22
491	0.2
492	0.18
493	0.18
494	0.18
495	0.15
496	0.15
497	0.11
498	0.14
499	0.2
500	0.2
501	0.22
502	0.22
503	0.27
504	0.26
505	0.25
506	0.2
507	0.14
508	0.15
509	0.13
510	0.12
511	0.07
512	0.08
513	0.07
514	0.06
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.06
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.05
525	0.06
526	0.05
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.08
536	0.12
537	0.13
538	0.14
539	0.15
540	0.14
541	0.14
542	0.14
543	0.16
544	0.18
545	0.2
546	0.23
547	0.22
548	0.21
549	0.26
550	0.3
551	0.32
552	0.32
553	0.36
554	0.35
555	0.36
556	0.41
557	0.39
558	0.41
559	0.39
560	0.37
561	0.31
562	0.32
563	0.32
564	0.27
565	0.23
566	0.18
567	0.19
568	0.14
569	0.14
570	0.11
571	0.11
572	0.11
573	0.11
574	0.11
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.08
581	0.08
582	0.1
583	0.09
584	0.12
585	0.15
586	0.19
587	0.21
588	0.2
589	0.23
590	0.24
591	0.28
592	0.28
593	0.25
594	0.23
595	0.24
596	0.28
597	0.26
598	0.24
599	0.2
600	0.18
601	0.17
602	0.17
603	0.17
604	0.14
605	0.15
606	0.16
607	0.17
608	0.19
609	0.2
610	0.18
611	0.17
612	0.21
613	0.22
614	0.27
615	0.31
616	0.32
617	0.32
618	0.32
619	0.3
620	0.25
621	0.25
622	0.22
623	0.19
624	0.19
625	0.21
626	0.2
627	0.21
628	0.21
629	0.22
630	0.21
631	0.22
632	0.2
633	0.19
634	0.2
635	0.24
636	0.27
637	0.24
638	0.24
639	0.23
640	0.23
641	0.21
642	0.2
643	0.16
644	0.14
645	0.16
646	0.19
647	0.2
648	0.2
649	0.27
650	0.36
651	0.45
652	0.49
653	0.5
654	0.53
655	0.54
656	0.61
657	0.63
658	0.6
659	0.53
660	0.49
661	0.5
662	0.44
663	0.41
664	0.36
665	0.32
666	0.27
667	0.25
668	0.28
669	0.29
670	0.37
671	0.42
672	0.46
673	0.48
674	0.54
675	0.61
676	0.68
677	0.71
678	0.74
679	0.76
680	0.82
681	0.78
682	0.77
683	0.79
684	0.75
685	0.69
686	0.62
687	0.53
688	0.42
689	0.42
690	0.38
691	0.29
692	0.25
693	0.19
694	0.16
695	0.18
696	0.19
697	0.15
698	0.15
699	0.18
700	0.2
701	0.24
702	0.29
703	0.28
704	0.28
705	0.28
706	0.28
707	0.28
708	0.25
709	0.24
710	0.24
711	0.27
712	0.31
713	0.31
714	0.35
715	0.34
716	0.33
717	0.34
718	0.35
719	0.29
720	0.34
721	0.39
722	0.41
723	0.46
724	0.46
725	0.43
726	0.4
727	0.42
728	0.41
729	0.42
730	0.37
731	0.31
732	0.31
733	0.3
734	0.28
735	0.24
736	0.16
737	0.1
738	0.14
739	0.15
740	0.16
741	0.16
742	0.18
743	0.2
744	0.21
745	0.25
746	0.25
747	0.33
748	0.37
749	0.47
750	0.47
751	0.48
752	0.5
753	0.48
754	0.45
755	0.36
756	0.39
757	0.34
758	0.38
759	0.43
760	0.45
761	0.51
762	0.56
763	0.59
764	0.61
765	0.65
766	0.66
767	0.63
768	0.63
769	0.59
770	0.6
771	0.65
772	0.62
773	0.59
774	0.57
775	0.55
776	0.5
777	0.46
778	0.37
779	0.3
780	0.23
781	0.18
782	0.11
783	0.11
784	0.1
785	0.1
786	0.11
787	0.13
788	0.15
789	0.15
790	0.16
791	0.16
792	0.21
793	0.26
794	0.33
795	0.38
796	0.42
797	0.5
798	0.56
799	0.62
800	0.63
801	0.66
802	0.64
803	0.63
804	0.63
805	0.62
806	0.63
807	0.55
808	0.51
809	0.44
810	0.38
811	0.3
812	0.27
813	0.2
814	0.15
815	0.25
816	0.32
817	0.37
818	0.43
819	0.46
820	0.53
821	0.58
822	0.6
823	0.57
824	0.58
825	0.62
826	0.66

W4KHL9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer