Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HBJ9

Protein Details
Accession C1HBJ9    Localization Confidence High Confidence Score 24.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-121AGDGRRQVRRPRHLEDRPKSKHIBasic
383-407ATPKLYWPEFKRKYRKDPEMKDIQLHydrophilic
496-517EEQMERDKRRADREKREKALVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-113RRQVRRPRHLE
115-115R
503-516KRRADREKREKALV
526-527KR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002713  FF_domain  
IPR036517  FF_domain_sf  
IPR045148  TCRG1-like  
IPR001202  WW_dom  
IPR036020  WW_dom_sf  
Gene Ontology GO:0070063  F:RNA polymerase binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG pbl:PAAG_08140  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01846  FF  
PF00397  WW  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50020  WW_DOMAIN_2  
CDD cd00201  WW  
Amino Acid Sequences MLKSTYSSLNPLPPGWTEHKAPSGHLYYYNAETKQSTYRRPAVPAGLQPAAALPPRRAFGFPAHPQVGPAPGFGYPVPQGGGLPFNIADSFDKFRRDGAGDGRRQVRRPRHLEDRPKSKHIIPGCEPWVLVKTKLGRRFVHNPDTNESFWKFPQDVLKGVIEYDRLERERKERRERGELSEEEQEEDRGSKRVSLEWGRSASVANEADGRKEEDSDEYEEVEVTDDEAEDGEGEDVQSKRLRTEGENANQPGYIEFNEDDIEYQLAAMGEEYGLDPGEYGEPGEEGWEEGAEGLPLTEEDSTALFRDLLDDFRINPYTPWEKIIEEGKIIDDARYTILPNMKSRQEAWSKWSRDRMQELKERREKEVKKDPRIRYLAFLQEHATPKLYWPEFKRKYRKDPEMKDIQLSDKDREKLYRDHIPRLKLPEATRKSDLSTLLKSTPLHALNKLSTPDMLPASILTDLRYISLPPEIRDPLIEAYISTLSPAPEPEGISTEEQMERDKRRADREKREKALVERELRVQEQKRKQKGALMHGRDMLRQGEDEIEMAMRVGKEGLKSHLETGMMASGSRPGAGET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.36
4 0.34
5 0.37
6 0.42
7 0.41
8 0.41
9 0.42
10 0.4
11 0.38
12 0.37
13 0.36
14 0.33
15 0.37
16 0.41
17 0.34
18 0.32
19 0.31
20 0.31
21 0.36
22 0.4
23 0.41
24 0.44
25 0.52
26 0.54
27 0.57
28 0.59
29 0.56
30 0.56
31 0.54
32 0.52
33 0.44
34 0.4
35 0.35
36 0.31
37 0.27
38 0.25
39 0.22
40 0.19
41 0.22
42 0.24
43 0.26
44 0.26
45 0.26
46 0.29
47 0.37
48 0.4
49 0.45
50 0.45
51 0.43
52 0.43
53 0.42
54 0.4
55 0.3
56 0.25
57 0.17
58 0.15
59 0.17
60 0.16
61 0.18
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.15
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.19
78 0.21
79 0.24
80 0.23
81 0.25
82 0.28
83 0.28
84 0.28
85 0.33
86 0.4
87 0.41
88 0.47
89 0.54
90 0.54
91 0.57
92 0.62
93 0.63
94 0.64
95 0.67
96 0.68
97 0.71
98 0.77
99 0.83
100 0.83
101 0.84
102 0.81
103 0.78
104 0.75
105 0.67
106 0.64
107 0.59
108 0.57
109 0.5
110 0.51
111 0.49
112 0.45
113 0.42
114 0.36
115 0.35
116 0.28
117 0.25
118 0.22
119 0.27
120 0.34
121 0.41
122 0.47
123 0.45
124 0.5
125 0.59
126 0.62
127 0.64
128 0.63
129 0.6
130 0.58
131 0.6
132 0.53
133 0.48
134 0.42
135 0.34
136 0.28
137 0.29
138 0.25
139 0.23
140 0.29
141 0.27
142 0.27
143 0.28
144 0.28
145 0.23
146 0.23
147 0.22
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.17
152 0.18
153 0.2
154 0.23
155 0.3
156 0.4
157 0.48
158 0.57
159 0.59
160 0.63
161 0.71
162 0.72
163 0.71
164 0.68
165 0.6
166 0.53
167 0.51
168 0.45
169 0.37
170 0.33
171 0.26
172 0.19
173 0.19
174 0.16
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.14
179 0.16
180 0.22
181 0.26
182 0.28
183 0.3
184 0.32
185 0.3
186 0.29
187 0.27
188 0.21
189 0.21
190 0.17
191 0.13
192 0.16
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.18
197 0.14
198 0.14
199 0.15
200 0.12
201 0.15
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.09
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.04
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.16
229 0.15
230 0.23
231 0.29
232 0.31
233 0.37
234 0.38
235 0.36
236 0.34
237 0.32
238 0.24
239 0.18
240 0.13
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.02
281 0.02
282 0.02
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.12
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.15
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.18
308 0.17
309 0.19
310 0.22
311 0.18
312 0.14
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.13
325 0.15
326 0.18
327 0.22
328 0.22
329 0.24
330 0.24
331 0.29
332 0.31
333 0.3
334 0.33
335 0.39
336 0.41
337 0.43
338 0.51
339 0.48
340 0.46
341 0.53
342 0.53
343 0.5
344 0.55
345 0.58
346 0.6
347 0.64
348 0.61
349 0.59
350 0.63
351 0.6
352 0.6
353 0.64
354 0.64
355 0.67
356 0.74
357 0.73
358 0.73
359 0.75
360 0.66
361 0.6
362 0.54
363 0.51
364 0.42
365 0.39
366 0.31
367 0.31
368 0.33
369 0.29
370 0.26
371 0.19
372 0.19
373 0.26
374 0.26
375 0.26
376 0.29
377 0.4
378 0.47
379 0.57
380 0.66
381 0.66
382 0.76
383 0.81
384 0.86
385 0.85
386 0.84
387 0.83
388 0.82
389 0.75
390 0.67
391 0.59
392 0.51
393 0.47
394 0.43
395 0.39
396 0.35
397 0.36
398 0.35
399 0.37
400 0.37
401 0.36
402 0.39
403 0.45
404 0.43
405 0.5
406 0.54
407 0.55
408 0.56
409 0.57
410 0.54
411 0.5
412 0.5
413 0.5
414 0.51
415 0.52
416 0.5
417 0.44
418 0.43
419 0.41
420 0.41
421 0.35
422 0.33
423 0.3
424 0.28
425 0.3
426 0.28
427 0.27
428 0.29
429 0.28
430 0.28
431 0.27
432 0.29
433 0.29
434 0.32
435 0.32
436 0.26
437 0.22
438 0.21
439 0.21
440 0.18
441 0.16
442 0.13
443 0.11
444 0.12
445 0.13
446 0.12
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.1
453 0.1
454 0.16
455 0.17
456 0.17
457 0.23
458 0.23
459 0.23
460 0.23
461 0.25
462 0.2
463 0.2
464 0.18
465 0.13
466 0.14
467 0.14
468 0.13
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.14
477 0.14
478 0.15
479 0.17
480 0.18
481 0.18
482 0.19
483 0.19
484 0.18
485 0.22
486 0.26
487 0.29
488 0.33
489 0.39
490 0.42
491 0.51
492 0.61
493 0.66
494 0.71
495 0.78
496 0.83
497 0.82
498 0.84
499 0.79
500 0.75
501 0.75
502 0.72
503 0.68
504 0.6
505 0.6
506 0.56
507 0.54
508 0.55
509 0.54
510 0.55
511 0.59
512 0.67
513 0.7
514 0.73
515 0.72
516 0.7
517 0.7
518 0.71
519 0.71
520 0.67
521 0.62
522 0.62
523 0.61
524 0.55
525 0.5
526 0.41
527 0.32
528 0.26
529 0.22
530 0.19
531 0.18
532 0.17
533 0.15
534 0.13
535 0.11
536 0.1
537 0.11
538 0.09
539 0.09
540 0.1
541 0.12
542 0.14
543 0.17
544 0.22
545 0.25
546 0.27
547 0.29
548 0.3
549 0.29
550 0.26
551 0.25
552 0.24
553 0.19
554 0.17
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.15