Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JUC4

Protein Details
Accession W4JUC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-70ELHEYRGRKRKEFEERIRRTRGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-59RKRKE
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 8.5, cyto_mito 8, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR008847  Suf  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG hir:HETIRDRAFT_388667  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05843  Suf  
PF13428  TPR_14  
Amino Acid Sequences MQDGRAPRIKNRAAAAVQITAEQILREAQERQETQFRAPKQRVEDFEELHEYRGRKRKEFEERIRRTRGSVKEWLQYANWEAQQNEFPRSRSVFERALDVDARSVQLWLAYSEMELKSRNVQHARNLFDRAVTLLPRIDQIWYKYVYLEELLQNVAGARQVFERWMAWEPDDKAWQAYIKLEVRYEEWDRASAIHERWVSVRPEPRVWVKWGKFEEERGKVDKAREVFQTALEFFGDEEEQVDKAQAVFSAFAKMEVRLKEFERARVIYKFALSRLPRSKSANLYAAYTRFEKQHGTRTSLETTVLGKRRIQYEEELSHDGRNYDVWFDFARLEEGAYKQLREEGSTTEEEEESISRVREVYERAVAQVPPGGQKRHWRRYIFLWLYYALFEEMETKDYARARQIYQTAIQLVPHKEFTFAKLWLMYAKFEVRRLDLPAARKILGTAIGMCPKEALFKGYIQLEFDLREFDRARTLYEKYLEFDPTNSPAWIKYAELETQLADYSRARGIFELGVSQTPLSMPELLWKAYIDFEVEEGERKNARALYERLVQTSGHWKVWVAYALFEAQDIQLPRDEREEEEEEEEGDEEKEVKMVEGDLELARKVFDRGYKDLKTKELKTERVALLQVWKNFEEKRGTSEDVARVQGMMPIQGKRRYVDEETGQLVEDYDYIFADDEREANPTSFKFLQNAHAWKAARASGATTLSGFTAASSASKPSEVKPAPVAESKKDDAMDEDVSDVASSHGGDEPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.48
3 0.41
4 0.36
5 0.31
6 0.28
7 0.21
8 0.19
9 0.14
10 0.12
11 0.1
12 0.11
13 0.13
14 0.15
15 0.18
16 0.27
17 0.29
18 0.33
19 0.4
20 0.41
21 0.46
22 0.5
23 0.53
24 0.55
25 0.59
26 0.6
27 0.6
28 0.66
29 0.64
30 0.64
31 0.64
32 0.55
33 0.55
34 0.56
35 0.49
36 0.43
37 0.43
38 0.36
39 0.39
40 0.46
41 0.47
42 0.46
43 0.52
44 0.6
45 0.67
46 0.76
47 0.78
48 0.8
49 0.84
50 0.86
51 0.88
52 0.79
53 0.72
54 0.7
55 0.67
56 0.63
57 0.63
58 0.6
59 0.58
60 0.59
61 0.56
62 0.48
63 0.43
64 0.39
65 0.36
66 0.34
67 0.3
68 0.28
69 0.29
70 0.35
71 0.34
72 0.37
73 0.34
74 0.32
75 0.35
76 0.37
77 0.37
78 0.36
79 0.39
80 0.38
81 0.36
82 0.39
83 0.35
84 0.36
85 0.34
86 0.3
87 0.26
88 0.21
89 0.21
90 0.16
91 0.15
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.16
104 0.23
105 0.27
106 0.35
107 0.36
108 0.39
109 0.46
110 0.52
111 0.56
112 0.52
113 0.52
114 0.44
115 0.39
116 0.36
117 0.29
118 0.25
119 0.2
120 0.18
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.22
129 0.23
130 0.23
131 0.23
132 0.22
133 0.21
134 0.19
135 0.18
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.23
156 0.25
157 0.27
158 0.29
159 0.27
160 0.24
161 0.23
162 0.24
163 0.19
164 0.18
165 0.21
166 0.22
167 0.23
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.27
172 0.29
173 0.26
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.22
179 0.22
180 0.19
181 0.22
182 0.22
183 0.22
184 0.23
185 0.27
186 0.27
187 0.28
188 0.33
189 0.31
190 0.33
191 0.36
192 0.41
193 0.4
194 0.43
195 0.48
196 0.44
197 0.48
198 0.47
199 0.49
200 0.44
201 0.48
202 0.51
203 0.47
204 0.49
205 0.44
206 0.45
207 0.43
208 0.43
209 0.4
210 0.34
211 0.31
212 0.29
213 0.29
214 0.26
215 0.24
216 0.25
217 0.2
218 0.19
219 0.15
220 0.13
221 0.1
222 0.11
223 0.09
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.16
243 0.17
244 0.19
245 0.19
246 0.2
247 0.27
248 0.28
249 0.31
250 0.32
251 0.32
252 0.33
253 0.32
254 0.32
255 0.26
256 0.27
257 0.24
258 0.2
259 0.25
260 0.23
261 0.3
262 0.35
263 0.38
264 0.39
265 0.43
266 0.47
267 0.44
268 0.48
269 0.45
270 0.38
271 0.36
272 0.34
273 0.3
274 0.28
275 0.25
276 0.22
277 0.17
278 0.18
279 0.2
280 0.2
281 0.29
282 0.3
283 0.33
284 0.34
285 0.37
286 0.38
287 0.34
288 0.31
289 0.23
290 0.22
291 0.23
292 0.25
293 0.23
294 0.22
295 0.24
296 0.28
297 0.29
298 0.29
299 0.26
300 0.28
301 0.29
302 0.31
303 0.31
304 0.28
305 0.27
306 0.25
307 0.22
308 0.16
309 0.14
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.15
331 0.11
332 0.14
333 0.15
334 0.16
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.11
348 0.12
349 0.14
350 0.14
351 0.15
352 0.17
353 0.16
354 0.14
355 0.14
356 0.12
357 0.14
358 0.17
359 0.16
360 0.17
361 0.26
362 0.36
363 0.44
364 0.5
365 0.47
366 0.47
367 0.52
368 0.61
369 0.54
370 0.45
371 0.37
372 0.31
373 0.29
374 0.27
375 0.21
376 0.1
377 0.08
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.17
389 0.16
390 0.21
391 0.22
392 0.21
393 0.22
394 0.22
395 0.2
396 0.18
397 0.18
398 0.18
399 0.18
400 0.17
401 0.18
402 0.16
403 0.17
404 0.17
405 0.19
406 0.18
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.16
413 0.13
414 0.11
415 0.15
416 0.15
417 0.18
418 0.19
419 0.19
420 0.2
421 0.22
422 0.25
423 0.24
424 0.27
425 0.28
426 0.29
427 0.27
428 0.25
429 0.23
430 0.19
431 0.17
432 0.14
433 0.11
434 0.11
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.13
439 0.12
440 0.14
441 0.13
442 0.13
443 0.1
444 0.11
445 0.13
446 0.16
447 0.16
448 0.14
449 0.15
450 0.13
451 0.13
452 0.12
453 0.13
454 0.1
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.18
459 0.18
460 0.2
461 0.21
462 0.23
463 0.22
464 0.24
465 0.25
466 0.22
467 0.24
468 0.24
469 0.21
470 0.2
471 0.19
472 0.19
473 0.2
474 0.18
475 0.16
476 0.14
477 0.15
478 0.14
479 0.12
480 0.11
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.1
489 0.09
490 0.08
491 0.09
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.11
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.08
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.12
511 0.14
512 0.15
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.14
517 0.14
518 0.1
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.09
523 0.11
524 0.11
525 0.14
526 0.14
527 0.14
528 0.17
529 0.17
530 0.19
531 0.23
532 0.25
533 0.27
534 0.33
535 0.34
536 0.32
537 0.32
538 0.3
539 0.25
540 0.32
541 0.3
542 0.23
543 0.23
544 0.21
545 0.21
546 0.24
547 0.26
548 0.17
549 0.14
550 0.14
551 0.15
552 0.14
553 0.13
554 0.11
555 0.08
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.14
560 0.16
561 0.17
562 0.2
563 0.21
564 0.18
565 0.24
566 0.27
567 0.25
568 0.26
569 0.25
570 0.22
571 0.21
572 0.2
573 0.14
574 0.11
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.09
586 0.09
587 0.1
588 0.1
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.1
593 0.12
594 0.16
595 0.21
596 0.27
597 0.35
598 0.4
599 0.46
600 0.48
601 0.53
602 0.56
603 0.54
604 0.58
605 0.59
606 0.58
607 0.56
608 0.61
609 0.55
610 0.5
611 0.48
612 0.38
613 0.39
614 0.39
615 0.38
616 0.33
617 0.32
618 0.33
619 0.33
620 0.36
621 0.35
622 0.31
623 0.33
624 0.35
625 0.37
626 0.36
627 0.41
628 0.42
629 0.37
630 0.38
631 0.32
632 0.27
633 0.24
634 0.24
635 0.18
636 0.17
637 0.17
638 0.2
639 0.26
640 0.31
641 0.33
642 0.33
643 0.36
644 0.38
645 0.4
646 0.42
647 0.39
648 0.38
649 0.39
650 0.38
651 0.34
652 0.28
653 0.24
654 0.17
655 0.13
656 0.1
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.12
667 0.13
668 0.14
669 0.17
670 0.16
671 0.22
672 0.24
673 0.25
674 0.26
675 0.27
676 0.34
677 0.39
678 0.44
679 0.41
680 0.44
681 0.43
682 0.41
683 0.42
684 0.37
685 0.31
686 0.26
687 0.25
688 0.23
689 0.24
690 0.23
691 0.2
692 0.18
693 0.16
694 0.16
695 0.14
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.08
700 0.09
701 0.11
702 0.12
703 0.15
704 0.17
705 0.18
706 0.29
707 0.29
708 0.32
709 0.35
710 0.37
711 0.39
712 0.45
713 0.47
714 0.42
715 0.48
716 0.46
717 0.45
718 0.41
719 0.37
720 0.33
721 0.33
722 0.3
723 0.23
724 0.22
725 0.18
726 0.17
727 0.16
728 0.13
729 0.09
730 0.08
731 0.07
732 0.08