Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W4KCD8

Protein Details
Accession W4KCD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
527-547SSRGRSPPPKDRKKMKSPLDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
529-542RGRSPPPKDRKKMK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG hir:HETIRDRAFT_433724  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MPPFERPETVLTGFKERIEALTVQGDRLYVGTGTGNLHVYSFSGDAREPAELIKSKQGLTRRAIEQLGYVKDINSLVVLSESQVTLYPLPEFAPPTLLLKAKSAFSFAVHTSVQHILPNGAPVKSSDAQFSKATTVPTVVTNLIVGCRRKLIIYSWKDGEAQEVKEATLPHSARTITFLDNDVICLAYTPTDYILFSLLTLSTTEVAIPSTTSLSVAGISNMGVGALSGLGGYMTLGLGAKAKPCAANVGESEVLITKDNLGWFIGADGRPSRTTQVDWPAPPEDISFVKPYIFGILPAGTVPIDFANISPSTHSPQASFHPSPVLQIRSSLSLLPSQTLPFPFHSTTTSAPASQYTLRLLVASPADKTSLFLVSTPADRAAANLDGSSIWQFQMKSWGEQIDELVGAELYLDALALLETIDPTILPDKEHRRNLIRGLNAISQFKSGKFNEALDTLIELNVNPAKVVALYPEIVAGRLSVPQDQWIPLYGGPSRDHPRTQNENELTSVHDRSGDGNTEDNSSDHASSRGRSPPPKDRKKMKSPLDAIRPSPQKDSDSASIASTRRLRPNDDFSRSVESLLRYLPDRRQKVAGALEAFQITTALSHQYSGISDSSVEELFEIPSSPMSSLTPEQLIQYSRIVDTALFKAYLIVRPGLLGSLCRLPNWCEVEEVEEVLTARERFTELISLYNGKKMHAKALDLLRKLSEKETDIRDRLGPSISYLQRLGPEYIDQTFKSSRWVFEQDADMAFEIFTTEEVTLPREPVATFLESLNPRFCARYLEFLIDEGGEELPQFHDRLAELYLKMTRDAKKRGDNEAQRVVYAKLLSFIDTTNHYRVDRLFGLLPTDDFFEAKAILLGRLGRHNHALELYVYRLQDYTKAEEYCKRTYQPGTETSNIFLTLLQIYLRPVVKTSDDLLHPALGLISRHSPRLDVEETLQLLPPLVTAEELRIFLLEALRAPVFDTKVLRGISKAHSEQVARKLMYLQSRRVKVTDSRICPQCHKRIGHSVIAVHAPGGEVTHYQCREAFSRKLKEMRHT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.28
4 0.27
5 0.26
6 0.24
7 0.2
8 0.26
9 0.26
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.12
21 0.13
22 0.15
23 0.13
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.15
34 0.15
35 0.13
36 0.13
37 0.19
38 0.21
39 0.23
40 0.3
41 0.31
42 0.32
43 0.36
44 0.42
45 0.42
46 0.44
47 0.49
48 0.44
49 0.47
50 0.47
51 0.42
52 0.4
53 0.4
54 0.37
55 0.33
56 0.3
57 0.25
58 0.26
59 0.25
60 0.21
61 0.14
62 0.12
63 0.09
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.12
77 0.14
78 0.16
79 0.14
80 0.17
81 0.16
82 0.19
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.24
87 0.26
88 0.25
89 0.25
90 0.25
91 0.22
92 0.21
93 0.24
94 0.21
95 0.23
96 0.2
97 0.19
98 0.2
99 0.23
100 0.22
101 0.19
102 0.19
103 0.17
104 0.17
105 0.23
106 0.22
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.24
111 0.25
112 0.26
113 0.27
114 0.27
115 0.3
116 0.31
117 0.31
118 0.28
119 0.27
120 0.28
121 0.22
122 0.21
123 0.19
124 0.19
125 0.2
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.15
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.2
135 0.21
136 0.21
137 0.22
138 0.27
139 0.31
140 0.36
141 0.41
142 0.41
143 0.42
144 0.42
145 0.4
146 0.4
147 0.34
148 0.3
149 0.27
150 0.25
151 0.24
152 0.25
153 0.26
154 0.21
155 0.25
156 0.23
157 0.21
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.25
162 0.25
163 0.19
164 0.2
165 0.21
166 0.2
167 0.19
168 0.19
169 0.16
170 0.13
171 0.11
172 0.1
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.17
233 0.16
234 0.18
235 0.17
236 0.21
237 0.2
238 0.19
239 0.19
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.12
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.12
253 0.1
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.2
260 0.18
261 0.2
262 0.23
263 0.3
264 0.33
265 0.33
266 0.35
267 0.34
268 0.33
269 0.31
270 0.26
271 0.2
272 0.16
273 0.17
274 0.16
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.15
300 0.18
301 0.18
302 0.16
303 0.17
304 0.22
305 0.29
306 0.28
307 0.25
308 0.26
309 0.26
310 0.28
311 0.3
312 0.28
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.2
317 0.21
318 0.19
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.12
325 0.14
326 0.14
327 0.16
328 0.15
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.2
333 0.21
334 0.21
335 0.23
336 0.22
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.07
377 0.06
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.18
382 0.19
383 0.19
384 0.2
385 0.21
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.07
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.02
399 0.02
400 0.02
401 0.02
402 0.02
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.03
408 0.03
409 0.02
410 0.03
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.14
415 0.23
416 0.31
417 0.35
418 0.38
419 0.4
420 0.43
421 0.48
422 0.48
423 0.41
424 0.35
425 0.35
426 0.35
427 0.32
428 0.3
429 0.24
430 0.21
431 0.2
432 0.19
433 0.21
434 0.18
435 0.2
436 0.2
437 0.21
438 0.2
439 0.2
440 0.19
441 0.13
442 0.14
443 0.1
444 0.09
445 0.08
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.1
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.11
477 0.1
478 0.12
479 0.13
480 0.17
481 0.21
482 0.22
483 0.24
484 0.25
485 0.32
486 0.37
487 0.39
488 0.43
489 0.41
490 0.39
491 0.38
492 0.35
493 0.29
494 0.24
495 0.21
496 0.13
497 0.12
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.1
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.09
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.14
516 0.18
517 0.21
518 0.25
519 0.31
520 0.4
521 0.5
522 0.6
523 0.64
524 0.68
525 0.74
526 0.79
527 0.83
528 0.81
529 0.79
530 0.75
531 0.74
532 0.73
533 0.67
534 0.58
535 0.56
536 0.53
537 0.45
538 0.42
539 0.37
540 0.29
541 0.28
542 0.3
543 0.24
544 0.23
545 0.22
546 0.19
547 0.21
548 0.19
549 0.22
550 0.22
551 0.24
552 0.27
553 0.29
554 0.33
555 0.34
556 0.43
557 0.47
558 0.47
559 0.45
560 0.41
561 0.46
562 0.41
563 0.38
564 0.31
565 0.23
566 0.19
567 0.18
568 0.17
569 0.12
570 0.14
571 0.2
572 0.27
573 0.29
574 0.3
575 0.32
576 0.32
577 0.35
578 0.35
579 0.31
580 0.24
581 0.22
582 0.21
583 0.18
584 0.17
585 0.13
586 0.1
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.05
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.07
614 0.07
615 0.09
616 0.1
617 0.11
618 0.11
619 0.11
620 0.11
621 0.13
622 0.13
623 0.12
624 0.13
625 0.12
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.09
630 0.11
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.1
635 0.11
636 0.12
637 0.14
638 0.13
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.1
644 0.09
645 0.07
646 0.07
647 0.12
648 0.12
649 0.13
650 0.14
651 0.16
652 0.22
653 0.26
654 0.24
655 0.2
656 0.2
657 0.23
658 0.22
659 0.2
660 0.14
661 0.1
662 0.1
663 0.09
664 0.11
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.08
669 0.08
670 0.09
671 0.12
672 0.1
673 0.12
674 0.13
675 0.16
676 0.16
677 0.2
678 0.19
679 0.17
680 0.22
681 0.21
682 0.26
683 0.25
684 0.26
685 0.27
686 0.36
687 0.42
688 0.38
689 0.38
690 0.33
691 0.32
692 0.32
693 0.29
694 0.23
695 0.19
696 0.23
697 0.29
698 0.33
699 0.33
700 0.34
701 0.34
702 0.32
703 0.31
704 0.28
705 0.21
706 0.17
707 0.24
708 0.23
709 0.23
710 0.22
711 0.22
712 0.23
713 0.25
714 0.23
715 0.16
716 0.16
717 0.16
718 0.17
719 0.19
720 0.16
721 0.18
722 0.19
723 0.18
724 0.24
725 0.24
726 0.23
727 0.26
728 0.31
729 0.29
730 0.29
731 0.32
732 0.26
733 0.25
734 0.24
735 0.19
736 0.14
737 0.13
738 0.1
739 0.07
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.06
745 0.07
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.12
750 0.11
751 0.11
752 0.13
753 0.15
754 0.13
755 0.14
756 0.13
757 0.2
758 0.2
759 0.23
760 0.22
761 0.21
762 0.2
763 0.21
764 0.21
765 0.21
766 0.22
767 0.27
768 0.27
769 0.29
770 0.28
771 0.27
772 0.27
773 0.2
774 0.18
775 0.12
776 0.09
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.09
782 0.09
783 0.08
784 0.09
785 0.09
786 0.11
787 0.13
788 0.14
789 0.13
790 0.15
791 0.18
792 0.18
793 0.19
794 0.24
795 0.28
796 0.33
797 0.4
798 0.45
799 0.52
800 0.55
801 0.62
802 0.66
803 0.67
804 0.67
805 0.69
806 0.62
807 0.53
808 0.5
809 0.43
810 0.35
811 0.28
812 0.21
813 0.15
814 0.14
815 0.15
816 0.14
817 0.14
818 0.13
819 0.17
820 0.21
821 0.21
822 0.24
823 0.23
824 0.24
825 0.24
826 0.29
827 0.25
828 0.24
829 0.24
830 0.21
831 0.24
832 0.22
833 0.22
834 0.16
835 0.17
836 0.14
837 0.12
838 0.12
839 0.1
840 0.1
841 0.09
842 0.1
843 0.09
844 0.09
845 0.1
846 0.12
847 0.13
848 0.19
849 0.22
850 0.22
851 0.27
852 0.27
853 0.27
854 0.26
855 0.25
856 0.2
857 0.21
858 0.21
859 0.19
860 0.18
861 0.18
862 0.17
863 0.16
864 0.2
865 0.21
866 0.24
867 0.27
868 0.29
869 0.31
870 0.38
871 0.44
872 0.45
873 0.47
874 0.43
875 0.43
876 0.46
877 0.5
878 0.48
879 0.5
880 0.5
881 0.49
882 0.48
883 0.44
884 0.4
885 0.34
886 0.28
887 0.21
888 0.15
889 0.12
890 0.11
891 0.1
892 0.09
893 0.1
894 0.14
895 0.16
896 0.15
897 0.15
898 0.18
899 0.2
900 0.22
901 0.24
902 0.24
903 0.24
904 0.26
905 0.26
906 0.23
907 0.21
908 0.19
909 0.16
910 0.12
911 0.12
912 0.12
913 0.18
914 0.19
915 0.22
916 0.22
917 0.23
918 0.23
919 0.3
920 0.29
921 0.24
922 0.26
923 0.28
924 0.3
925 0.3
926 0.28
927 0.22
928 0.19
929 0.17
930 0.14
931 0.1
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.11
936 0.13
937 0.13
938 0.13
939 0.12
940 0.12
941 0.13
942 0.14
943 0.11
944 0.1
945 0.13
946 0.13
947 0.13
948 0.14
949 0.17
950 0.17
951 0.19
952 0.21
953 0.2
954 0.26
955 0.28
956 0.27
957 0.24
958 0.28
959 0.3
960 0.36
961 0.36
962 0.33
963 0.37
964 0.39
965 0.44
966 0.48
967 0.5
968 0.42
969 0.41
970 0.41
971 0.42
972 0.48
973 0.48
974 0.49
975 0.5
976 0.55
977 0.57
978 0.55
979 0.55
980 0.53
981 0.58
982 0.58
983 0.55
984 0.59
985 0.63
986 0.66
987 0.7
988 0.72
989 0.71
990 0.7
991 0.68
992 0.67
993 0.7
994 0.71
995 0.69
996 0.63
997 0.55
998 0.5
999 0.47
1000 0.4
1001 0.29
1002 0.23
1003 0.17
1004 0.13
1005 0.12
1006 0.09
1007 0.09
1008 0.13
1009 0.21
1010 0.22
1011 0.23
1012 0.25
1013 0.28
1014 0.33
1015 0.38
1016 0.43
1017 0.45
1018 0.53
1019 0.6
1020 0.66