Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KCD8

Protein Details
Accession W4KCD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
527-547SSRGRSPPPKDRKKMKSPLDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
529-542RGRSPPPKDRKKMK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG hir:HETIRDRAFT_433724  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MPPFERPETVLTGFKERIEALTVQGDRLYVGTGTGNLHVYSFSGDAREPAELIKSKQGLTRRAIEQLGYVKDINSLVVLSESQVTLYPLPEFAPPTLLLKAKSAFSFAVHTSVQHILPNGAPVKSSDAQFSKATTVPTVVTNLIVGCRRKLIIYSWKDGEAQEVKEATLPHSARTITFLDNDVICLAYTPTDYILFSLLTLSTTEVAIPSTTSLSVAGISNMGVGALSGLGGYMTLGLGAKAKPCAANVGESEVLITKDNLGWFIGADGRPSRTTQVDWPAPPEDISFVKPYIFGILPAGTVPIDFANISPSTHSPQASFHPSPVLQIRSSLSLLPSQTLPFPFHSTTTSAPASQYTLRLLVASPADKTSLFLVSTPADRAAANLDGSSIWQFQMKSWGEQIDELVGAELYLDALALLETIDPTILPDKEHRRNLIRGLNAISQFKSGKFNEALDTLIELNVNPAKVVALYPEIVAGRLSVPQDQWIPLYGGPSRDHPRTQNENELTSVHDRSGDGNTEDNSSDHASSRGRSPPPKDRKKMKSPLDAIRPSPQKDSDSASIASTRRLRPNDDFSRSVESLLRYLPDRRQKVAGALEAFQITTALSHQYSGISDSSVEELFEIPSSPMSSLTPEQLIQYSRIVDTALFKAYLIVRPGLLGSLCRLPNWCEVEEVEEVLTARERFTELISLYNGKKMHAKALDLLRKLSEKETDIRDRLGPSISYLQRLGPEYIDQTFKSSRWVFEQDADMAFEIFTTEEVTLPREPVATFLESLNPRFCARYLEFLIDEGGEELPQFHDRLAELYLKMTRDAKKRGDNEAQRVVYAKLLSFIDTTNHYRVDRLFGLLPTDDFFEAKAILLGRLGRHNHALELYVYRLQDYTKAEEYCKRTYQPGTETSNIFLTLLQIYLRPVVKTSDDLLHPALGLISRHSPRLDVEETLQLLPPLVTAEELRIFLLEALRAPVFDTKVLRGISKAHSEQVARKLMYLQSRRVKVTDSRICPQCHKRIGHSVIAVHAPGGEVTHYQCREAFSRKLKEMRHT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.28
4 0.27
5 0.26
6 0.24
7 0.2
8 0.26
9 0.26
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.08
17 0.09
18 0.09
19 0.1
20 0.12
21 0.13
22 0.15
23 0.13
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.15
34 0.15
35 0.13
36 0.13
37 0.19
38 0.21
39 0.23
40 0.3
41 0.31
42 0.32
43 0.36
44 0.42
45 0.42
46 0.44
47 0.49
48 0.44
49 0.47
50 0.47
51 0.42
52 0.4
53 0.4
54 0.37
55 0.33
56 0.3
57 0.25
58 0.26
59 0.25
60 0.21
61 0.14
62 0.12
63 0.09
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.12
77 0.14
78 0.16
79 0.14
80 0.17
81 0.16
82 0.19
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.24
87 0.26
88 0.25
89 0.25
90 0.25
91 0.22
92 0.21
93 0.24
94 0.21
95 0.23
96 0.2
97 0.19
98 0.2
99 0.23
100 0.22
101 0.19
102 0.19
103 0.17
104 0.17
105 0.23
106 0.22
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.24
111 0.25
112 0.26
113 0.27
114 0.27
115 0.3
116 0.31
117 0.31
118 0.28
119 0.27
120 0.28
121 0.22
122 0.21
123 0.19
124 0.19
125 0.2
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.15
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.2
135 0.21
136 0.21
137 0.22
138 0.27
139 0.31
140 0.36
141 0.41
142 0.41
143 0.42
144 0.42
145 0.4
146 0.4
147 0.34
148 0.3
149 0.27
150 0.25
151 0.24
152 0.25
153 0.26
154 0.21
155 0.25
156 0.23
157 0.21
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.25
162 0.25
163 0.19
164 0.2
165 0.21
166 0.2
167 0.19
168 0.19
169 0.16
170 0.13
171 0.11
172 0.1
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.17
233 0.16
234 0.18
235 0.17
236 0.21
237 0.2
238 0.19
239 0.19
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.12
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.12
253 0.1
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.2
260 0.18
261 0.2
262 0.23
263 0.3
264 0.33
265 0.33
266 0.35
267 0.34
268 0.33
269 0.31
270 0.26
271 0.2
272 0.16
273 0.17
274 0.16
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.12
299 0.15
300 0.18
301 0.18
302 0.16
303 0.17
304 0.22
305 0.29
306 0.28
307 0.25
308 0.26
309 0.26
310 0.28
311 0.3
312 0.28
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.2
317 0.21
318 0.19
319 0.15
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.12
325 0.14
326 0.14
327 0.16
328 0.15
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.2
333 0.21
334 0.21
335 0.23
336 0.22
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.08
375 0.09
376 0.07
377 0.06
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.18
382 0.19
383 0.19
384 0.2
385 0.21
386 0.19
387 0.19
388 0.19
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.07
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.02
399 0.02
400 0.02
401 0.02
402 0.02
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.02
407 0.03
408 0.03
409 0.02
410 0.03
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.14
415 0.23
416 0.31
417 0.35
418 0.38
419 0.4
420 0.43
421 0.48
422 0.48
423 0.41
424 0.35
425 0.35
426 0.35
427 0.32
428 0.3
429 0.24
430 0.21
431 0.2
432 0.19
433 0.21
434 0.18
435 0.2
436 0.2
437 0.21
438 0.2
439 0.2
440 0.19
441 0.13
442 0.14
443 0.1
444 0.09
445 0.08
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.1
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.11
477 0.1
478 0.12
479 0.13
480 0.17
481 0.21
482 0.22
483 0.24
484 0.25
485 0.32
486 0.37
487 0.39
488 0.43
489 0.41
490 0.39
491 0.38
492 0.35
493 0.29
494 0.24
495 0.21
496 0.13
497 0.12
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.12
502 0.1
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.09
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.14
516 0.18
517 0.21
518 0.25
519 0.31
520 0.4
521 0.5
522 0.6
523 0.64
524 0.68
525 0.74
526 0.79
527 0.83
528 0.81
529 0.79
530 0.75
531 0.74
532 0.73
533 0.67
534 0.58
535 0.56
536 0.53
537 0.45
538 0.42
539 0.37
540 0.29
541 0.28
542 0.3
543 0.24
544 0.23
545 0.22
546 0.19
547 0.21
548 0.19
549 0.22
550 0.22
551 0.24
552 0.27
553 0.29
554 0.33
555 0.34
556 0.43
557 0.47
558 0.47
559 0.45
560 0.41
561 0.46
562 0.41
563 0.38
564 0.31
565 0.23
566 0.19
567 0.18
568 0.17
569 0.12
570 0.14
571 0.2
572 0.27
573 0.29
574 0.3
575 0.32
576 0.32
577 0.35
578 0.35
579 0.31
580 0.24
581 0.22
582 0.21
583 0.18
584 0.17
585 0.13
586 0.1
587 0.06
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.07
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.05
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.07
614 0.07
615 0.09
616 0.1
617 0.11
618 0.11
619 0.11
620 0.11
621 0.13
622 0.13
623 0.12
624 0.13
625 0.12
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.09
630 0.11
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.1
635 0.11
636 0.12
637 0.14
638 0.13
639 0.12
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.1
644 0.09
645 0.07
646 0.07
647 0.12
648 0.12
649 0.13
650 0.14
651 0.16
652 0.22
653 0.26
654 0.24
655 0.2
656 0.2
657 0.23
658 0.22
659 0.2
660 0.14
661 0.1
662 0.1
663 0.09
664 0.11
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.08
669 0.08
670 0.09
671 0.12
672 0.1
673 0.12
674 0.13
675 0.16
676 0.16
677 0.2
678 0.19
679 0.17
680 0.22
681 0.21
682 0.26
683 0.25
684 0.26
685 0.27
686 0.36
687 0.42
688 0.38
689 0.38
690 0.33
691 0.32
692 0.32
693 0.29
694 0.23
695 0.19
696 0.23
697 0.29
698 0.33
699 0.33
700 0.34
701 0.34
702 0.32
703 0.31
704 0.28
705 0.21
706 0.17
707 0.24
708 0.23
709 0.23
710 0.22
711 0.22
712 0.23
713 0.25
714 0.23
715 0.16
716 0.16
717 0.16
718 0.17
719 0.19
720 0.16
721 0.18
722 0.19
723 0.18
724 0.24
725 0.24
726 0.23
727 0.26
728 0.31
729 0.29
730 0.29
731 0.32
732 0.26
733 0.25
734 0.24
735 0.19
736 0.14
737 0.13
738 0.1
739 0.07
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.06
745 0.07
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.12
750 0.11
751 0.11
752 0.13
753 0.15
754 0.13
755 0.14
756 0.13
757 0.2
758 0.2
759 0.23
760 0.22
761 0.21
762 0.2
763 0.21
764 0.21
765 0.21
766 0.22
767 0.27
768 0.27
769 0.29
770 0.28
771 0.27
772 0.27
773 0.2
774 0.18
775 0.12
776 0.09
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.09
782 0.09
783 0.08
784 0.09
785 0.09
786 0.11
787 0.13
788 0.14
789 0.13
790 0.15
791 0.18
792 0.18
793 0.19
794 0.24
795 0.28
796 0.33
797 0.4
798 0.45
799 0.52
800 0.55
801 0.62
802 0.66
803 0.67
804 0.67
805 0.69
806 0.62
807 0.53
808 0.5
809 0.43
810 0.35
811 0.28
812 0.21
813 0.15
814 0.14
815 0.15
816 0.14
817 0.14
818 0.13
819 0.17
820 0.21
821 0.21
822 0.24
823 0.23
824 0.24
825 0.24
826 0.29
827 0.25
828 0.24
829 0.24
830 0.21
831 0.24
832 0.22
833 0.22
834 0.16
835 0.17
836 0.14
837 0.12
838 0.12
839 0.1
840 0.1
841 0.09
842 0.1
843 0.09
844 0.09
845 0.1
846 0.12
847 0.13
848 0.19
849 0.22
850 0.22
851 0.27
852 0.27
853 0.27
854 0.26
855 0.25
856 0.2
857 0.21
858 0.21
859 0.19
860 0.18
861 0.18
862 0.17
863 0.16
864 0.2
865 0.21
866 0.24
867 0.27
868 0.29
869 0.31
870 0.38
871 0.44
872 0.45
873 0.47
874 0.43
875 0.43
876 0.46
877 0.5
878 0.48
879 0.5
880 0.5
881 0.49
882 0.48
883 0.44
884 0.4
885 0.34
886 0.28
887 0.21
888 0.15
889 0.12
890 0.11
891 0.1
892 0.09
893 0.1
894 0.14
895 0.16
896 0.15
897 0.15
898 0.18
899 0.2
900 0.22
901 0.24
902 0.24
903 0.24
904 0.26
905 0.26
906 0.23
907 0.21
908 0.19
909 0.16
910 0.12
911 0.12
912 0.12
913 0.18
914 0.19
915 0.22
916 0.22
917 0.23
918 0.23
919 0.3
920 0.29
921 0.24
922 0.26
923 0.28
924 0.3
925 0.3
926 0.28
927 0.22
928 0.19
929 0.17
930 0.14
931 0.1
932 0.08
933 0.08
934 0.08
935 0.11
936 0.13
937 0.13
938 0.13
939 0.12
940 0.12
941 0.13
942 0.14
943 0.11
944 0.1
945 0.13
946 0.13
947 0.13
948 0.14
949 0.17
950 0.17
951 0.19
952 0.21
953 0.2
954 0.26
955 0.28
956 0.27
957 0.24
958 0.28
959 0.3
960 0.36
961 0.36
962 0.33
963 0.37
964 0.39
965 0.44
966 0.48
967 0.5
968 0.42
969 0.41
970 0.41
971 0.42
972 0.48
973 0.48
974 0.49
975 0.5
976 0.55
977 0.57
978 0.55
979 0.55
980 0.53
981 0.58
982 0.58
983 0.55
984 0.59
985 0.63
986 0.66
987 0.7
988 0.72
989 0.71
990 0.7
991 0.68
992 0.67
993 0.7
994 0.71
995 0.69
996 0.63
997 0.55
998 0.5
999 0.47
1000 0.4
1001 0.29
1002 0.23
1003 0.17
1004 0.13
1005 0.12
1006 0.09
1007 0.09
1008 0.13
1009 0.21
1010 0.22
1011 0.23
1012 0.25
1013 0.28
1014 0.33
1015 0.38
1016 0.43
1017 0.45
1018 0.53
1019 0.6
1020 0.66