FuNGI

W4KJP7

Protein Details

Accession

W4KJP7

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-47	PSINLLFHPKKKKTNGAAPSPQPSPPKRPRPAVARPPPKKPDDD	Hydrophilic
151-183	SSSNRQDKGKDKTQPPKKKFQKKTKQVFKVAEE	Hydrophilic
574-614	VTPTAHPTKPSKKRKATDDSAAGQHKNKKSKPHPPPAVGPD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-43	PKKKKTNGAAPSPQPSPPKRPRPAVARPPPKK
158-175	KGKDKTQPPKKKFQKKTK
582-607	KPSKKRKATDDSAAGQHKNKKSKPHP

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 8, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	hir:HETIRDRAFT_448620 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAPPSINLLFHPKKKKTNGAAPSPQPSPPKRPRPAVARPPPKKPDDDDDMAALPEGPYTEFKLVSSALNGWKYDVMKFDSRKQVDILKWPAPVKLNRKDLRRSAGAADDGVPQARAVGPMLGPDGKPVIGMDGRTVMVDAEGRPIHADGSSSSNRQDKGKDKTQPPKKKFQKKTKQVFKVAEEIRQLRKEERYPWVLEDASGGEIWVGAMEEVVKAETQAFFMPASNNTFKFVPAHRWYKFQKKPNHYIPSLEEAESLMARINQNKDPIRWLLKHNGQGPSAATAATIKGEPDDGMTVGQSLGPGGRQLRTVDKGSDALFGDDDDEGGGRKRKDNGAEGSYDEMLFAEDFQDDEEKMNVEEEEDDLTKELEERLQREYISANKQREGHIDESDDEEDFELSKAGKALNKLVNKHGDNDDDDDDGLFNPYKNDDEEEEEEEEEAIVTNEPAVMSQPLPSRATPIASRPPSQPTVAPAQPSVPSTSNSRATSPVPSHGGHVVVAKRATSPKAPKPNRLGNGGRATSPLAQSSAVVASAPVRATSPAASSSQAPNGASAGSRATSPVAAPLTTPSMVTPTAHPTKPSKKRKATDDSAAGQHKNKKSKPHPPPAVGPDGKFLELEDSAVVDFLREHPSIPTRECIHNFLPYLHTPQRKAKFTALIKRIAQLKQDSTQLVLRSAYRTTGAGPSK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.8
3	0.79
4	0.81
5	0.82
6	0.82
7	0.83
8	0.8
9	0.77
10	0.7
11	0.66
12	0.64
13	0.61
14	0.62
15	0.63
16	0.67
17	0.7
18	0.76
19	0.79
20	0.8
21	0.84
22	0.85
23	0.85
24	0.86
25	0.84
26	0.85
27	0.85
28	0.81
29	0.76
30	0.7
31	0.67
32	0.65
33	0.63
34	0.56
35	0.5
36	0.45
37	0.39
38	0.33
39	0.25
40	0.17
41	0.12
42	0.1
43	0.09
44	0.1
45	0.13
46	0.15
47	0.15
48	0.15
49	0.17
50	0.18
51	0.17
52	0.18
53	0.18
54	0.22
55	0.25
56	0.25
57	0.24
58	0.27
59	0.27
60	0.27
61	0.27
62	0.26
63	0.31
64	0.35
65	0.42
66	0.49
67	0.5
68	0.5
69	0.48
70	0.5
71	0.46
72	0.52
73	0.5
74	0.44
75	0.47
76	0.46
77	0.47
78	0.46
79	0.5
80	0.5
81	0.53
82	0.59
83	0.61
84	0.67
85	0.72
86	0.72
87	0.72
88	0.66
89	0.6
90	0.53
91	0.51
92	0.45
93	0.37
94	0.32
95	0.27
96	0.23
97	0.21
98	0.17
99	0.12
100	0.12
101	0.11
102	0.1
103	0.08
104	0.09
105	0.09
106	0.1
107	0.12
108	0.13
109	0.12
110	0.13
111	0.13
112	0.12
113	0.12
114	0.11
115	0.12
116	0.12
117	0.12
118	0.12
119	0.13
120	0.13
121	0.13
122	0.13
123	0.09
124	0.08
125	0.1
126	0.09
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.13
131	0.13
132	0.13
133	0.12
134	0.12
135	0.08
136	0.15
137	0.18
138	0.19
139	0.22
140	0.26
141	0.28
142	0.3
143	0.35
144	0.36
145	0.42
146	0.5
147	0.55
148	0.6
149	0.69
150	0.77
151	0.82
152	0.8
153	0.82
154	0.84
155	0.86
156	0.87
157	0.88
158	0.89
159	0.89
160	0.94
161	0.93
162	0.92
163	0.9
164	0.85
165	0.77
166	0.75
167	0.66
168	0.6
169	0.55
170	0.5
171	0.47
172	0.46
173	0.44
174	0.39
175	0.43
176	0.43
177	0.43
178	0.45
179	0.44
180	0.42
181	0.42
182	0.41
183	0.35
184	0.3
185	0.25
186	0.19
187	0.15
188	0.13
189	0.1
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.04
195	0.02
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.1
211	0.11
212	0.16
213	0.18
214	0.18
215	0.19
216	0.19
217	0.19
218	0.21
219	0.21
220	0.25
221	0.29
222	0.37
223	0.36
224	0.43
225	0.48
226	0.56
227	0.62
228	0.61
229	0.65
230	0.66
231	0.74
232	0.77
233	0.79
234	0.69
235	0.64
236	0.59
237	0.55
238	0.48
239	0.39
240	0.29
241	0.21
242	0.21
243	0.17
244	0.14
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.12
249	0.15
250	0.17
251	0.24
252	0.26
253	0.27
254	0.28
255	0.32
256	0.34
257	0.33
258	0.34
259	0.36
260	0.39
261	0.44
262	0.46
263	0.45
264	0.4
265	0.38
266	0.35
267	0.28
268	0.23
269	0.16
270	0.11
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.07
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.08
295	0.1
296	0.14
297	0.17
298	0.18
299	0.18
300	0.18
301	0.19
302	0.18
303	0.19
304	0.15
305	0.12
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.06
315	0.1
316	0.1
317	0.12
318	0.15
319	0.19
320	0.22
321	0.27
322	0.29
323	0.28
324	0.28
325	0.26
326	0.25
327	0.22
328	0.19
329	0.14
330	0.09
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.08
358	0.09
359	0.11
360	0.13
361	0.15
362	0.15
363	0.15
364	0.16
365	0.18
366	0.25
367	0.3
368	0.29
369	0.31
370	0.33
371	0.34
372	0.36
373	0.35
374	0.29
375	0.24
376	0.24
377	0.21
378	0.22
379	0.21
380	0.18
381	0.13
382	0.11
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.09
392	0.1
393	0.16
394	0.22
395	0.26
396	0.27
397	0.32
398	0.38
399	0.37
400	0.39
401	0.36
402	0.32
403	0.29
404	0.3
405	0.27
406	0.2
407	0.19
408	0.16
409	0.13
410	0.11
411	0.11
412	0.08
413	0.07
414	0.07
415	0.08
416	0.09
417	0.09
418	0.11
419	0.11
420	0.16
421	0.18
422	0.2
423	0.2
424	0.2
425	0.19
426	0.17
427	0.15
428	0.1
429	0.08
430	0.05
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.09
441	0.12
442	0.15
443	0.17
444	0.17
445	0.2
446	0.2
447	0.22
448	0.2
449	0.23
450	0.29
451	0.31
452	0.33
453	0.32
454	0.37
455	0.37
456	0.37
457	0.32
458	0.26
459	0.3
460	0.29
461	0.28
462	0.23
463	0.23
464	0.23
465	0.23
466	0.23
467	0.18
468	0.18
469	0.21
470	0.25
471	0.3
472	0.29
473	0.3
474	0.29
475	0.29
476	0.33
477	0.31
478	0.3
479	0.27
480	0.26
481	0.27
482	0.25
483	0.25
484	0.19
485	0.21
486	0.19
487	0.18
488	0.18
489	0.16
490	0.18
491	0.2
492	0.22
493	0.26
494	0.32
495	0.39
496	0.49
497	0.54
498	0.6
499	0.66
500	0.73
501	0.69
502	0.69
503	0.63
504	0.6
505	0.63
506	0.55
507	0.47
508	0.39
509	0.38
510	0.32
511	0.3
512	0.23
513	0.15
514	0.14
515	0.14
516	0.14
517	0.12
518	0.09
519	0.08
520	0.07
521	0.07
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.08
526	0.09
527	0.1
528	0.11
529	0.12
530	0.12
531	0.13
532	0.14
533	0.16
534	0.18
535	0.2
536	0.21
537	0.2
538	0.18
539	0.17
540	0.16
541	0.14
542	0.12
543	0.1
544	0.09
545	0.08
546	0.09
547	0.09
548	0.09
549	0.09
550	0.13
551	0.13
552	0.12
553	0.13
554	0.14
555	0.17
556	0.16
557	0.17
558	0.12
559	0.14
560	0.14
561	0.15
562	0.15
563	0.2
564	0.26
565	0.27
566	0.3
567	0.36
568	0.47
569	0.56
570	0.65
571	0.68
572	0.72
573	0.79
574	0.85
575	0.86
576	0.83
577	0.82
578	0.78
579	0.71
580	0.68
581	0.66
582	0.59
583	0.55
584	0.56
585	0.55
586	0.57
587	0.57
588	0.61
589	0.66
590	0.74
591	0.79
592	0.82
593	0.84
594	0.8
595	0.84
596	0.8
597	0.8
598	0.72
599	0.62
600	0.57
601	0.49
602	0.44
603	0.35
604	0.28
605	0.22
606	0.19
607	0.18
608	0.12
609	0.11
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.06
614	0.07
615	0.09
616	0.14
617	0.13
618	0.14
619	0.19
620	0.25
621	0.3
622	0.32
623	0.36
624	0.35
625	0.44
626	0.46
627	0.48
628	0.45
629	0.46
630	0.45
631	0.4
632	0.41
633	0.35
634	0.41
635	0.43
636	0.46
637	0.45
638	0.54
639	0.61
640	0.62
641	0.64
642	0.62
643	0.64
644	0.67
645	0.72
646	0.67
647	0.66
648	0.61
649	0.62
650	0.62
651	0.56
652	0.53
653	0.5
654	0.5
655	0.46
656	0.5
657	0.45
658	0.41
659	0.43
660	0.38
661	0.33
662	0.3
663	0.28
664	0.26
665	0.26
666	0.25
667	0.21
668	0.2
669	0.21

W4KJP7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer