Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4K004

Protein Details
Accession W4K004    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-158KGGPIKAKRATRKPGRQNPEIBasic
336-356VFEGRKPGKLPPKRPWDHKIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-153PIKAKRATRKPGR
340-350RKPGKLPPKRP
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 11.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
KEGG hir:HETIRDRAFT_219397  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13650  Asp_protease_2  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MKSHSAPSLRIETILIGKNRKAATQALVDSGATGIFMHPRFVETHRIKTRKTPAPIPVNTVQNTEFKGGPITKFTELKLQVLGEQGGTHTESAKFYIAEIGKEDVILGTGWLLEHNPEVDWHAYGLHFTRCPPSCQIKGGPIKAKRATRKPGRQNPEIQRIETVPRKNDYSITLQKPGQAQPGRKVGNATVPHPRIKPNIRGSQPEGRNPEYLRARAKHYAAPTWAEEDTPEDGVRLSALPSTDLEEDGVYLVRCLNTRQLEALELYNDGKENIDIHRIETTETLVTNTPVPRKEPIGKQTKHTNSQKLAEEASKGKPELSFEEIVPKEYWDYRKVFEGRKPGKLPPKRPWDHKIELKDGMEHSLRPKLYSLSPMEQTELKKFIDENLKKGFIRESKSHIASP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.32
4 0.33
5 0.39
6 0.4
7 0.39
8 0.35
9 0.32
10 0.32
11 0.34
12 0.34
13 0.3
14 0.3
15 0.28
16 0.25
17 0.22
18 0.17
19 0.1
20 0.08
21 0.07
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.15
27 0.18
28 0.21
29 0.31
30 0.3
31 0.41
32 0.49
33 0.54
34 0.55
35 0.61
36 0.69
37 0.67
38 0.69
39 0.66
40 0.66
41 0.71
42 0.71
43 0.68
44 0.64
45 0.61
46 0.56
47 0.51
48 0.43
49 0.36
50 0.36
51 0.32
52 0.26
53 0.2
54 0.24
55 0.24
56 0.24
57 0.24
58 0.26
59 0.28
60 0.29
61 0.3
62 0.33
63 0.32
64 0.32
65 0.3
66 0.26
67 0.23
68 0.23
69 0.23
70 0.14
71 0.13
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.13
80 0.14
81 0.12
82 0.12
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.06
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.2
117 0.21
118 0.24
119 0.29
120 0.34
121 0.34
122 0.37
123 0.39
124 0.4
125 0.46
126 0.49
127 0.51
128 0.48
129 0.53
130 0.55
131 0.6
132 0.6
133 0.62
134 0.66
135 0.68
136 0.74
137 0.78
138 0.82
139 0.82
140 0.79
141 0.8
142 0.78
143 0.78
144 0.7
145 0.59
146 0.51
147 0.45
148 0.45
149 0.42
150 0.37
151 0.3
152 0.31
153 0.32
154 0.31
155 0.31
156 0.28
157 0.3
158 0.34
159 0.34
160 0.36
161 0.34
162 0.36
163 0.37
164 0.35
165 0.36
166 0.32
167 0.31
168 0.33
169 0.4
170 0.39
171 0.36
172 0.36
173 0.28
174 0.32
175 0.31
176 0.28
177 0.28
178 0.29
179 0.32
180 0.32
181 0.34
182 0.32
183 0.36
184 0.42
185 0.41
186 0.47
187 0.47
188 0.49
189 0.52
190 0.54
191 0.52
192 0.49
193 0.46
194 0.4
195 0.4
196 0.37
197 0.39
198 0.33
199 0.33
200 0.33
201 0.31
202 0.33
203 0.35
204 0.36
205 0.33
206 0.32
207 0.32
208 0.28
209 0.28
210 0.24
211 0.22
212 0.2
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.14
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.17
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.14
262 0.13
263 0.14
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.17
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.17
276 0.2
277 0.2
278 0.23
279 0.24
280 0.29
281 0.35
282 0.39
283 0.45
284 0.52
285 0.52
286 0.55
287 0.63
288 0.65
289 0.68
290 0.68
291 0.67
292 0.62
293 0.66
294 0.65
295 0.56
296 0.51
297 0.43
298 0.39
299 0.34
300 0.34
301 0.31
302 0.28
303 0.26
304 0.25
305 0.26
306 0.26
307 0.28
308 0.25
309 0.21
310 0.3
311 0.29
312 0.31
313 0.29
314 0.25
315 0.23
316 0.26
317 0.3
318 0.27
319 0.3
320 0.28
321 0.37
322 0.42
323 0.45
324 0.46
325 0.53
326 0.54
327 0.6
328 0.63
329 0.63
330 0.68
331 0.71
332 0.74
333 0.73
334 0.78
335 0.77
336 0.81
337 0.8
338 0.79
339 0.78
340 0.78
341 0.76
342 0.71
343 0.69
344 0.62
345 0.58
346 0.5
347 0.46
348 0.39
349 0.33
350 0.31
351 0.32
352 0.31
353 0.28
354 0.29
355 0.28
356 0.29
357 0.35
358 0.37
359 0.36
360 0.4
361 0.4
362 0.4
363 0.41
364 0.41
365 0.39
366 0.37
367 0.31
368 0.29
369 0.28
370 0.32
371 0.39
372 0.39
373 0.4
374 0.44
375 0.49
376 0.48
377 0.49
378 0.51
379 0.46
380 0.5
381 0.49
382 0.49
383 0.53