Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JNU8

Protein Details
Accession W4JNU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-197EEDRERHKRLRERRWVQPVSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-186HKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 12, mito 6.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR042326  Ctk3  
IPR024637  Ctk3_C  
IPR024638  Ctk3_N  
IPR008942  ENTH_VHS  
Gene Ontology GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
KEGG hir:HETIRDRAFT_332414  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12243  CTK3  
PF12350  CTK3_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
Amino Acid Sequences MQFLTLLRRLNASQQSIQKVVGYALKYYSRCGEDLWDCIVEECQKGSINNRINILYFLDSLCETSLLAKTHPTSQSSDKSSNNCFYVDYVSRDLGKIIEYVVPEGRQGLPNMMSTKQILESWRSKRIIDPQIVDSAMTSLDDRNAPTNSPPHSIPSPLASHSSDPAPLPRHEVFKRIEEDRERHKRLRERRWVQPVSHAPRIHQLASFMPLTDDGDGEDELTMDIEFENEWETTSDWNEDDDDAVGEENELCFPGEGEAPMDLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.49
3 0.48
4 0.47
5 0.4
6 0.34
7 0.3
8 0.28
9 0.23
10 0.19
11 0.21
12 0.26
13 0.26
14 0.27
15 0.31
16 0.28
17 0.27
18 0.27
19 0.3
20 0.26
21 0.28
22 0.29
23 0.24
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.19
28 0.17
29 0.15
30 0.14
31 0.15
32 0.16
33 0.2
34 0.27
35 0.33
36 0.35
37 0.36
38 0.35
39 0.34
40 0.34
41 0.32
42 0.24
43 0.17
44 0.14
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.09
50 0.07
51 0.08
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.14
56 0.15
57 0.21
58 0.24
59 0.24
60 0.25
61 0.3
62 0.36
63 0.39
64 0.42
65 0.4
66 0.42
67 0.45
68 0.44
69 0.4
70 0.34
71 0.28
72 0.24
73 0.25
74 0.24
75 0.22
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.14
82 0.12
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.13
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.13
105 0.12
106 0.15
107 0.21
108 0.25
109 0.31
110 0.32
111 0.31
112 0.32
113 0.4
114 0.42
115 0.38
116 0.36
117 0.3
118 0.31
119 0.31
120 0.28
121 0.19
122 0.12
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.04
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.16
135 0.17
136 0.19
137 0.19
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.2
142 0.19
143 0.19
144 0.17
145 0.2
146 0.17
147 0.17
148 0.17
149 0.17
150 0.14
151 0.13
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.22
156 0.22
157 0.29
158 0.29
159 0.34
160 0.32
161 0.34
162 0.38
163 0.34
164 0.38
165 0.37
166 0.41
167 0.46
168 0.54
169 0.55
170 0.56
171 0.62
172 0.65
173 0.69
174 0.75
175 0.76
176 0.73
177 0.77
178 0.82
179 0.79
180 0.71
181 0.7
182 0.69
183 0.66
184 0.67
185 0.57
186 0.48
187 0.51
188 0.53
189 0.44
190 0.35
191 0.29
192 0.23
193 0.26
194 0.25
195 0.17
196 0.14
197 0.13
198 0.14
199 0.12
200 0.1
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.11