Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4K0C6

Protein Details
Accession W4K0C6    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-66RESAGFAKSRKNREKDTKNVGRRSGRGBasic
476-499SAVIKKGERRANPLKERRKFDVTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-69RKNRFATRRESAGFAKSRKNREKDTKNVGRRSGRGTRR
480-493KKGERRANPLKERR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, cyto 6, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041708  PUS1/PUS2-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0031119  P:tRNA pseudouridine synthesis  
KEGG hir:HETIRDRAFT_324142  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02568  PseudoU_synth_PUS1_PUS2  
Amino Acid Sequences MESSTDAADPSQSESILDAESTLVAEAQPEGRKNRFATRRESAGFAKSRKNREKDTKNVGRRSGRGTRRNDETAKEGSEEENVDKAPRLPKRQCALLIGFCGTGCSGMQMCPNVRTIEGVLFEAMVKAGAVSQDNADDPVKVNLGRAARTDAGVHAAGNVVSIKMITDVPDVPDIVSHINSFLPPEIRLWGYVRVQNSFNARVSCDSRKYTYFFPSYLLIPPKPGSGLDQTLNNLPPSSSASNAAPVEQPTSHPFWSELAHADSTKEDDLIRKRKWRVGSEMVEKLREIAKKFEASHNFHNFTVGRDFSDRSTQRHMKKIEVADPTVYGETEWISVMFHGQSFMLHQRKMMSALVLSCRTSTPTQIIDELYGPRQVLVPKMPSLGLLLEHPIFESYNAKIARVNDKLSPTDPLYRPPIDFDIYKDAIEQFKQEHIYDRMRDIEDRGGVFDAWVRSIDAYSGNDLAYLNTKGIIPPSAVIKKGERRANPLKERRKFDVTSFSSSGKIDLEIDEEEGEAEQESTLDKAELAEMEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.14
4 0.13
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.06
11 0.05
12 0.06
13 0.07
14 0.12
15 0.16
16 0.21
17 0.27
18 0.3
19 0.36
20 0.4
21 0.49
22 0.53
23 0.54
24 0.58
25 0.59
26 0.64
27 0.6
28 0.61
29 0.54
30 0.54
31 0.56
32 0.52
33 0.55
34 0.55
35 0.63
36 0.68
37 0.72
38 0.74
39 0.77
40 0.82
41 0.82
42 0.85
43 0.85
44 0.85
45 0.86
46 0.85
47 0.81
48 0.75
49 0.74
50 0.73
51 0.72
52 0.71
53 0.72
54 0.7
55 0.7
56 0.73
57 0.68
58 0.61
59 0.56
60 0.52
61 0.46
62 0.4
63 0.34
64 0.27
65 0.26
66 0.25
67 0.21
68 0.19
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.2
73 0.26
74 0.31
75 0.4
76 0.44
77 0.52
78 0.56
79 0.62
80 0.6
81 0.57
82 0.55
83 0.49
84 0.45
85 0.37
86 0.32
87 0.25
88 0.24
89 0.18
90 0.13
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.12
96 0.15
97 0.17
98 0.18
99 0.21
100 0.19
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.17
105 0.16
106 0.15
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.1
111 0.09
112 0.06
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.14
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.2
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.16
139 0.17
140 0.16
141 0.14
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.09
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.17
178 0.18
179 0.21
180 0.21
181 0.22
182 0.22
183 0.24
184 0.26
185 0.25
186 0.25
187 0.23
188 0.22
189 0.23
190 0.27
191 0.29
192 0.29
193 0.29
194 0.29
195 0.31
196 0.33
197 0.33
198 0.34
199 0.31
200 0.27
201 0.26
202 0.25
203 0.24
204 0.25
205 0.26
206 0.2
207 0.2
208 0.2
209 0.19
210 0.18
211 0.16
212 0.14
213 0.14
214 0.16
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.18
219 0.19
220 0.17
221 0.13
222 0.11
223 0.11
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.13
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.11
256 0.19
257 0.26
258 0.3
259 0.36
260 0.39
261 0.43
262 0.49
263 0.49
264 0.49
265 0.49
266 0.51
267 0.5
268 0.53
269 0.49
270 0.44
271 0.39
272 0.33
273 0.29
274 0.25
275 0.21
276 0.18
277 0.2
278 0.23
279 0.25
280 0.31
281 0.34
282 0.36
283 0.43
284 0.46
285 0.46
286 0.42
287 0.43
288 0.36
289 0.31
290 0.3
291 0.22
292 0.17
293 0.16
294 0.17
295 0.15
296 0.25
297 0.24
298 0.24
299 0.33
300 0.39
301 0.42
302 0.49
303 0.49
304 0.44
305 0.48
306 0.49
307 0.46
308 0.42
309 0.39
310 0.32
311 0.3
312 0.28
313 0.22
314 0.18
315 0.11
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.08
330 0.16
331 0.19
332 0.19
333 0.2
334 0.21
335 0.22
336 0.24
337 0.23
338 0.16
339 0.12
340 0.15
341 0.18
342 0.17
343 0.17
344 0.15
345 0.15
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.19
353 0.19
354 0.17
355 0.18
356 0.18
357 0.16
358 0.15
359 0.13
360 0.12
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.17
365 0.19
366 0.18
367 0.2
368 0.19
369 0.17
370 0.17
371 0.15
372 0.12
373 0.09
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.1
381 0.11
382 0.09
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.19
387 0.22
388 0.29
389 0.3
390 0.32
391 0.29
392 0.33
393 0.35
394 0.33
395 0.34
396 0.29
397 0.35
398 0.33
399 0.34
400 0.36
401 0.36
402 0.35
403 0.35
404 0.35
405 0.29
406 0.28
407 0.27
408 0.29
409 0.28
410 0.27
411 0.25
412 0.24
413 0.24
414 0.24
415 0.22
416 0.16
417 0.19
418 0.22
419 0.22
420 0.26
421 0.29
422 0.35
423 0.35
424 0.36
425 0.37
426 0.36
427 0.37
428 0.33
429 0.33
430 0.3
431 0.28
432 0.26
433 0.23
434 0.2
435 0.19
436 0.2
437 0.16
438 0.13
439 0.13
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.14
447 0.14
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.14
454 0.12
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.14
459 0.15
460 0.12
461 0.12
462 0.2
463 0.24
464 0.25
465 0.27
466 0.33
467 0.41
468 0.48
469 0.55
470 0.51
471 0.56
472 0.65
473 0.73
474 0.76
475 0.78
476 0.8
477 0.81
478 0.85
479 0.83
480 0.8
481 0.73
482 0.67
483 0.68
484 0.62
485 0.61
486 0.56
487 0.51
488 0.45
489 0.42
490 0.38
491 0.28
492 0.24
493 0.17
494 0.14
495 0.16
496 0.14
497 0.15
498 0.14
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.08
513 0.1