Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JWA2

Protein Details
Accession W4JWA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-193NRDVDKKRNFSRKRANEDEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-26RSSAKANRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG hir:HETIRDRAFT_326672  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MTMEQRKEKMEELRAKMRSSAKANRKSVIEESARAKINARDAARLEKQKKLAEVLRTKADAEERGEDVERAKNWEWTIEENDEWEKKLARKARRADFEFHDDAHAARRRYKKDLDQIKPDLTQYNRQKEVAMGLAPGTLTKRAAESLYRDANSLLYADNKPTEDAIDRVISKINRDVDKKRNFSRKRANEDEGDITYINERNRVFNKKIARYYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.6
3 0.61
4 0.59
5 0.57
6 0.55
7 0.58
8 0.59
9 0.66
10 0.68
11 0.66
12 0.62
13 0.59
14 0.55
15 0.53
16 0.46
17 0.41
18 0.41
19 0.43
20 0.42
21 0.38
22 0.37
23 0.32
24 0.35
25 0.37
26 0.34
27 0.33
28 0.33
29 0.41
30 0.45
31 0.52
32 0.49
33 0.48
34 0.52
35 0.51
36 0.51
37 0.49
38 0.47
39 0.47
40 0.5
41 0.48
42 0.47
43 0.44
44 0.43
45 0.38
46 0.36
47 0.29
48 0.26
49 0.24
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.18
57 0.2
58 0.2
59 0.22
60 0.21
61 0.24
62 0.23
63 0.22
64 0.26
65 0.22
66 0.21
67 0.2
68 0.22
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.16
73 0.16
74 0.23
75 0.29
76 0.33
77 0.41
78 0.49
79 0.56
80 0.62
81 0.63
82 0.61
83 0.58
84 0.57
85 0.5
86 0.42
87 0.34
88 0.26
89 0.22
90 0.24
91 0.25
92 0.19
93 0.25
94 0.31
95 0.34
96 0.39
97 0.43
98 0.44
99 0.49
100 0.58
101 0.57
102 0.57
103 0.57
104 0.54
105 0.5
106 0.43
107 0.38
108 0.3
109 0.34
110 0.34
111 0.38
112 0.38
113 0.37
114 0.37
115 0.33
116 0.33
117 0.25
118 0.18
119 0.1
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.11
132 0.14
133 0.19
134 0.23
135 0.23
136 0.23
137 0.22
138 0.22
139 0.2
140 0.16
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.24
160 0.28
161 0.3
162 0.35
163 0.42
164 0.48
165 0.57
166 0.63
167 0.66
168 0.71
169 0.71
170 0.76
171 0.8
172 0.8
173 0.8
174 0.8
175 0.76
176 0.69
177 0.68
178 0.62
179 0.52
180 0.44
181 0.34
182 0.27
183 0.25
184 0.24
185 0.2
186 0.21
187 0.2
188 0.25
189 0.32
190 0.39
191 0.4
192 0.43
193 0.53
194 0.57
195 0.64
196 0.66
197 0.68
198 0.65
199 0.69
200 0.72
201 0.65
202 0.59
203 0.54
204 0.51
205 0.46
206 0.43
207 0.4
208 0.35
209 0.35
210 0.32