Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KEQ6

Protein Details
Accession W4KEQ6    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-131AKPAEEKDKERKEKKPRARRPGRRGAKAVBasic
157-182ATGDADKPKKKKKKTTKKPRSSAEGEBasic
189-212TEGEAKPPRKKRVPRPPRPAGEQPBasic
245-269KVNSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-129EEKDKERKEKKPRARRPGRRGAK
163-178KPKKKKKKTTKKPRSS
192-207EAKPPRKKRVPRPPRP
252-263VRRRWGKPRKSK
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 14.333, nucl 11, mito_nucl 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG hir:HETIRDRAFT_381782  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAPVTENGVPPVAQDQVEEAPGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVESDIISAQVIMRGNRSAGYGFVALTSAEAAQKAVEALDKQELDGRPIIVEVAKPAEEKDKERKEKKPRARRPGRRGAKAVTGEVTEAEANGETNEAEAGKADDATATGDADKPKKKKKKTTKKPRSSAEGEATDAAATEGEAKPPRKKRVPRPPRPAGEQPVGDLSKTVLFVANLGFNIDDAGLAALFTDVGIKVNSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDVGDEEEQTKAIAALEGKEVGGRQIAVKIAVDAQTNEEKEEGSADPVIESAAEQADEEATPEATIVAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.17
4 0.16
5 0.13
6 0.13
7 0.15
8 0.15
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.11
16 0.1
17 0.08
18 0.12
19 0.14
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.14
25 0.16
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.1
48 0.1
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.12
55 0.11
56 0.13
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.19
79 0.19
80 0.2
81 0.21
82 0.19
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.1
87 0.1
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.17
94 0.19
95 0.24
96 0.33
97 0.41
98 0.5
99 0.57
100 0.66
101 0.7
102 0.78
103 0.84
104 0.85
105 0.86
106 0.87
107 0.92
108 0.93
109 0.92
110 0.92
111 0.91
112 0.86
113 0.8
114 0.72
115 0.68
116 0.59
117 0.5
118 0.39
119 0.3
120 0.23
121 0.19
122 0.17
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.07
147 0.09
148 0.14
149 0.19
150 0.25
151 0.34
152 0.43
153 0.52
154 0.61
155 0.7
156 0.77
157 0.83
158 0.89
159 0.9
160 0.92
161 0.93
162 0.87
163 0.84
164 0.77
165 0.7
166 0.64
167 0.54
168 0.44
169 0.35
170 0.3
171 0.22
172 0.17
173 0.11
174 0.05
175 0.04
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.13
180 0.15
181 0.23
182 0.31
183 0.39
184 0.46
185 0.55
186 0.64
187 0.71
188 0.8
189 0.83
190 0.86
191 0.87
192 0.83
193 0.82
194 0.78
195 0.72
196 0.66
197 0.55
198 0.46
199 0.41
200 0.36
201 0.29
202 0.22
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.03
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.09
234 0.12
235 0.13
236 0.19
237 0.24
238 0.3
239 0.37
240 0.46
241 0.53
242 0.61
243 0.7
244 0.75
245 0.8
246 0.86
247 0.89
248 0.87
249 0.84
250 0.82
251 0.8
252 0.73
253 0.64
254 0.55
255 0.46
256 0.38
257 0.34
258 0.25
259 0.17
260 0.13
261 0.11
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.16
286 0.16
287 0.14
288 0.18
289 0.23
290 0.24
291 0.24
292 0.22
293 0.2
294 0.18
295 0.21
296 0.17
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.09
311 0.08
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.08