Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KDK1

Protein Details
Accession W4KDK1    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-116GNEGVSGRKRVQKKRKRAQRTEEELKEMPBasic
129-156IDDILKPKKSSRPKKRKKDEDVMDRVADBasic
744-764EEEKVRTKTAKKPRKLSDSSPHydrophilic
848-871QSPQTPRSPRTPTRTLRRVRQTAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-106GAAKNKKRAVRRSGAGNEGVSGRKRVQKKRKRAQ
134-146KPKKSSRPKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG hir:HETIRDRAFT_458652  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MPDIRPPQQTRFAERDIFGSDSELSDAPDADDEELERPIPVPASTFALAGAVDDDESSGDSGDEYMQDRPAAGAAKNKKRAVRRSGAGNEGVSGRKRVQKKRKRAQRTEEELKEMPQHEADKMRLDMAIDDILKPKKSSRPKKRKKDEDVMDRVADEEVSRLREAMLAAAEDDEKSRSNHQPATMKLKLLPQVMEVLRKSGLSQSIVDNNLLEGVRRWLEPLPDRSLPALNIQKEFLETLQKLEYIDTNVLKESKLGRVVLFYTKCKRVTPEIARVANALVSAWSRPIIKRSASYRDRAIPVLEDAAEDGPAPRQNRLTAILARAREGESDRNRVRKNAVMIPQRELGTYTVAPRNHAVSVQSSVTMDTERRRRNADRIRSLTRKLSQKARADLEPGVNVFASSAPSLPPSLFIPKGYPRMPSTHSVPPLAVIMPHPHLRLPSARLSQSSAPRTPSCGSPVQPSFFLPSNSNRKSSDSWTSSNFDPDELEWEWKPDQSLLLARTLDALPAHLLTPFIGPVPPPNLLDKVARGVVKAKGPLDWPHSVRATRSKLIELSRQRAKEAQEEKRRNTIEEEDFLYDVDGFHPAVGRPLYRQSSMDFMQSARLDVGDTDAFSRAMHRLQRTERAIANPPYHLRPHSPDTHLIYAHTLNPSTPSSTTLHSTRSARSSKSSLRRTASTLSNSSSDKHALPVHDPLAKTVRRTDSYGNLRQPLKRAPSYGVPVKRETHALQQRNSLTEPSSDEEEKVRTKTAKKPRKLSDSSPSSSTPTTSDSDLARKPPKTVSTTPKAASTTGAAAAARRRANPQRNPSMLGPELLLHAQPAHEPAYMRTQIPSFEPQPHAVLAPQSPQTPRSPRTPTRTLRRVRQTAFPPRAARRISFGGLLAPAEGDAPVLESLGAGEARGLGLGSAFELR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.5
3 0.43
4 0.4
5 0.33
6 0.28
7 0.23
8 0.19
9 0.2
10 0.17
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.14
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.12
26 0.13
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.18
31 0.19
32 0.18
33 0.16
34 0.16
35 0.15
36 0.13
37 0.12
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.09
51 0.1
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.23
61 0.32
62 0.42
63 0.5
64 0.55
65 0.6
66 0.66
67 0.74
68 0.75
69 0.75
70 0.7
71 0.71
72 0.72
73 0.71
74 0.64
75 0.55
76 0.47
77 0.4
78 0.38
79 0.3
80 0.27
81 0.27
82 0.31
83 0.41
84 0.5
85 0.59
86 0.65
87 0.75
88 0.83
89 0.89
90 0.92
91 0.94
92 0.94
93 0.94
94 0.93
95 0.92
96 0.86
97 0.81
98 0.71
99 0.63
100 0.59
101 0.49
102 0.41
103 0.34
104 0.31
105 0.28
106 0.31
107 0.31
108 0.3
109 0.29
110 0.27
111 0.24
112 0.23
113 0.2
114 0.17
115 0.19
116 0.15
117 0.15
118 0.2
119 0.23
120 0.24
121 0.25
122 0.28
123 0.34
124 0.44
125 0.55
126 0.61
127 0.68
128 0.78
129 0.88
130 0.94
131 0.96
132 0.95
133 0.94
134 0.93
135 0.92
136 0.9
137 0.83
138 0.73
139 0.61
140 0.52
141 0.41
142 0.31
143 0.2
144 0.14
145 0.11
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.12
163 0.18
164 0.24
165 0.29
166 0.33
167 0.38
168 0.44
169 0.47
170 0.54
171 0.51
172 0.46
173 0.43
174 0.44
175 0.43
176 0.39
177 0.34
178 0.26
179 0.3
180 0.3
181 0.33
182 0.28
183 0.25
184 0.23
185 0.22
186 0.22
187 0.19
188 0.21
189 0.17
190 0.18
191 0.2
192 0.24
193 0.25
194 0.25
195 0.21
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.14
200 0.09
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.14
206 0.2
207 0.26
208 0.3
209 0.33
210 0.33
211 0.34
212 0.35
213 0.34
214 0.3
215 0.31
216 0.33
217 0.29
218 0.28
219 0.28
220 0.26
221 0.25
222 0.25
223 0.19
224 0.19
225 0.17
226 0.18
227 0.18
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.18
232 0.14
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.16
239 0.17
240 0.16
241 0.17
242 0.19
243 0.2
244 0.18
245 0.2
246 0.22
247 0.27
248 0.28
249 0.29
250 0.32
251 0.37
252 0.39
253 0.39
254 0.4
255 0.4
256 0.47
257 0.49
258 0.53
259 0.55
260 0.55
261 0.54
262 0.5
263 0.43
264 0.33
265 0.25
266 0.15
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.14
275 0.17
276 0.19
277 0.24
278 0.29
279 0.37
280 0.39
281 0.42
282 0.43
283 0.45
284 0.45
285 0.41
286 0.36
287 0.28
288 0.25
289 0.22
290 0.18
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.15
302 0.16
303 0.18
304 0.21
305 0.23
306 0.21
307 0.25
308 0.27
309 0.26
310 0.26
311 0.25
312 0.22
313 0.19
314 0.19
315 0.23
316 0.24
317 0.32
318 0.35
319 0.42
320 0.43
321 0.44
322 0.45
323 0.41
324 0.41
325 0.4
326 0.44
327 0.44
328 0.44
329 0.45
330 0.45
331 0.41
332 0.36
333 0.3
334 0.23
335 0.18
336 0.17
337 0.17
338 0.19
339 0.19
340 0.2
341 0.2
342 0.21
343 0.18
344 0.18
345 0.15
346 0.12
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.14
356 0.22
357 0.26
358 0.28
359 0.34
360 0.37
361 0.46
362 0.54
363 0.59
364 0.6
365 0.62
366 0.68
367 0.66
368 0.66
369 0.62
370 0.59
371 0.57
372 0.51
373 0.53
374 0.54
375 0.55
376 0.57
377 0.54
378 0.49
379 0.44
380 0.41
381 0.34
382 0.27
383 0.21
384 0.16
385 0.12
386 0.11
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.08
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.15
402 0.18
403 0.24
404 0.23
405 0.25
406 0.23
407 0.26
408 0.28
409 0.28
410 0.3
411 0.3
412 0.31
413 0.29
414 0.27
415 0.23
416 0.21
417 0.18
418 0.13
419 0.08
420 0.09
421 0.11
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.14
427 0.15
428 0.16
429 0.2
430 0.22
431 0.22
432 0.22
433 0.25
434 0.28
435 0.32
436 0.33
437 0.28
438 0.29
439 0.28
440 0.31
441 0.29
442 0.26
443 0.24
444 0.22
445 0.22
446 0.24
447 0.26
448 0.24
449 0.23
450 0.22
451 0.21
452 0.2
453 0.2
454 0.16
455 0.21
456 0.29
457 0.31
458 0.33
459 0.31
460 0.33
461 0.34
462 0.36
463 0.37
464 0.32
465 0.32
466 0.33
467 0.34
468 0.31
469 0.31
470 0.27
471 0.19
472 0.16
473 0.14
474 0.15
475 0.13
476 0.15
477 0.12
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.12
486 0.11
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.09
494 0.09
495 0.06
496 0.07
497 0.07
498 0.05
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.07
507 0.1
508 0.1
509 0.11
510 0.13
511 0.14
512 0.16
513 0.16
514 0.15
515 0.15
516 0.16
517 0.15
518 0.14
519 0.16
520 0.17
521 0.19
522 0.21
523 0.19
524 0.17
525 0.19
526 0.22
527 0.25
528 0.27
529 0.25
530 0.27
531 0.29
532 0.28
533 0.29
534 0.33
535 0.33
536 0.32
537 0.32
538 0.3
539 0.31
540 0.33
541 0.39
542 0.37
543 0.38
544 0.41
545 0.4
546 0.4
547 0.4
548 0.39
549 0.4
550 0.43
551 0.46
552 0.51
553 0.57
554 0.59
555 0.64
556 0.62
557 0.54
558 0.5
559 0.46
560 0.39
561 0.34
562 0.33
563 0.26
564 0.25
565 0.24
566 0.2
567 0.14
568 0.1
569 0.08
570 0.07
571 0.05
572 0.05
573 0.06
574 0.06
575 0.09
576 0.1
577 0.1
578 0.11
579 0.17
580 0.2
581 0.2
582 0.21
583 0.19
584 0.23
585 0.24
586 0.24
587 0.18
588 0.16
589 0.19
590 0.18
591 0.18
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.1
596 0.12
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.09
602 0.09
603 0.11
604 0.09
605 0.13
606 0.18
607 0.2
608 0.26
609 0.3
610 0.38
611 0.4
612 0.43
613 0.41
614 0.41
615 0.45
616 0.44
617 0.42
618 0.37
619 0.36
620 0.36
621 0.35
622 0.33
623 0.3
624 0.3
625 0.34
626 0.37
627 0.37
628 0.4
629 0.43
630 0.44
631 0.4
632 0.35
633 0.32
634 0.27
635 0.26
636 0.22
637 0.16
638 0.13
639 0.16
640 0.16
641 0.16
642 0.15
643 0.16
644 0.16
645 0.18
646 0.21
647 0.2
648 0.22
649 0.25
650 0.27
651 0.27
652 0.32
653 0.34
654 0.32
655 0.35
656 0.39
657 0.44
658 0.51
659 0.56
660 0.56
661 0.57
662 0.57
663 0.56
664 0.54
665 0.51
666 0.47
667 0.41
668 0.36
669 0.35
670 0.34
671 0.31
672 0.29
673 0.25
674 0.2
675 0.21
676 0.22
677 0.2
678 0.22
679 0.25
680 0.26
681 0.27
682 0.27
683 0.26
684 0.31
685 0.31
686 0.3
687 0.32
688 0.36
689 0.35
690 0.39
691 0.4
692 0.42
693 0.49
694 0.55
695 0.53
696 0.53
697 0.54
698 0.53
699 0.53
700 0.52
701 0.5
702 0.46
703 0.43
704 0.41
705 0.43
706 0.48
707 0.52
708 0.51
709 0.47
710 0.47
711 0.47
712 0.45
713 0.44
714 0.39
715 0.41
716 0.44
717 0.47
718 0.46
719 0.51
720 0.51
721 0.5
722 0.49
723 0.4
724 0.31
725 0.27
726 0.28
727 0.23
728 0.25
729 0.23
730 0.23
731 0.24
732 0.27
733 0.28
734 0.27
735 0.29
736 0.29
737 0.34
738 0.43
739 0.52
740 0.58
741 0.64
742 0.72
743 0.76
744 0.81
745 0.82
746 0.8
747 0.79
748 0.77
749 0.71
750 0.65
751 0.57
752 0.5
753 0.44
754 0.38
755 0.29
756 0.24
757 0.23
758 0.21
759 0.22
760 0.21
761 0.26
762 0.29
763 0.34
764 0.39
765 0.38
766 0.39
767 0.43
768 0.47
769 0.48
770 0.54
771 0.55
772 0.56
773 0.61
774 0.6
775 0.58
776 0.53
777 0.46
778 0.39
779 0.31
780 0.25
781 0.19
782 0.19
783 0.15
784 0.16
785 0.19
786 0.25
787 0.25
788 0.25
789 0.32
790 0.41
791 0.51
792 0.59
793 0.65
794 0.68
795 0.69
796 0.73
797 0.66
798 0.63
799 0.54
800 0.45
801 0.36
802 0.26
803 0.25
804 0.2
805 0.18
806 0.11
807 0.1
808 0.1
809 0.1
810 0.12
811 0.12
812 0.13
813 0.14
814 0.16
815 0.25
816 0.27
817 0.27
818 0.27
819 0.26
820 0.26
821 0.29
822 0.34
823 0.28
824 0.33
825 0.36
826 0.36
827 0.37
828 0.36
829 0.33
830 0.27
831 0.28
832 0.23
833 0.24
834 0.24
835 0.26
836 0.27
837 0.29
838 0.36
839 0.41
840 0.42
841 0.47
842 0.54
843 0.58
844 0.65
845 0.72
846 0.73
847 0.76
848 0.82
849 0.81
850 0.82
851 0.84
852 0.85
853 0.79
854 0.78
855 0.77
856 0.79
857 0.78
858 0.75
859 0.72
860 0.69
861 0.74
862 0.69
863 0.61
864 0.56
865 0.54
866 0.49
867 0.42
868 0.36
869 0.31
870 0.27
871 0.26
872 0.19
873 0.14
874 0.11
875 0.1
876 0.09
877 0.06
878 0.05
879 0.07
880 0.07
881 0.07
882 0.06
883 0.06
884 0.06
885 0.08
886 0.08
887 0.06
888 0.06
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.07
893 0.04
894 0.05
895 0.05