FuNGI

C1HDX2

Protein Details

Accession

C1HDX2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
276-295	STESRVRQRHPKRKAPEPSI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014751 XRCC4-like_C
KEGG	pbl:PAAG_08965 -

Amino Acid Sequences

MPNQNLLRIKRSDSPGDYILVHVTRPGIEDLDLKLVATEGEAPYRASGLYTIYPSPRELQYSPANAITAVKSVRVNKLRAKNYHGDDDEWTGILAYVLGQRQSTSVPEEYKAGLKVVAAVKQDEDDESRNEIVITLMKRIDTITQRLGTITLKRDDDQAIQLFDWTGIAISRADELENQLLSLTAKYTAAESTISKLNAQLQELIKEKAEHDDQLIAKFAQLLNEKKLKIRNQQRLLAMVKVDGGKGAVHILLKLFCKFWICSINIHPANLRYAPSTESRVRQRHPKRKAPEPSISSESVDGFDTMDVDQVENPATNKSTTTTTTTTTTNNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNDTSAANPDAEDDLSSTSERQDTPDPLEDEDEETATEDEMDASQSPPAPAAPAATAARDDRKRGACASSKQPVASSPTTRTAREPMASPPPRRELPFTRRMGRGKAPMPSRDEDEDEDDEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.48
3	0.47
4	0.43
5	0.36
6	0.34
7	0.27
8	0.22
9	0.18
10	0.17
11	0.15
12	0.17
13	0.17
14	0.13
15	0.14
16	0.17
17	0.18
18	0.21
19	0.2
20	0.18
21	0.16
22	0.15
23	0.13
24	0.12
25	0.13
26	0.09
27	0.12
28	0.13
29	0.14
30	0.14
31	0.15
32	0.14
33	0.11
34	0.1
35	0.11
36	0.13
37	0.15
38	0.18
39	0.2
40	0.22
41	0.23
42	0.26
43	0.26
44	0.28
45	0.26
46	0.3
47	0.34
48	0.37
49	0.37
50	0.35
51	0.33
52	0.27
53	0.28
54	0.23
55	0.19
56	0.16
57	0.16
58	0.19
59	0.23
60	0.32
61	0.36
62	0.41
63	0.46
64	0.55
65	0.61
66	0.62
67	0.66
68	0.65
69	0.64
70	0.67
71	0.6
72	0.53
73	0.47
74	0.46
75	0.39
76	0.3
77	0.25
78	0.16
79	0.14
80	0.12
81	0.09
82	0.06
83	0.08
84	0.09
85	0.1
86	0.1
87	0.1
88	0.11
89	0.13
90	0.13
91	0.15
92	0.17
93	0.18
94	0.19
95	0.21
96	0.21
97	0.23
98	0.22
99	0.18
100	0.15
101	0.13
102	0.17
103	0.18
104	0.21
105	0.19
106	0.19
107	0.19
108	0.19
109	0.2
110	0.16
111	0.16
112	0.14
113	0.15
114	0.18
115	0.17
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.13
120	0.15
121	0.14
122	0.13
123	0.14
124	0.13
125	0.14
126	0.14
127	0.19
128	0.19
129	0.22
130	0.25
131	0.25
132	0.25
133	0.25
134	0.26
135	0.23
136	0.24
137	0.24
138	0.23
139	0.24
140	0.24
141	0.26
142	0.27
143	0.26
144	0.26
145	0.24
146	0.21
147	0.19
148	0.19
149	0.17
150	0.14
151	0.12
152	0.08
153	0.05
154	0.04
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.07
162	0.09
163	0.1
164	0.1
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.08
170	0.07
171	0.05
172	0.06
173	0.06
174	0.07
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.1
180	0.13
181	0.13
182	0.12
183	0.13
184	0.18
185	0.18
186	0.18
187	0.2
188	0.18
189	0.22
190	0.23
191	0.23
192	0.19
193	0.18
194	0.18
195	0.17
196	0.18
197	0.14
198	0.13
199	0.17
200	0.17
201	0.17
202	0.18
203	0.14
204	0.12
205	0.13
206	0.12
207	0.12
208	0.16
209	0.17
210	0.2
211	0.25
212	0.26
213	0.28
214	0.34
215	0.36
216	0.41
217	0.49
218	0.55
219	0.56
220	0.61
221	0.59
222	0.57
223	0.52
224	0.44
225	0.34
226	0.24
227	0.19
228	0.14
229	0.13
230	0.08
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.11
245	0.11
246	0.13
247	0.17
248	0.17
249	0.19
250	0.21
251	0.3
252	0.28
253	0.29
254	0.27
255	0.23
256	0.24
257	0.23
258	0.21
259	0.12
260	0.12
261	0.14
262	0.15
263	0.2
264	0.2
265	0.25
266	0.33
267	0.37
268	0.4
269	0.48
270	0.57
271	0.62
272	0.69
273	0.73
274	0.71
275	0.75
276	0.82
277	0.78
278	0.76
279	0.7
280	0.66
281	0.61
282	0.56
283	0.46
284	0.37
285	0.3
286	0.22
287	0.18
288	0.13
289	0.09
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.08
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.1
305	0.11
306	0.13
307	0.14
308	0.19
309	0.19
310	0.2
311	0.22
312	0.23
313	0.23
314	0.23
315	0.26
316	0.26
317	0.3
318	0.32
319	0.37
320	0.41
321	0.47
322	0.51
323	0.51
324	0.52
325	0.52
326	0.54
327	0.52
328	0.52
329	0.5
330	0.49
331	0.5
332	0.49
333	0.49
334	0.49
335	0.49
336	0.49
337	0.49
338	0.49
339	0.49
340	0.49
341	0.49
342	0.48
343	0.47
344	0.45
345	0.42
346	0.41
347	0.37
348	0.33
349	0.29
350	0.25
351	0.22
352	0.21
353	0.2
354	0.15
355	0.13
356	0.13
357	0.13
358	0.12
359	0.11
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.13
367	0.13
368	0.15
369	0.19
370	0.21
371	0.26
372	0.32
373	0.32
374	0.31
375	0.32
376	0.29
377	0.27
378	0.25
379	0.2
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.1
384	0.09
385	0.07
386	0.07
387	0.06
388	0.08
389	0.07
390	0.08
391	0.09
392	0.1
393	0.11
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.1
398	0.11
399	0.11
400	0.13
401	0.14
402	0.14
403	0.16
404	0.18
405	0.26
406	0.28
407	0.31
408	0.34
409	0.39
410	0.41
411	0.42
412	0.46
413	0.46
414	0.49
415	0.55
416	0.55
417	0.53
418	0.51
419	0.49
420	0.45
421	0.44
422	0.43
423	0.39
424	0.36
425	0.42
426	0.45
427	0.46
428	0.46
429	0.45
430	0.44
431	0.42
432	0.39
433	0.37
434	0.45
435	0.51
436	0.52
437	0.53
438	0.55
439	0.57
440	0.59
441	0.61
442	0.6
443	0.61
444	0.66
445	0.67
446	0.67
447	0.7
448	0.71
449	0.7
450	0.68
451	0.68
452	0.64
453	0.65
454	0.64
455	0.63
456	0.64
457	0.61
458	0.59
459	0.54
460	0.53
461	0.48
462	0.47

C1HDX2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer