Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JRG2

Protein Details
Accession W4JRG2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
231-253SSSPSGKPKVPNKPKAKKDSDLTHydrophilic
307-334RLAWEWYSKVRPRMRSKRQLARMPENRHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-247KPKVPNKPKAK
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 5.333, nucl 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR018079  Ribosomal_S4_CS  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
KEGG hir:HETIRDRAFT_482188  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00632  RIBOSOMAL_S4  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MRDINVYSFAKALPRMSWSRHNLYNLWRRSLGELAKETNFTRTQKTLFQQRWAAKSLVRAYHGDFINEKSFKRWYLPTTLPDVRSRRRVAGDDTLDLNKWAKQDKVVEKGTKVLQEDTENAQLAPVGSMMFAEVERRIDVFIFRACMAHSVYEARRMVVHGDVLLNGQKHQNANTRLAPGDMVSVNPDAIRFLQRQEPKKEDVELETVEPKIEIADESTSASEGEPSAASSSSPSGKPKVPNKPKAKKDSDLTPFNLPPFASPFIFIPAYIEPSFATCSAIYVRHPTARPGYSEVPTPYDADGEVVRLAWEWYSKVRPRMRSKRQLARMPENRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.34
4 0.42
5 0.46
6 0.5
7 0.54
8 0.56
9 0.54
10 0.59
11 0.63
12 0.59
13 0.57
14 0.52
15 0.48
16 0.47
17 0.5
18 0.43
19 0.4
20 0.39
21 0.37
22 0.37
23 0.39
24 0.36
25 0.35
26 0.36
27 0.32
28 0.34
29 0.34
30 0.35
31 0.4
32 0.46
33 0.5
34 0.49
35 0.54
36 0.57
37 0.58
38 0.59
39 0.56
40 0.51
41 0.42
42 0.45
43 0.45
44 0.41
45 0.38
46 0.35
47 0.35
48 0.4
49 0.39
50 0.34
51 0.28
52 0.28
53 0.33
54 0.33
55 0.3
56 0.26
57 0.29
58 0.28
59 0.32
60 0.33
61 0.28
62 0.34
63 0.39
64 0.39
65 0.44
66 0.47
67 0.45
68 0.48
69 0.51
70 0.49
71 0.53
72 0.52
73 0.49
74 0.48
75 0.49
76 0.46
77 0.48
78 0.45
79 0.39
80 0.39
81 0.35
82 0.31
83 0.29
84 0.24
85 0.17
86 0.16
87 0.17
88 0.15
89 0.18
90 0.26
91 0.32
92 0.38
93 0.43
94 0.43
95 0.41
96 0.45
97 0.43
98 0.38
99 0.33
100 0.27
101 0.23
102 0.22
103 0.24
104 0.23
105 0.23
106 0.2
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.13
111 0.1
112 0.07
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.11
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.17
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.13
146 0.13
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.14
158 0.2
159 0.21
160 0.25
161 0.27
162 0.27
163 0.25
164 0.25
165 0.22
166 0.15
167 0.14
168 0.1
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.1
178 0.09
179 0.11
180 0.18
181 0.25
182 0.32
183 0.37
184 0.41
185 0.41
186 0.43
187 0.43
188 0.37
189 0.33
190 0.29
191 0.24
192 0.21
193 0.19
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.11
198 0.08
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.16
222 0.18
223 0.23
224 0.31
225 0.39
226 0.49
227 0.56
228 0.65
229 0.73
230 0.8
231 0.85
232 0.87
233 0.85
234 0.81
235 0.75
236 0.75
237 0.71
238 0.67
239 0.61
240 0.57
241 0.51
242 0.45
243 0.42
244 0.32
245 0.25
246 0.24
247 0.24
248 0.18
249 0.18
250 0.17
251 0.2
252 0.2
253 0.18
254 0.16
255 0.14
256 0.19
257 0.18
258 0.18
259 0.14
260 0.16
261 0.18
262 0.15
263 0.16
264 0.1
265 0.12
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.2
270 0.23
271 0.28
272 0.29
273 0.32
274 0.37
275 0.38
276 0.39
277 0.4
278 0.41
279 0.36
280 0.41
281 0.39
282 0.35
283 0.34
284 0.32
285 0.26
286 0.22
287 0.21
288 0.17
289 0.15
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.16
300 0.25
301 0.32
302 0.41
303 0.48
304 0.57
305 0.66
306 0.76
307 0.82
308 0.84
309 0.87
310 0.89
311 0.91
312 0.9
313 0.89
314 0.89