Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JNC0

Protein Details
Accession W4JNC0    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
516-538EALKKKDRDKRDRMASRRRVRGGBasic
787-807MKTYAKPTSKHPSKNKATGSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
390-393ERRR
493-537KKARPSEKPSDKPVPRPASEEISEALKKKDRDKRDRMASRRRVRG
Subcellular Location(s) nucl 14, cysk 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG hir:HETIRDRAFT_127022  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MSSDILNHDLLPFHLSILEHFHDPLTSDLLLLARGLGLRKILCTLMQIYDSPQNLVLLVNASPEEEAAIGEELGIMGCRNPGLRMVGYEMPKKDRQDLYKKGGLISVTSRILVVDMLQSDIPTDLITGLLMLHAERVNALSLEAFIVRLYREKNKKGFLKAFSDQPEHITSGLSPLKNIMKELQLRTVHIYPRFHTSVKDSLEKNRADVIELYQPMTKLMNDIHSGIVQCMSTTLSELKRSNTTLDLDDLNVENAYFRSFDAIVRRQLDPVWHKVGPRTKQLVNDLATLRRLLTYLLTYDALAFHAYLESIIASNSISASGAARQNHSPWLLTDAAHIIFQSAKRRCYTLAAPTVSRPPVIDLVDDEDAWDALDEIQGQSGNKDKGKAVERRRPKWLPGGMDMVLEELPKWSLLAEVLKEIEEEIMRQESAGMSSKGTNTVLVMTSSTQTSTALNEFLSSMDPEAAPGAQGRQMMEAKLRGYLWWKAKLNDDKKARPSEKPSDKPVPRPASEEISEALKKKDRDKRDRMASRRRVRGGASGTVSAGQNDRDISSIQSQFDEFYGLLPPQQTVLVRGYSDDSDDRMLAEIQPRFIVIFEPNQDFIRRIEVYRSSNPGLGIRVYFMLYQTSCEEHKYLAGLRREKDAFERLIKERGTMLMPIIEDHRAGTEAGEAMIKTISTRVAGGRKEVSTEPSKVVVDMREFRSTLPSLLHASKLLVIPATLIVGDYILTPDICVERKSIPDLVSSFNSGRLYTQCELMSVHYKQPILLIEFEEYKSFSLEIIQDMKTYAKPTSKHPSKNKATGSEPSAPPSIQSKLVLLTLTFPRVRIIWSSSPYATADIFNDLKANLPEPDVRHAIGIGAERDTNEGAAGDGERDDAAAEELLRSLPGITDKNLAYVKRRVGSVRGLCDMTLEEVKQVLGDDPGKRCWEFLHWGERQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.19
5 0.21
6 0.19
7 0.2
8 0.2
9 0.18
10 0.19
11 0.2
12 0.17
13 0.14
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.12
19 0.1
20 0.07
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.17
28 0.17
29 0.16
30 0.18
31 0.2
32 0.2
33 0.21
34 0.2
35 0.22
36 0.28
37 0.28
38 0.26
39 0.24
40 0.21
41 0.2
42 0.19
43 0.16
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.04
64 0.05
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.11
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.22
73 0.27
74 0.31
75 0.37
76 0.38
77 0.4
78 0.45
79 0.46
80 0.49
81 0.51
82 0.55
83 0.6
84 0.65
85 0.66
86 0.66
87 0.64
88 0.57
89 0.52
90 0.43
91 0.36
92 0.3
93 0.28
94 0.23
95 0.22
96 0.21
97 0.18
98 0.18
99 0.15
100 0.12
101 0.1
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.07
110 0.07
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.12
136 0.16
137 0.24
138 0.34
139 0.42
140 0.49
141 0.57
142 0.64
143 0.69
144 0.72
145 0.68
146 0.67
147 0.63
148 0.63
149 0.59
150 0.56
151 0.47
152 0.43
153 0.4
154 0.33
155 0.3
156 0.23
157 0.18
158 0.21
159 0.25
160 0.21
161 0.19
162 0.22
163 0.26
164 0.26
165 0.28
166 0.23
167 0.25
168 0.32
169 0.34
170 0.39
171 0.36
172 0.37
173 0.41
174 0.43
175 0.42
176 0.41
177 0.42
178 0.34
179 0.41
180 0.42
181 0.37
182 0.35
183 0.34
184 0.36
185 0.37
186 0.42
187 0.36
188 0.41
189 0.48
190 0.46
191 0.43
192 0.4
193 0.36
194 0.32
195 0.31
196 0.27
197 0.26
198 0.26
199 0.26
200 0.22
201 0.22
202 0.21
203 0.21
204 0.17
205 0.12
206 0.13
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.15
215 0.11
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.12
222 0.13
223 0.19
224 0.21
225 0.24
226 0.26
227 0.28
228 0.28
229 0.26
230 0.27
231 0.22
232 0.23
233 0.21
234 0.17
235 0.18
236 0.16
237 0.14
238 0.11
239 0.1
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.09
246 0.09
247 0.12
248 0.19
249 0.23
250 0.28
251 0.3
252 0.31
253 0.29
254 0.3
255 0.35
256 0.32
257 0.33
258 0.34
259 0.32
260 0.33
261 0.38
262 0.46
263 0.43
264 0.47
265 0.46
266 0.43
267 0.47
268 0.51
269 0.5
270 0.44
271 0.44
272 0.37
273 0.33
274 0.31
275 0.27
276 0.22
277 0.16
278 0.15
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.08
308 0.12
309 0.13
310 0.15
311 0.16
312 0.18
313 0.21
314 0.21
315 0.18
316 0.15
317 0.18
318 0.16
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.2
329 0.21
330 0.24
331 0.25
332 0.27
333 0.27
334 0.3
335 0.31
336 0.3
337 0.34
338 0.33
339 0.33
340 0.33
341 0.37
342 0.33
343 0.3
344 0.22
345 0.16
346 0.17
347 0.17
348 0.16
349 0.12
350 0.15
351 0.15
352 0.15
353 0.13
354 0.1
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.04
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.11
368 0.14
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.22
373 0.29
374 0.37
375 0.41
376 0.47
377 0.56
378 0.59
379 0.67
380 0.64
381 0.61
382 0.61
383 0.56
384 0.51
385 0.44
386 0.43
387 0.35
388 0.32
389 0.28
390 0.2
391 0.15
392 0.12
393 0.09
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.07
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.1
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.09
460 0.1
461 0.1
462 0.12
463 0.13
464 0.11
465 0.12
466 0.12
467 0.1
468 0.12
469 0.18
470 0.21
471 0.26
472 0.28
473 0.28
474 0.35
475 0.44
476 0.45
477 0.48
478 0.5
479 0.48
480 0.52
481 0.6
482 0.56
483 0.51
484 0.55
485 0.57
486 0.6
487 0.59
488 0.61
489 0.62
490 0.62
491 0.64
492 0.66
493 0.61
494 0.52
495 0.52
496 0.47
497 0.41
498 0.39
499 0.34
500 0.25
501 0.22
502 0.23
503 0.2
504 0.2
505 0.2
506 0.21
507 0.28
508 0.36
509 0.43
510 0.52
511 0.59
512 0.66
513 0.72
514 0.79
515 0.8
516 0.82
517 0.83
518 0.81
519 0.81
520 0.74
521 0.65
522 0.58
523 0.55
524 0.48
525 0.41
526 0.34
527 0.26
528 0.24
529 0.23
530 0.21
531 0.16
532 0.13
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.1
540 0.14
541 0.16
542 0.15
543 0.16
544 0.15
545 0.15
546 0.15
547 0.14
548 0.09
549 0.07
550 0.08
551 0.07
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.09
557 0.08
558 0.09
559 0.11
560 0.11
561 0.1
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.13
566 0.11
567 0.1
568 0.11
569 0.11
570 0.1
571 0.09
572 0.1
573 0.09
574 0.14
575 0.14
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.12
580 0.12
581 0.12
582 0.09
583 0.11
584 0.14
585 0.16
586 0.17
587 0.18
588 0.18
589 0.18
590 0.17
591 0.19
592 0.18
593 0.16
594 0.19
595 0.24
596 0.28
597 0.31
598 0.36
599 0.31
600 0.32
601 0.32
602 0.29
603 0.24
604 0.2
605 0.16
606 0.12
607 0.11
608 0.11
609 0.1
610 0.09
611 0.11
612 0.1
613 0.11
614 0.12
615 0.13
616 0.13
617 0.15
618 0.15
619 0.12
620 0.13
621 0.13
622 0.16
623 0.2
624 0.27
625 0.31
626 0.31
627 0.37
628 0.37
629 0.36
630 0.36
631 0.35
632 0.32
633 0.31
634 0.35
635 0.32
636 0.37
637 0.36
638 0.33
639 0.28
640 0.26
641 0.23
642 0.18
643 0.16
644 0.12
645 0.12
646 0.12
647 0.12
648 0.11
649 0.1
650 0.1
651 0.1
652 0.09
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.07
657 0.07
658 0.08
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.06
663 0.05
664 0.06
665 0.07
666 0.06
667 0.08
668 0.11
669 0.17
670 0.18
671 0.21
672 0.24
673 0.23
674 0.26
675 0.26
676 0.27
677 0.26
678 0.28
679 0.26
680 0.25
681 0.25
682 0.23
683 0.24
684 0.21
685 0.22
686 0.26
687 0.28
688 0.28
689 0.28
690 0.28
691 0.31
692 0.29
693 0.25
694 0.21
695 0.19
696 0.2
697 0.21
698 0.22
699 0.17
700 0.17
701 0.18
702 0.17
703 0.16
704 0.11
705 0.1
706 0.09
707 0.09
708 0.09
709 0.06
710 0.05
711 0.05
712 0.04
713 0.05
714 0.04
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.06
720 0.08
721 0.1
722 0.1
723 0.12
724 0.14
725 0.16
726 0.2
727 0.23
728 0.21
729 0.24
730 0.25
731 0.26
732 0.26
733 0.27
734 0.24
735 0.24
736 0.24
737 0.2
738 0.21
739 0.19
740 0.23
741 0.21
742 0.24
743 0.2
744 0.2
745 0.21
746 0.22
747 0.28
748 0.23
749 0.27
750 0.27
751 0.27
752 0.26
753 0.28
754 0.27
755 0.23
756 0.22
757 0.2
758 0.18
759 0.2
760 0.21
761 0.19
762 0.17
763 0.15
764 0.14
765 0.13
766 0.1
767 0.11
768 0.11
769 0.14
770 0.17
771 0.16
772 0.16
773 0.17
774 0.19
775 0.18
776 0.19
777 0.2
778 0.22
779 0.23
780 0.31
781 0.41
782 0.49
783 0.57
784 0.65
785 0.72
786 0.75
787 0.82
788 0.81
789 0.76
790 0.71
791 0.67
792 0.64
793 0.62
794 0.54
795 0.49
796 0.44
797 0.38
798 0.35
799 0.33
800 0.29
801 0.23
802 0.23
803 0.21
804 0.2
805 0.21
806 0.2
807 0.16
808 0.18
809 0.18
810 0.23
811 0.22
812 0.21
813 0.21
814 0.21
815 0.23
816 0.22
817 0.26
818 0.27
819 0.3
820 0.34
821 0.33
822 0.34
823 0.33
824 0.31
825 0.25
826 0.2
827 0.18
828 0.18
829 0.19
830 0.17
831 0.17
832 0.15
833 0.18
834 0.18
835 0.19
836 0.15
837 0.17
838 0.21
839 0.23
840 0.29
841 0.27
842 0.27
843 0.25
844 0.24
845 0.22
846 0.2
847 0.21
848 0.16
849 0.15
850 0.15
851 0.15
852 0.17
853 0.17
854 0.15
855 0.11
856 0.1
857 0.09
858 0.09
859 0.09
860 0.08
861 0.08
862 0.08
863 0.08
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.08
868 0.08
869 0.08
870 0.08
871 0.08
872 0.09
873 0.08
874 0.08
875 0.07
876 0.08
877 0.13
878 0.15
879 0.16
880 0.21
881 0.22
882 0.27
883 0.31
884 0.31
885 0.33
886 0.37
887 0.42
888 0.41
889 0.44
890 0.42
891 0.43
892 0.51
893 0.52
894 0.51
895 0.48
896 0.45
897 0.41
898 0.39
899 0.36
900 0.3
901 0.26
902 0.2
903 0.17
904 0.17
905 0.17
906 0.16
907 0.16
908 0.12
909 0.14
910 0.18
911 0.23
912 0.26
913 0.32
914 0.36
915 0.35
916 0.35
917 0.32
918 0.34
919 0.36
920 0.39
921 0.44