Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JU21

Protein Details
Accession W4JU21    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-248PSSSSTSYRRSRPPRKQYKCDFCGATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 7.5, cyto_mito 5.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG hir:HETIRDRAFT_454463  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSDPSFALPSVSPLNNRNYPSWSKEIKAWLRLKGLWILVSGDETAPVGTKEKPADPREVAEWKRNAQKAAGALLLSVEDQFRGVLDGIEDDPIAIWTKLEEQFNKKSAGSCFNAMEDLFSIKKRNNESLQSLIHHVNESMRVLKNLRDSGFDLKKQDEELTCMALLWSLLSEFDTFCSSLSLMDVLSHSKLKDVFRREDLNRARRSDPTDSAQALVASFASSPSSSSTSYRRSRPPRKQYKCDFCGATGHTDDRCFKRINEELKKSKPQQAHPVQAPEASGPMQFAGNASFRSPALSPSSTAPSLVTDLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.43
4 0.42
5 0.43
6 0.46
7 0.48
8 0.52
9 0.48
10 0.45
11 0.47
12 0.54
13 0.54
14 0.58
15 0.57
16 0.55
17 0.55
18 0.54
19 0.52
20 0.47
21 0.41
22 0.33
23 0.28
24 0.24
25 0.19
26 0.19
27 0.17
28 0.12
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.1
36 0.14
37 0.17
38 0.23
39 0.31
40 0.34
41 0.4
42 0.4
43 0.42
44 0.43
45 0.49
46 0.46
47 0.46
48 0.47
49 0.45
50 0.51
51 0.52
52 0.47
53 0.4
54 0.4
55 0.34
56 0.32
57 0.28
58 0.19
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.1
63 0.09
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.11
85 0.14
86 0.18
87 0.21
88 0.25
89 0.31
90 0.34
91 0.36
92 0.32
93 0.32
94 0.31
95 0.34
96 0.3
97 0.28
98 0.25
99 0.23
100 0.24
101 0.2
102 0.17
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.12
108 0.13
109 0.18
110 0.21
111 0.27
112 0.29
113 0.33
114 0.35
115 0.38
116 0.38
117 0.34
118 0.33
119 0.28
120 0.24
121 0.2
122 0.17
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.16
131 0.19
132 0.21
133 0.21
134 0.2
135 0.22
136 0.28
137 0.31
138 0.3
139 0.28
140 0.25
141 0.25
142 0.24
143 0.24
144 0.16
145 0.15
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.09
175 0.08
176 0.1
177 0.13
178 0.16
179 0.23
180 0.28
181 0.31
182 0.34
183 0.42
184 0.41
185 0.48
186 0.53
187 0.55
188 0.55
189 0.55
190 0.52
191 0.49
192 0.54
193 0.49
194 0.44
195 0.4
196 0.39
197 0.35
198 0.34
199 0.3
200 0.25
201 0.19
202 0.15
203 0.11
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.08
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.2
215 0.27
216 0.33
217 0.39
218 0.47
219 0.55
220 0.65
221 0.74
222 0.8
223 0.83
224 0.87
225 0.91
226 0.92
227 0.92
228 0.85
229 0.81
230 0.72
231 0.61
232 0.58
233 0.49
234 0.43
235 0.34
236 0.32
237 0.27
238 0.28
239 0.33
240 0.31
241 0.33
242 0.31
243 0.29
244 0.36
245 0.42
246 0.49
247 0.54
248 0.6
249 0.64
250 0.7
251 0.79
252 0.76
253 0.76
254 0.73
255 0.7
256 0.72
257 0.72
258 0.73
259 0.7
260 0.7
261 0.64
262 0.57
263 0.5
264 0.4
265 0.32
266 0.24
267 0.18
268 0.13
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.18
280 0.18
281 0.18
282 0.22
283 0.22
284 0.23
285 0.26
286 0.32
287 0.29
288 0.29
289 0.26
290 0.22