Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2V083

Protein Details
Accession A0A0A2V083    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-55VEAAEVKQKKPKKVNKEKEKNEKKKENKQKQKDEVQADAHydrophilic
83-134TKETEEKAKKAKKERKKKEKKAKKGDDGSNDVKDKKKKRKEKKIGLKDSEKGBasic
157-191ETEEKRSKKDKVGKEKKQKNDKKAKKEKDEKVTMSBasic
341-372SEQRARAAKEAQKQKQKQKQKQKTEAAKTADVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-46KQKKPKKVNKEKEKNEKKKENKQK
89-128KAKKAKKERKKKEKKAKKGDDGSNDVKDKKKKRKEKKIGL
161-184KRSKKDKVGKEKKQKNDKKAKKEK
332-332R
336-362KNTKLSEQRARAAKEAQKQKQKQKQKQ
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 9.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbl:PAAG_12120  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGDKRKRSQFAAEDEVVEAAEVKQKKPKKVNKEKEKNEKKKENKQKQKDEVQADAGAVANALGMDTEMKDVDEIPAVTNGTVTKETEEKAKKAKKERKKKEKKAKKGDDGSNDVKDKKKKRKEKKIGLKDSEKGVVEVANEKEEIQEQVPEVLENRETEEKRSKKDKVGKEKKQKNDKKAKKEKDEKVTMSASQQENGHGEVTNNSIGSGTPTAGEHDIGKSLDFPNGNDGEKKNQRFIVFIGNLPFHTTLDAVQKHFSRIGPSHVRFPSEKGGKKGRGFAFIEFDHYDRMKTCLKLYHHSSFDDGQNPPRKINVELTAGGGGSKSETRKARIFEKNTKLSEQRARAAKEAQKQKQKQKQKQKTEAAKTADVTETAPVKSDLDDVHPSRRGRVPGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.42
3 0.32
4 0.24
5 0.17
6 0.09
7 0.15
8 0.15
9 0.17
10 0.26
11 0.33
12 0.43
13 0.53
14 0.62
15 0.67
16 0.77
17 0.86
18 0.89
19 0.93
20 0.94
21 0.95
22 0.96
23 0.96
24 0.95
25 0.95
26 0.93
27 0.93
28 0.94
29 0.94
30 0.94
31 0.94
32 0.94
33 0.93
34 0.93
35 0.91
36 0.85
37 0.78
38 0.7
39 0.6
40 0.49
41 0.4
42 0.3
43 0.21
44 0.14
45 0.1
46 0.06
47 0.04
48 0.04
49 0.03
50 0.03
51 0.04
52 0.04
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.15
72 0.16
73 0.24
74 0.29
75 0.3
76 0.39
77 0.45
78 0.51
79 0.6
80 0.69
81 0.71
82 0.78
83 0.85
84 0.86
85 0.91
86 0.94
87 0.95
88 0.96
89 0.96
90 0.96
91 0.96
92 0.94
93 0.92
94 0.89
95 0.85
96 0.81
97 0.75
98 0.69
99 0.62
100 0.55
101 0.52
102 0.53
103 0.55
104 0.59
105 0.64
106 0.69
107 0.77
108 0.86
109 0.91
110 0.93
111 0.95
112 0.95
113 0.95
114 0.92
115 0.87
116 0.79
117 0.71
118 0.63
119 0.52
120 0.41
121 0.31
122 0.24
123 0.18
124 0.19
125 0.16
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.09
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.12
143 0.17
144 0.17
145 0.22
146 0.31
147 0.33
148 0.38
149 0.46
150 0.47
151 0.49
152 0.58
153 0.63
154 0.65
155 0.73
156 0.77
157 0.8
158 0.85
159 0.86
160 0.88
161 0.87
162 0.86
163 0.86
164 0.85
165 0.86
166 0.88
167 0.87
168 0.87
169 0.89
170 0.86
171 0.84
172 0.82
173 0.73
174 0.66
175 0.58
176 0.48
177 0.39
178 0.37
179 0.28
180 0.22
181 0.21
182 0.17
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.14
214 0.16
215 0.16
216 0.18
217 0.18
218 0.24
219 0.31
220 0.33
221 0.32
222 0.34
223 0.33
224 0.32
225 0.32
226 0.32
227 0.26
228 0.26
229 0.25
230 0.22
231 0.21
232 0.23
233 0.22
234 0.12
235 0.12
236 0.1
237 0.1
238 0.17
239 0.19
240 0.18
241 0.21
242 0.21
243 0.23
244 0.25
245 0.23
246 0.21
247 0.21
248 0.28
249 0.34
250 0.35
251 0.41
252 0.4
253 0.43
254 0.39
255 0.41
256 0.42
257 0.41
258 0.44
259 0.42
260 0.5
261 0.54
262 0.55
263 0.6
264 0.53
265 0.52
266 0.49
267 0.45
268 0.41
269 0.34
270 0.36
271 0.29
272 0.27
273 0.24
274 0.22
275 0.21
276 0.17
277 0.21
278 0.21
279 0.21
280 0.23
281 0.27
282 0.31
283 0.37
284 0.44
285 0.47
286 0.45
287 0.45
288 0.45
289 0.41
290 0.4
291 0.38
292 0.33
293 0.34
294 0.41
295 0.41
296 0.38
297 0.39
298 0.37
299 0.35
300 0.39
301 0.36
302 0.31
303 0.3
304 0.31
305 0.28
306 0.26
307 0.23
308 0.16
309 0.11
310 0.09
311 0.12
312 0.12
313 0.18
314 0.22
315 0.28
316 0.33
317 0.38
318 0.46
319 0.52
320 0.59
321 0.63
322 0.68
323 0.72
324 0.7
325 0.71
326 0.65
327 0.63
328 0.64
329 0.6
330 0.57
331 0.57
332 0.57
333 0.54
334 0.59
335 0.58
336 0.58
337 0.63
338 0.65
339 0.68
340 0.74
341 0.81
342 0.83
343 0.88
344 0.89
345 0.9
346 0.92
347 0.92
348 0.93
349 0.93
350 0.94
351 0.92
352 0.9
353 0.85
354 0.78
355 0.68
356 0.61
357 0.51
358 0.41
359 0.32
360 0.28
361 0.25
362 0.2
363 0.21
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.2
368 0.17
369 0.2
370 0.28
371 0.29
372 0.36
373 0.42
374 0.42
375 0.45
376 0.5