Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4K1N7

Protein Details
Accession W4K1N7    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-164DESTSTKKRGRGRPRKSKVDSEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-128KKSKENKGRTARKSDVKPSASVGR
148-161KKRGRGRPRKSKVD
168-186ERARVKKKAKTNGSAKARK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG hir:HETIRDRAFT_428870  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MARAQLASESEGESDEVKHSSKTNRNTATGEESNNEEEAREGNGEEDDEPEYEIEQILDAKNGVFPQGRMGYLVKWKGFKEEDNSWVDEEDARNAHDLIEAFWSKKSKENKGRTARKSDVKPSASVGRAGRKSIVDERVSDDESTSTKKRGRGRPRKSKVDSEDEEDERARVKKKAKTNGSAKARKASTPVDNNEKDPIVPSTIKKYRDLTSWEDLVAKIETVEKSGDDLIVFFKLKKNAEPCKEVSSICNEKFPQKMIQFYESNLRWKHSELSDENAGSDQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.15
6 0.19
7 0.28
8 0.36
9 0.43
10 0.51
11 0.54
12 0.57
13 0.58
14 0.57
15 0.57
16 0.51
17 0.45
18 0.37
19 0.35
20 0.33
21 0.31
22 0.27
23 0.18
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.07
42 0.06
43 0.08
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.16
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.25
60 0.3
61 0.27
62 0.28
63 0.28
64 0.32
65 0.33
66 0.33
67 0.33
68 0.33
69 0.36
70 0.36
71 0.37
72 0.32
73 0.3
74 0.27
75 0.22
76 0.18
77 0.15
78 0.12
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.15
90 0.17
91 0.16
92 0.23
93 0.29
94 0.35
95 0.44
96 0.53
97 0.61
98 0.7
99 0.79
100 0.78
101 0.8
102 0.76
103 0.73
104 0.69
105 0.66
106 0.64
107 0.56
108 0.51
109 0.45
110 0.44
111 0.37
112 0.36
113 0.3
114 0.29
115 0.28
116 0.28
117 0.27
118 0.22
119 0.24
120 0.25
121 0.28
122 0.22
123 0.22
124 0.24
125 0.25
126 0.26
127 0.23
128 0.18
129 0.13
130 0.13
131 0.17
132 0.14
133 0.16
134 0.18
135 0.24
136 0.32
137 0.41
138 0.52
139 0.59
140 0.69
141 0.76
142 0.82
143 0.87
144 0.83
145 0.82
146 0.76
147 0.74
148 0.65
149 0.59
150 0.55
151 0.46
152 0.43
153 0.34
154 0.28
155 0.22
156 0.23
157 0.2
158 0.2
159 0.26
160 0.31
161 0.4
162 0.5
163 0.55
164 0.61
165 0.66
166 0.71
167 0.74
168 0.74
169 0.68
170 0.65
171 0.59
172 0.51
173 0.47
174 0.42
175 0.4
176 0.4
177 0.43
178 0.45
179 0.45
180 0.45
181 0.44
182 0.4
183 0.32
184 0.26
185 0.23
186 0.18
187 0.19
188 0.19
189 0.26
190 0.31
191 0.34
192 0.36
193 0.38
194 0.37
195 0.4
196 0.43
197 0.4
198 0.39
199 0.37
200 0.34
201 0.32
202 0.29
203 0.26
204 0.21
205 0.15
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.12
219 0.13
220 0.12
221 0.16
222 0.21
223 0.23
224 0.3
225 0.37
226 0.44
227 0.5
228 0.55
229 0.54
230 0.54
231 0.55
232 0.49
233 0.43
234 0.42
235 0.44
236 0.4
237 0.43
238 0.39
239 0.41
240 0.44
241 0.44
242 0.44
243 0.4
244 0.45
245 0.43
246 0.48
247 0.44
248 0.43
249 0.49
250 0.43
251 0.47
252 0.43
253 0.41
254 0.37
255 0.39
256 0.43
257 0.37
258 0.43
259 0.37
260 0.42
261 0.45
262 0.43
263 0.41