Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HE89

Protein Details
Accession C1HE89    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-267GLTSGPEPKPKMKKEKRKGKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-267PKPKMKKEKRKGKA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 4, pero 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002778  Signal_recog_particle_SRP19  
IPR036521  SRP19-like_sf  
IPR022938  SRP19_arc-type  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG pbl:PAAG_09081  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01922  SRP19  
Amino Acid Sequences MSRHARAEEVSDSDPDDMDPADFSPTNFAAENSIITLANTPASYASRPTPRPQTQAQTQGRPPQSNDIQSTNRDVPRNYQCLYPVYFDKTRSRAEGRKVNKSLAVENPLARDIVDAVQVLGLQVGLEPDKLHPKDWANPGRVRVLLKMEDGTPLTNAVKNKHHLYIKVAQYLRAHPTTEESPFRLRIHGLSVPDKPIPPPVAPRGWKIGTILPFHSPALTGGGVSDNPFKEAMLEMQQQGLAGDMPGLTSGPEPKPKMKKEKRKGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.18
3 0.15
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.12
9 0.13
10 0.13
11 0.16
12 0.17
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.16
17 0.16
18 0.17
19 0.13
20 0.14
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.1
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.12
31 0.14
32 0.19
33 0.26
34 0.29
35 0.35
36 0.44
37 0.48
38 0.52
39 0.56
40 0.58
41 0.57
42 0.64
43 0.64
44 0.61
45 0.6
46 0.64
47 0.63
48 0.58
49 0.53
50 0.51
51 0.5
52 0.48
53 0.47
54 0.44
55 0.41
56 0.4
57 0.44
58 0.42
59 0.41
60 0.38
61 0.36
62 0.38
63 0.42
64 0.45
65 0.4
66 0.36
67 0.34
68 0.34
69 0.35
70 0.31
71 0.25
72 0.26
73 0.28
74 0.3
75 0.33
76 0.34
77 0.34
78 0.36
79 0.4
80 0.39
81 0.44
82 0.5
83 0.5
84 0.56
85 0.56
86 0.52
87 0.49
88 0.45
89 0.4
90 0.35
91 0.34
92 0.26
93 0.24
94 0.24
95 0.21
96 0.2
97 0.16
98 0.12
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.02
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.05
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.17
120 0.19
121 0.25
122 0.33
123 0.38
124 0.36
125 0.37
126 0.39
127 0.38
128 0.38
129 0.32
130 0.25
131 0.22
132 0.19
133 0.17
134 0.16
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.13
144 0.15
145 0.19
146 0.22
147 0.25
148 0.29
149 0.31
150 0.29
151 0.33
152 0.38
153 0.38
154 0.41
155 0.39
156 0.36
157 0.36
158 0.38
159 0.37
160 0.31
161 0.27
162 0.2
163 0.24
164 0.23
165 0.26
166 0.25
167 0.23
168 0.25
169 0.28
170 0.29
171 0.26
172 0.24
173 0.2
174 0.23
175 0.24
176 0.24
177 0.24
178 0.25
179 0.27
180 0.28
181 0.28
182 0.24
183 0.26
184 0.25
185 0.23
186 0.27
187 0.29
188 0.36
189 0.38
190 0.4
191 0.41
192 0.39
193 0.39
194 0.35
195 0.35
196 0.31
197 0.32
198 0.31
199 0.26
200 0.27
201 0.26
202 0.24
203 0.19
204 0.15
205 0.15
206 0.13
207 0.1
208 0.09
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.16
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.18
221 0.2
222 0.2
223 0.2
224 0.21
225 0.2
226 0.18
227 0.16
228 0.1
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.12
238 0.17
239 0.25
240 0.29
241 0.39
242 0.49
243 0.58
244 0.68
245 0.74
246 0.8
247 0.83