Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KM42

Protein Details
Accession W4KM42    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-57AVESSVPMKKKKNKQRVLMLSSRGHydrophilic
262-291VRSAIRREKGTKYKERKHAQSERSDRKDLRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-284RREKGTKYKERKHAQSER
Subcellular Location(s) mito 11.5, mito_nucl 11, nucl 9.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR026532  BRX1  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG hir:HETIRDRAFT_308509  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MASVLKAQKANASLIDSKGKGKRKADAMDVDEEAVESSVPMKKKKNKQRVLMLSSRGVTHRMRHLMNDLEVLLPHIKKDSKLDSKNHLNLLPELADLHNCNNTLYFEARRHEDLYLWAAKTPNGPSVKLHVQNVHTMDELKLTGNCLKGSRGLLSFDASFEETEWGRLMKELFTHMFGVPPQARRAKPFIDHILTFSLLDGKIWFRNFQIIEKDPLHPSGPPQTTLIEIGPRFVMTPIRIFEGAFNGATVFSNPEYISPTSVRSAIRREKGTKYKERKHAQSERSDRKDLRKLPENELAVSKVFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.35
3 0.32
4 0.36
5 0.42
6 0.48
7 0.51
8 0.52
9 0.56
10 0.58
11 0.62
12 0.63
13 0.63
14 0.58
15 0.55
16 0.51
17 0.44
18 0.35
19 0.3
20 0.23
21 0.15
22 0.1
23 0.06
24 0.07
25 0.11
26 0.15
27 0.2
28 0.29
29 0.39
30 0.5
31 0.62
32 0.7
33 0.75
34 0.81
35 0.87
36 0.88
37 0.86
38 0.83
39 0.76
40 0.69
41 0.6
42 0.53
43 0.43
44 0.36
45 0.31
46 0.28
47 0.32
48 0.34
49 0.34
50 0.34
51 0.38
52 0.38
53 0.37
54 0.33
55 0.26
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.18
60 0.13
61 0.13
62 0.15
63 0.16
64 0.17
65 0.23
66 0.3
67 0.37
68 0.44
69 0.49
70 0.53
71 0.61
72 0.64
73 0.62
74 0.54
75 0.46
76 0.4
77 0.37
78 0.29
79 0.2
80 0.16
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.14
92 0.16
93 0.17
94 0.19
95 0.22
96 0.23
97 0.24
98 0.22
99 0.21
100 0.19
101 0.2
102 0.21
103 0.19
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.19
108 0.18
109 0.2
110 0.18
111 0.19
112 0.18
113 0.24
114 0.29
115 0.3
116 0.3
117 0.28
118 0.28
119 0.31
120 0.32
121 0.27
122 0.21
123 0.19
124 0.17
125 0.14
126 0.13
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.14
137 0.14
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.09
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.21
169 0.26
170 0.27
171 0.29
172 0.34
173 0.31
174 0.31
175 0.35
176 0.36
177 0.34
178 0.33
179 0.31
180 0.29
181 0.26
182 0.23
183 0.18
184 0.14
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.19
194 0.2
195 0.23
196 0.27
197 0.26
198 0.3
199 0.32
200 0.34
201 0.29
202 0.3
203 0.27
204 0.21
205 0.22
206 0.26
207 0.25
208 0.24
209 0.24
210 0.23
211 0.23
212 0.24
213 0.22
214 0.18
215 0.16
216 0.16
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.13
221 0.16
222 0.12
223 0.16
224 0.16
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.15
232 0.14
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.15
243 0.16
244 0.18
245 0.17
246 0.19
247 0.19
248 0.23
249 0.24
250 0.24
251 0.32
252 0.38
253 0.45
254 0.5
255 0.53
256 0.59
257 0.67
258 0.73
259 0.75
260 0.77
261 0.79
262 0.82
263 0.87
264 0.86
265 0.87
266 0.88
267 0.85
268 0.85
269 0.86
270 0.87
271 0.84
272 0.83
273 0.78
274 0.77
275 0.79
276 0.75
277 0.74
278 0.73
279 0.71
280 0.7
281 0.73
282 0.66
283 0.59
284 0.55
285 0.47