Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JSC3

Protein Details
Accession W4JSC3    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-179TPTVPQSKKDRYKPMQPKFPSHydrophilic
338-367VKPLMLTKKEQKKMRKQRRQAELQDKRDRIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-357KKEQKKMRKQRRQ
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG hir:HETIRDRAFT_446772  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MSDRKRPLEGGSDVSAAKRTRSNVATPSHETNSTAELSQAALITQKKAEVQAKLAAMQKKAAGSVLKTPTPSVTSASAMPTPRPAASTSQSPSPSVTDDLARKVAEARRKVAEAQSKLAIKDNPYMSMPQTGKKNKLVEPAQQGAGLKMTAHPLLLDVTPTVPQSKKDRYKPMQPKFPSMKANTRNVPTPPPVAPTPPPKENPYAVAASSAGDSGFEGAPRERVGRSMKFNPKGKYVALANQQRQEAQLEALKQRIAQSARKAGLDSEFDTLEKHIRREPPPDAEWWDVALLPNKTYEDLVNLGPSLLNIRNQHSPINIYIQHPIPIVAPSEKNTPAVKPLMLTKKEQKKMRKQRRQAELQDKRDRIRMGLIPPDPPKVRLANLMKVLTSDAVQDPTRVEARVRREVAIRKHGHEKMNAERKLTDDQRREKIETKKVEEEKKGIYAAVFKIKTLSDPAHRFKVRKNAEQMNLTGIAIFNPSFSLVYVEGAAKFIRMYQRLMLHRIAWTEAARARGEEDVVLDISEGQIPDTVENAGKGKSKADDGTQIGEVSLEDNRCDMVWEGQLRDRAFTNFRPKSCPTDGAAREALGMKMAGYWDMAKNWKPDDEFF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.28
4 0.27
5 0.27
6 0.27
7 0.32
8 0.36
9 0.41
10 0.42
11 0.48
12 0.52
13 0.53
14 0.56
15 0.52
16 0.49
17 0.44
18 0.39
19 0.36
20 0.31
21 0.25
22 0.19
23 0.16
24 0.15
25 0.15
26 0.13
27 0.1
28 0.12
29 0.14
30 0.16
31 0.16
32 0.17
33 0.18
34 0.25
35 0.3
36 0.28
37 0.31
38 0.34
39 0.35
40 0.37
41 0.42
42 0.4
43 0.36
44 0.35
45 0.34
46 0.29
47 0.28
48 0.27
49 0.23
50 0.21
51 0.28
52 0.32
53 0.32
54 0.32
55 0.32
56 0.32
57 0.31
58 0.3
59 0.24
60 0.21
61 0.2
62 0.21
63 0.23
64 0.25
65 0.23
66 0.23
67 0.24
68 0.24
69 0.23
70 0.23
71 0.22
72 0.23
73 0.26
74 0.32
75 0.31
76 0.35
77 0.36
78 0.35
79 0.35
80 0.31
81 0.3
82 0.25
83 0.24
84 0.22
85 0.23
86 0.26
87 0.27
88 0.25
89 0.23
90 0.27
91 0.3
92 0.34
93 0.35
94 0.36
95 0.38
96 0.4
97 0.42
98 0.44
99 0.48
100 0.43
101 0.42
102 0.44
103 0.42
104 0.41
105 0.43
106 0.38
107 0.32
108 0.35
109 0.33
110 0.29
111 0.28
112 0.29
113 0.26
114 0.31
115 0.3
116 0.28
117 0.36
118 0.4
119 0.44
120 0.49
121 0.53
122 0.49
123 0.57
124 0.56
125 0.54
126 0.55
127 0.53
128 0.47
129 0.44
130 0.4
131 0.31
132 0.28
133 0.2
134 0.13
135 0.1
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.13
149 0.13
150 0.17
151 0.24
152 0.34
153 0.43
154 0.5
155 0.6
156 0.63
157 0.73
158 0.8
159 0.81
160 0.81
161 0.75
162 0.77
163 0.73
164 0.73
165 0.7
166 0.64
167 0.64
168 0.61
169 0.65
170 0.61
171 0.57
172 0.55
173 0.49
174 0.49
175 0.42
176 0.39
177 0.32
178 0.31
179 0.3
180 0.29
181 0.32
182 0.36
183 0.39
184 0.41
185 0.43
186 0.42
187 0.46
188 0.43
189 0.41
190 0.35
191 0.3
192 0.24
193 0.22
194 0.19
195 0.15
196 0.13
197 0.11
198 0.07
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.12
209 0.1
210 0.14
211 0.2
212 0.23
213 0.3
214 0.38
215 0.46
216 0.53
217 0.59
218 0.58
219 0.56
220 0.54
221 0.48
222 0.42
223 0.35
224 0.33
225 0.35
226 0.4
227 0.39
228 0.4
229 0.4
230 0.37
231 0.36
232 0.3
233 0.22
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.19
243 0.2
244 0.21
245 0.25
246 0.3
247 0.32
248 0.31
249 0.3
250 0.26
251 0.25
252 0.23
253 0.2
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.16
260 0.15
261 0.15
262 0.18
263 0.24
264 0.27
265 0.32
266 0.35
267 0.36
268 0.36
269 0.37
270 0.37
271 0.32
272 0.29
273 0.24
274 0.2
275 0.15
276 0.14
277 0.15
278 0.11
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.11
296 0.12
297 0.15
298 0.18
299 0.19
300 0.2
301 0.18
302 0.19
303 0.17
304 0.2
305 0.19
306 0.17
307 0.19
308 0.18
309 0.18
310 0.17
311 0.16
312 0.12
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.15
319 0.15
320 0.18
321 0.18
322 0.17
323 0.18
324 0.19
325 0.17
326 0.14
327 0.2
328 0.26
329 0.27
330 0.3
331 0.36
332 0.44
333 0.51
334 0.58
335 0.61
336 0.64
337 0.73
338 0.81
339 0.83
340 0.83
341 0.85
342 0.88
343 0.88
344 0.86
345 0.86
346 0.84
347 0.83
348 0.83
349 0.76
350 0.68
351 0.64
352 0.54
353 0.44
354 0.39
355 0.33
356 0.27
357 0.32
358 0.31
359 0.31
360 0.32
361 0.37
362 0.32
363 0.3
364 0.29
365 0.24
366 0.24
367 0.28
368 0.31
369 0.31
370 0.35
371 0.34
372 0.31
373 0.29
374 0.29
375 0.2
376 0.16
377 0.12
378 0.09
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.13
384 0.15
385 0.13
386 0.14
387 0.17
388 0.23
389 0.31
390 0.33
391 0.32
392 0.36
393 0.43
394 0.48
395 0.53
396 0.5
397 0.45
398 0.52
399 0.56
400 0.54
401 0.51
402 0.49
403 0.49
404 0.56
405 0.54
406 0.47
407 0.43
408 0.42
409 0.45
410 0.47
411 0.46
412 0.45
413 0.51
414 0.56
415 0.61
416 0.62
417 0.62
418 0.63
419 0.63
420 0.62
421 0.61
422 0.63
423 0.66
424 0.69
425 0.65
426 0.6
427 0.54
428 0.48
429 0.42
430 0.33
431 0.27
432 0.23
433 0.22
434 0.27
435 0.24
436 0.21
437 0.22
438 0.22
439 0.23
440 0.23
441 0.24
442 0.24
443 0.32
444 0.37
445 0.44
446 0.48
447 0.49
448 0.51
449 0.58
450 0.56
451 0.57
452 0.61
453 0.6
454 0.62
455 0.64
456 0.58
457 0.51
458 0.45
459 0.36
460 0.28
461 0.19
462 0.14
463 0.12
464 0.11
465 0.07
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.1
471 0.08
472 0.09
473 0.1
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.09
479 0.08
480 0.11
481 0.17
482 0.17
483 0.2
484 0.24
485 0.32
486 0.35
487 0.4
488 0.39
489 0.34
490 0.34
491 0.33
492 0.3
493 0.25
494 0.22
495 0.22
496 0.22
497 0.24
498 0.22
499 0.21
500 0.21
501 0.19
502 0.19
503 0.15
504 0.14
505 0.12
506 0.12
507 0.11
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.1
512 0.08
513 0.07
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.1
518 0.11
519 0.1
520 0.12
521 0.13
522 0.14
523 0.18
524 0.19
525 0.21
526 0.22
527 0.25
528 0.26
529 0.28
530 0.33
531 0.31
532 0.34
533 0.32
534 0.3
535 0.25
536 0.23
537 0.19
538 0.13
539 0.15
540 0.12
541 0.11
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.14
546 0.14
547 0.13
548 0.19
549 0.22
550 0.25
551 0.29
552 0.35
553 0.33
554 0.34
555 0.33
556 0.31
557 0.33
558 0.38
559 0.45
560 0.47
561 0.49
562 0.54
563 0.55
564 0.59
565 0.59
566 0.56
567 0.49
568 0.52
569 0.51
570 0.51
571 0.49
572 0.4
573 0.36
574 0.33
575 0.3
576 0.2
577 0.18
578 0.12
579 0.11
580 0.12
581 0.1
582 0.1
583 0.12
584 0.14
585 0.18
586 0.24
587 0.27
588 0.31
589 0.34
590 0.39