Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4K5A6

Protein Details
Accession W4K5A6    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-66NEERMKQGKKPLRGKKQDLPKPTBasic
177-196LAARAEKKAQKKAERDKARLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-65RAKKKDDEERDRMKENEERMKQGKKPLRGKKQDLPKP
180-192RAEKKAQKKAERD
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG hir:HETIRDRAFT_320162  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MADKQGAYGNKAADTDFRRKWDKEEYAERAKKKDDEERDRMKENEERMKQGKKPLRGKKQDLPKPTELMKRREHDLELDKNLGKTMVVQNPGGRGPGQPGFYCDTCNRTYKDSVGYLDHINGRAHLRALGQTTRIERSTVQQVRARIAYLREKTKEASNAKAFDFEQRLTEIRDKELAARAEKKAQKKAERDKARLELAQDTTMNQDGDNMMSMMGFSGFGTSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.34
3 0.35
4 0.4
5 0.45
6 0.46
7 0.51
8 0.54
9 0.56
10 0.56
11 0.61
12 0.63
13 0.67
14 0.73
15 0.71
16 0.66
17 0.63
18 0.59
19 0.55
20 0.57
21 0.57
22 0.59
23 0.65
24 0.7
25 0.71
26 0.71
27 0.66
28 0.61
29 0.56
30 0.53
31 0.54
32 0.48
33 0.49
34 0.5
35 0.56
36 0.55
37 0.6
38 0.6
39 0.6
40 0.67
41 0.7
42 0.76
43 0.78
44 0.82
45 0.8
46 0.83
47 0.81
48 0.79
49 0.76
50 0.69
51 0.63
52 0.6
53 0.61
54 0.56
55 0.56
56 0.56
57 0.51
58 0.51
59 0.5
60 0.45
61 0.42
62 0.43
63 0.42
64 0.37
65 0.37
66 0.34
67 0.31
68 0.3
69 0.24
70 0.17
71 0.14
72 0.17
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.22
78 0.22
79 0.2
80 0.15
81 0.11
82 0.12
83 0.15
84 0.16
85 0.14
86 0.16
87 0.19
88 0.18
89 0.21
90 0.18
91 0.19
92 0.19
93 0.23
94 0.22
95 0.22
96 0.23
97 0.21
98 0.24
99 0.21
100 0.2
101 0.18
102 0.19
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.15
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.18
125 0.27
126 0.28
127 0.31
128 0.31
129 0.32
130 0.34
131 0.34
132 0.32
133 0.23
134 0.24
135 0.27
136 0.29
137 0.35
138 0.34
139 0.35
140 0.36
141 0.39
142 0.43
143 0.38
144 0.41
145 0.4
146 0.4
147 0.39
148 0.4
149 0.35
150 0.32
151 0.33
152 0.25
153 0.22
154 0.21
155 0.22
156 0.23
157 0.29
158 0.24
159 0.23
160 0.25
161 0.24
162 0.25
163 0.3
164 0.3
165 0.3
166 0.33
167 0.34
168 0.4
169 0.46
170 0.5
171 0.53
172 0.58
173 0.62
174 0.67
175 0.76
176 0.77
177 0.81
178 0.79
179 0.79
180 0.76
181 0.72
182 0.64
183 0.56
184 0.51
185 0.44
186 0.43
187 0.35
188 0.29
189 0.27
190 0.28
191 0.25
192 0.19
193 0.17
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.12
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.07