Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KMR5

Protein Details
Accession W4KMR5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-150YSLKTEYSKDKYKKRKEAKFSRSFITHydrophilic
400-420MPVEMHRRPKVRKTGPSPASEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto 11, mito_nucl 8.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG hir:HETIRDRAFT_377909  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MKHEKKASFAIRSGDNILLRLPTGEIRSVKLDKDSTINLGKFGSFYANALIDQPYGLSHEIVDKQLRVLLPRTMSEIEDTEATNELINDGQFVQPLTGIEIEALKQSGVHASDIINKQIEMHANYSLKTEYSKDKYKKRKEAKFSRSFITIEPTLFNVCEYWYNKDHSRIRDIRVDTLSQIVNMANIRPGGRYLAVDDASGMVVSAILERLGGNGRLITVCDVDSPPAYPVMAQMNFPKEHVSSTLSSLNWVTAEKEYVPVMAPVEPTDSQYRSEKHKTRLSKRKALSDTLSSTREELFSGGFEGLVVASEYDPFSIIERLVLYLGGSASLVVYSPHLQILSDLQNKLRENPQYLAPSVTESWLRRYQVLPGRTHPTMSTTGSGGYLLHAIKVYDDPAAMPVEMHRRPKVRKTGPSPASEGEVGPNATSADLEGEGPSSSGEVNEPHKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.3
4 0.27
5 0.23
6 0.2
7 0.18
8 0.16
9 0.14
10 0.16
11 0.21
12 0.22
13 0.24
14 0.3
15 0.32
16 0.32
17 0.34
18 0.34
19 0.3
20 0.33
21 0.33
22 0.32
23 0.37
24 0.36
25 0.31
26 0.3
27 0.28
28 0.24
29 0.22
30 0.2
31 0.13
32 0.13
33 0.15
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.16
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.14
47 0.16
48 0.2
49 0.22
50 0.2
51 0.2
52 0.23
53 0.23
54 0.21
55 0.22
56 0.24
57 0.23
58 0.24
59 0.28
60 0.26
61 0.26
62 0.25
63 0.23
64 0.19
65 0.18
66 0.17
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.19
100 0.2
101 0.22
102 0.2
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.23
107 0.18
108 0.18
109 0.21
110 0.21
111 0.22
112 0.23
113 0.21
114 0.17
115 0.16
116 0.18
117 0.2
118 0.26
119 0.36
120 0.42
121 0.52
122 0.62
123 0.71
124 0.79
125 0.82
126 0.85
127 0.86
128 0.89
129 0.9
130 0.9
131 0.82
132 0.75
133 0.67
134 0.59
135 0.48
136 0.43
137 0.33
138 0.24
139 0.21
140 0.19
141 0.17
142 0.16
143 0.15
144 0.09
145 0.08
146 0.14
147 0.15
148 0.19
149 0.2
150 0.25
151 0.27
152 0.35
153 0.4
154 0.38
155 0.46
156 0.46
157 0.47
158 0.5
159 0.5
160 0.46
161 0.42
162 0.39
163 0.3
164 0.28
165 0.25
166 0.17
167 0.16
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.07
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.17
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.12
231 0.15
232 0.18
233 0.16
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.12
238 0.11
239 0.1
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.2
259 0.23
260 0.27
261 0.36
262 0.41
263 0.45
264 0.52
265 0.6
266 0.66
267 0.75
268 0.76
269 0.76
270 0.73
271 0.75
272 0.71
273 0.66
274 0.59
275 0.53
276 0.49
277 0.44
278 0.42
279 0.32
280 0.3
281 0.25
282 0.22
283 0.17
284 0.13
285 0.09
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.07
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.14
328 0.2
329 0.23
330 0.24
331 0.26
332 0.32
333 0.32
334 0.35
335 0.37
336 0.34
337 0.34
338 0.35
339 0.39
340 0.37
341 0.37
342 0.35
343 0.29
344 0.28
345 0.24
346 0.24
347 0.22
348 0.2
349 0.26
350 0.29
351 0.31
352 0.29
353 0.3
354 0.37
355 0.4
356 0.45
357 0.43
358 0.42
359 0.48
360 0.46
361 0.47
362 0.39
363 0.34
364 0.32
365 0.3
366 0.26
367 0.2
368 0.2
369 0.19
370 0.19
371 0.14
372 0.11
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.13
386 0.11
387 0.1
388 0.13
389 0.21
390 0.26
391 0.32
392 0.37
393 0.44
394 0.51
395 0.61
396 0.68
397 0.69
398 0.74
399 0.77
400 0.82
401 0.8
402 0.78
403 0.74
404 0.64
405 0.58
406 0.49
407 0.41
408 0.32
409 0.29
410 0.24
411 0.19
412 0.18
413 0.14
414 0.13
415 0.12
416 0.1
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.09
429 0.12