Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JZU1

Protein Details
Accession W4JZU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-56QQERSSAGPYPKKRKRSNPRNGRQYGRGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-50PKKRKRSNPRNGR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG hir:HETIRDRAFT_165537  -  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MSKRPIVSYDDIVPTNSPHAGPSVTPQQQERSSAGPYPKKRKRSNPRNGRQYGRGAEPQRHVQHWDDPGSAVQPMPYDDESSISMTTQVILEPEDEGQEEANEEEEGEESRELTHDEIWDDSALIEAWESAAAEYEAFHGTDQSWKNEPVKKSPLWYNIPPPPSKLKKSPQKSETNVAPGVDADDSQPINFEGFVPHHDASLTSSSAIIPRVPSIDGHQLATAPEGFVSQDEAFNRALGAMYWAGYWTAVYHGHKKQPGASAPSNEGEEEDKDQEPGEADDVDDATVEEELISTQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.24
4 0.18
5 0.14
6 0.16
7 0.16
8 0.15
9 0.2
10 0.27
11 0.3
12 0.32
13 0.34
14 0.39
15 0.4
16 0.43
17 0.4
18 0.33
19 0.32
20 0.35
21 0.41
22 0.44
23 0.5
24 0.58
25 0.64
26 0.71
27 0.78
28 0.84
29 0.87
30 0.89
31 0.91
32 0.91
33 0.93
34 0.93
35 0.91
36 0.87
37 0.81
38 0.78
39 0.71
40 0.65
41 0.63
42 0.56
43 0.55
44 0.53
45 0.56
46 0.52
47 0.5
48 0.48
49 0.42
50 0.45
51 0.43
52 0.42
53 0.33
54 0.3
55 0.28
56 0.26
57 0.23
58 0.16
59 0.12
60 0.09
61 0.09
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.11
71 0.11
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.12
129 0.13
130 0.15
131 0.16
132 0.19
133 0.23
134 0.28
135 0.29
136 0.3
137 0.34
138 0.32
139 0.34
140 0.37
141 0.4
142 0.4
143 0.41
144 0.41
145 0.41
146 0.44
147 0.41
148 0.38
149 0.4
150 0.41
151 0.43
152 0.44
153 0.48
154 0.54
155 0.62
156 0.69
157 0.68
158 0.71
159 0.71
160 0.69
161 0.63
162 0.58
163 0.5
164 0.41
165 0.33
166 0.23
167 0.21
168 0.14
169 0.11
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.14
202 0.21
203 0.21
204 0.21
205 0.2
206 0.2
207 0.19
208 0.2
209 0.16
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.1
216 0.09
217 0.12
218 0.12
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.1
224 0.1
225 0.07
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.06
235 0.07
236 0.12
237 0.16
238 0.23
239 0.29
240 0.37
241 0.41
242 0.42
243 0.45
244 0.48
245 0.51
246 0.51
247 0.51
248 0.48
249 0.48
250 0.49
251 0.45
252 0.37
253 0.32
254 0.26
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.18
263 0.17
264 0.15
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.05
276 0.05