Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H0T4

Protein Details
Accession C1H0T4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGKRKRSKRKLLTQEEIWDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-10KRKRSKRK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 8, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
IPR010304  SMN_Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0097504  C:Gemini of coiled bodies  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pbl:PAAG_04378  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MGKRKRSKRKLLTQEEIWDDSALIQSWDDAVEEYNLYHSIQARGENVDDVLREEEARARAAEVEDGQQAVGESQPHVDTDAEPEPDQGVNGEEIEMQPAYTHGEQDKMEAPSTQTQPEVNHTASGWFANMPQLVAQGGGDAAGTDEGLKNLMMAWYYAGYYTGLYEGQRRSNQRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.75
3 0.67
4 0.57
5 0.46
6 0.36
7 0.28
8 0.23
9 0.16
10 0.11
11 0.09
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.11
26 0.12
27 0.14
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.13
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.1
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.08
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.08
90 0.11
91 0.11
92 0.13
93 0.17
94 0.15
95 0.16
96 0.15
97 0.17
98 0.2
99 0.22
100 0.21
101 0.18
102 0.18
103 0.19
104 0.23
105 0.25
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.15
112 0.11
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.04
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.15
153 0.19
154 0.26
155 0.33