Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4KLB3

Protein Details
Accession W4KLB3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-402IVTRGDGFRKEKNKKKRGSYKGGEITMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-282KAVKSKAKRASPEP
287-295RSERATKKR
384-393RKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG hir:HETIRDRAFT_471488  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSKSDQETTESGDGSLAATYILIHSFLLKHSHSKAAKALQKSARDVVVLKDATESDGLSLDEIVKEWKKLKAIVASFESSSSESDPSSEDSDSDDSDKDEAAEKPAKEGSSPSESDELDSDSDEEMEEAKPIQKSKSSSKLDASEKQAPAVGDSSATLSSNEESSTSDAESSDEESSTENASAKAKVKAQPVKSSAKKVAGSKAEPIPSDSESSSSSSDDSASSESDAKTKPESTPKSKPKSDSSSGSSSSDSDSDDETAPTTKLKTSKAVKSKAKRASPEPVIEERSERATKKRRTTEDGTAVTTATTSESQSPQPQTKNGKNGNGKPPRKTNTPFQRVKVDQVQFTDERLKDNTFESRNASMDDYGAKASRDLIVTRGDGFRKEKNKKKRGSYKGGEITMGTHSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.09
4 0.06
5 0.05
6 0.05
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.06
11 0.08
12 0.09
13 0.11
14 0.16
15 0.17
16 0.22
17 0.25
18 0.35
19 0.35
20 0.38
21 0.43
22 0.47
23 0.52
24 0.51
25 0.57
26 0.55
27 0.59
28 0.6
29 0.56
30 0.49
31 0.44
32 0.4
33 0.34
34 0.35
35 0.29
36 0.25
37 0.23
38 0.22
39 0.21
40 0.21
41 0.18
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.13
51 0.13
52 0.17
53 0.2
54 0.23
55 0.26
56 0.28
57 0.33
58 0.36
59 0.37
60 0.39
61 0.41
62 0.39
63 0.36
64 0.34
65 0.3
66 0.22
67 0.21
68 0.17
69 0.14
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.16
75 0.15
76 0.13
77 0.15
78 0.17
79 0.17
80 0.17
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.11
86 0.13
87 0.13
88 0.17
89 0.22
90 0.21
91 0.23
92 0.26
93 0.25
94 0.22
95 0.23
96 0.23
97 0.23
98 0.24
99 0.24
100 0.24
101 0.24
102 0.24
103 0.23
104 0.2
105 0.14
106 0.14
107 0.12
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.1
117 0.12
118 0.13
119 0.15
120 0.18
121 0.23
122 0.3
123 0.4
124 0.42
125 0.43
126 0.46
127 0.51
128 0.52
129 0.53
130 0.53
131 0.5
132 0.45
133 0.42
134 0.4
135 0.33
136 0.28
137 0.24
138 0.17
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.12
170 0.14
171 0.16
172 0.19
173 0.23
174 0.31
175 0.36
176 0.38
177 0.43
178 0.45
179 0.51
180 0.5
181 0.5
182 0.46
183 0.45
184 0.44
185 0.4
186 0.41
187 0.37
188 0.35
189 0.34
190 0.34
191 0.31
192 0.28
193 0.27
194 0.23
195 0.19
196 0.2
197 0.16
198 0.14
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.18
219 0.25
220 0.32
221 0.37
222 0.46
223 0.55
224 0.61
225 0.64
226 0.65
227 0.64
228 0.65
229 0.62
230 0.56
231 0.52
232 0.48
233 0.46
234 0.43
235 0.35
236 0.28
237 0.24
238 0.2
239 0.15
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.12
251 0.15
252 0.17
253 0.24
254 0.3
255 0.38
256 0.46
257 0.55
258 0.61
259 0.66
260 0.74
261 0.75
262 0.74
263 0.7
264 0.67
265 0.66
266 0.63
267 0.59
268 0.55
269 0.5
270 0.47
271 0.42
272 0.39
273 0.31
274 0.32
275 0.31
276 0.28
277 0.33
278 0.4
279 0.48
280 0.56
281 0.64
282 0.64
283 0.68
284 0.73
285 0.73
286 0.72
287 0.66
288 0.58
289 0.49
290 0.43
291 0.35
292 0.28
293 0.18
294 0.11
295 0.09
296 0.09
297 0.11
298 0.14
299 0.17
300 0.23
301 0.28
302 0.32
303 0.34
304 0.4
305 0.46
306 0.51
307 0.59
308 0.59
309 0.63
310 0.66
311 0.72
312 0.75
313 0.77
314 0.75
315 0.73
316 0.76
317 0.73
318 0.73
319 0.69
320 0.69
321 0.7
322 0.74
323 0.74
324 0.68
325 0.72
326 0.66
327 0.68
328 0.67
329 0.6
330 0.53
331 0.49
332 0.51
333 0.41
334 0.42
335 0.43
336 0.34
337 0.33
338 0.33
339 0.32
340 0.27
341 0.3
342 0.35
343 0.3
344 0.32
345 0.34
346 0.34
347 0.33
348 0.34
349 0.33
350 0.25
351 0.23
352 0.22
353 0.18
354 0.17
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.15
359 0.16
360 0.17
361 0.16
362 0.17
363 0.19
364 0.2
365 0.23
366 0.26
367 0.25
368 0.29
369 0.32
370 0.39
371 0.46
372 0.55
373 0.62
374 0.69
375 0.77
376 0.81
377 0.88
378 0.9
379 0.9
380 0.9
381 0.89
382 0.88
383 0.87
384 0.79
385 0.69
386 0.59
387 0.5
388 0.45
389 0.39
390 0.3
391 0.22