Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W4JPI1

Protein Details
Accession W4JPI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-89GDKPKAKPGRKAQAKPTAKKBasic
91-134GRTAKPKVKARAKPGPKPKPKPNPTPKLRGRPKNSKPAKPPTVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-136KPKAKPGRKAQAKPTAKKAGRTAKPKVKARAKPGPKPKPKPNPTPKLRGRPKNSKPAKPPTVKLE
223-228RRRKKR
Subcellular Location(s) mito 23, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG hir:HETIRDRAFT_482174  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MLSVLFRRTALLRAHALYRAPTVAAAAVARRTFVTSSPRFFPSSEAAATATAPKRTRKSSSVTTDDADAGDKPKAKPGRKAQAKPTAKKAGRTAKPKVKARAKPGPKPKPKPNPTPKLRGRPKNSKPAKPPTVKLEPEDKPPRPPGNTFIQFYVDFYKRAGPPGSTEDSRLRSREAGKAWGLMSDEEKAVWREKGLAAHAEYKTKYTAWLKTVDKTKLAELNRRRKKRGISPITQNELHPKPPNSFVRFAQELSKTKFIKGMQPPGVNYPPYLSRESAAIWKTMSDAEKAPHIFFLDHSRTLKSISEISRYGRWSINAGSRNGARIRSHRLRTMQSEMMLM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.34
4 0.3
5 0.29
6 0.25
7 0.21
8 0.18
9 0.16
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.15
15 0.14
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.16
20 0.19
21 0.27
22 0.28
23 0.33
24 0.37
25 0.39
26 0.39
27 0.38
28 0.38
29 0.34
30 0.32
31 0.28
32 0.25
33 0.23
34 0.21
35 0.22
36 0.24
37 0.23
38 0.24
39 0.27
40 0.33
41 0.38
42 0.44
43 0.5
44 0.48
45 0.52
46 0.56
47 0.61
48 0.6
49 0.57
50 0.52
51 0.47
52 0.43
53 0.36
54 0.27
55 0.19
56 0.15
57 0.16
58 0.19
59 0.18
60 0.25
61 0.33
62 0.37
63 0.46
64 0.54
65 0.62
66 0.68
67 0.74
68 0.76
69 0.78
70 0.83
71 0.79
72 0.78
73 0.77
74 0.69
75 0.68
76 0.67
77 0.67
78 0.65
79 0.68
80 0.68
81 0.67
82 0.74
83 0.77
84 0.78
85 0.77
86 0.77
87 0.78
88 0.79
89 0.78
90 0.78
91 0.81
92 0.82
93 0.83
94 0.85
95 0.87
96 0.87
97 0.87
98 0.89
99 0.88
100 0.88
101 0.84
102 0.85
103 0.84
104 0.83
105 0.85
106 0.84
107 0.82
108 0.82
109 0.83
110 0.83
111 0.83
112 0.81
113 0.79
114 0.8
115 0.8
116 0.75
117 0.7
118 0.67
119 0.67
120 0.6
121 0.54
122 0.52
123 0.45
124 0.49
125 0.54
126 0.48
127 0.44
128 0.49
129 0.51
130 0.46
131 0.46
132 0.4
133 0.41
134 0.44
135 0.4
136 0.34
137 0.32
138 0.29
139 0.28
140 0.29
141 0.2
142 0.17
143 0.16
144 0.2
145 0.17
146 0.2
147 0.2
148 0.15
149 0.17
150 0.21
151 0.24
152 0.2
153 0.22
154 0.23
155 0.26
156 0.28
157 0.26
158 0.23
159 0.22
160 0.24
161 0.26
162 0.24
163 0.24
164 0.23
165 0.24
166 0.22
167 0.2
168 0.18
169 0.14
170 0.13
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.22
189 0.21
190 0.21
191 0.18
192 0.21
193 0.2
194 0.23
195 0.22
196 0.29
197 0.3
198 0.34
199 0.41
200 0.39
201 0.37
202 0.34
203 0.34
204 0.34
205 0.35
206 0.39
207 0.41
208 0.5
209 0.58
210 0.64
211 0.66
212 0.66
213 0.71
214 0.72
215 0.74
216 0.72
217 0.69
218 0.72
219 0.76
220 0.75
221 0.68
222 0.59
223 0.55
224 0.49
225 0.46
226 0.42
227 0.36
228 0.33
229 0.4
230 0.47
231 0.45
232 0.46
233 0.43
234 0.44
235 0.43
236 0.42
237 0.39
238 0.38
239 0.39
240 0.4
241 0.46
242 0.4
243 0.39
244 0.43
245 0.38
246 0.41
247 0.43
248 0.47
249 0.47
250 0.49
251 0.5
252 0.51
253 0.54
254 0.45
255 0.38
256 0.31
257 0.28
258 0.28
259 0.3
260 0.24
261 0.21
262 0.21
263 0.23
264 0.27
265 0.23
266 0.21
267 0.18
268 0.17
269 0.18
270 0.2
271 0.2
272 0.16
273 0.17
274 0.17
275 0.24
276 0.25
277 0.25
278 0.23
279 0.23
280 0.21
281 0.2
282 0.28
283 0.27
284 0.3
285 0.31
286 0.31
287 0.3
288 0.32
289 0.33
290 0.27
291 0.29
292 0.27
293 0.31
294 0.32
295 0.35
296 0.39
297 0.39
298 0.39
299 0.36
300 0.33
301 0.32
302 0.34
303 0.39
304 0.38
305 0.38
306 0.4
307 0.38
308 0.42
309 0.42
310 0.41
311 0.38
312 0.39
313 0.48
314 0.52
315 0.57
316 0.59
317 0.64
318 0.66
319 0.67
320 0.69
321 0.64