Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HE47

Protein Details
Accession C1HE47    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-179EFSLAKYTLRKRKKYLKRFSVLPHydrophilic
396-423LSWKPNKRGMYYRKRRRWARVRNVVGETHydrophilic
586-607KVEARGHQGRKKRRTEMGTPDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-413RKRRRW
592-599HQGRKKRR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 9, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG pbl:PAAG_09032  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSRVLPHAYVGLGLPSDTIKIQQIVPNTIISLGKYGSFQANQIIGRPYHLTFEIVDHPDTDDNHALRIVPAAELHTESLLTDGSLPRESEDFEGSREPDDTDPSSMRTNRETVDDNSSQLMTMDEIEVLKRDTTGAGREIINKLLESHSGLDQKTEFSLAKYTLRKRKKYLKRFSVLPLDVPLLTNWMLKQKDAAKIMELRDEIVGLIGCWANVHNGGDAFIMTDSTKLRSAGRWLVVDDTGGLIVAAMAERMGILYPPESGIGSFAAGVDSRVEAGKYKGSASQPCGLSSPDGSVPLVNCPPGQADISSSSSSSRHRQPTLGMSSTNTTLTMIHANAQPNLSLLKYFSFDASDPSPSHPLHTNLKTLSWLQLLEPHSDPVYNNEPPVVSDATLLSWKPNKRGMYYRKRRRWARVRNVVGETRSGGFDGLIVASLMDPTSILKHAVPLLSGSAPVVVYAPHIEPLLRLADFYSTARRTAYMNLKREAWQRNQCHGSTASQNGNPRSAGFYEGCGIDTGDAEKPSAGTNEADFPVDPTLLLAPTIQTSRVRLWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFHAIRALPALGKVEARGHQGRKKRRTEMGTPDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.13
8 0.14
9 0.17
10 0.2
11 0.24
12 0.27
13 0.28
14 0.27
15 0.25
16 0.25
17 0.23
18 0.2
19 0.18
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.16
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.21
28 0.24
29 0.24
30 0.27
31 0.29
32 0.24
33 0.26
34 0.29
35 0.25
36 0.24
37 0.24
38 0.22
39 0.18
40 0.22
41 0.26
42 0.26
43 0.26
44 0.23
45 0.24
46 0.26
47 0.26
48 0.27
49 0.26
50 0.24
51 0.24
52 0.24
53 0.22
54 0.2
55 0.21
56 0.16
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.07
69 0.09
70 0.1
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.2
79 0.18
80 0.18
81 0.22
82 0.21
83 0.22
84 0.21
85 0.21
86 0.17
87 0.21
88 0.21
89 0.21
90 0.21
91 0.23
92 0.28
93 0.29
94 0.31
95 0.3
96 0.3
97 0.28
98 0.31
99 0.33
100 0.29
101 0.35
102 0.33
103 0.31
104 0.29
105 0.28
106 0.24
107 0.19
108 0.17
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.14
123 0.14
124 0.16
125 0.17
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.19
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.21
138 0.2
139 0.21
140 0.2
141 0.2
142 0.18
143 0.19
144 0.15
145 0.12
146 0.15
147 0.15
148 0.22
149 0.28
150 0.36
151 0.44
152 0.53
153 0.59
154 0.64
155 0.73
156 0.77
157 0.81
158 0.84
159 0.84
160 0.81
161 0.79
162 0.77
163 0.76
164 0.65
165 0.56
166 0.46
167 0.37
168 0.31
169 0.27
170 0.21
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.21
179 0.23
180 0.29
181 0.31
182 0.31
183 0.27
184 0.31
185 0.32
186 0.32
187 0.27
188 0.22
189 0.19
190 0.19
191 0.15
192 0.11
193 0.1
194 0.05
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.17
220 0.2
221 0.22
222 0.21
223 0.21
224 0.21
225 0.2
226 0.19
227 0.15
228 0.1
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.13
269 0.16
270 0.19
271 0.21
272 0.26
273 0.25
274 0.25
275 0.25
276 0.21
277 0.19
278 0.16
279 0.14
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.07
294 0.08
295 0.1
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.16
302 0.19
303 0.23
304 0.26
305 0.27
306 0.28
307 0.3
308 0.35
309 0.38
310 0.35
311 0.28
312 0.23
313 0.23
314 0.23
315 0.21
316 0.14
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.1
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.16
344 0.2
345 0.18
346 0.2
347 0.21
348 0.23
349 0.28
350 0.29
351 0.31
352 0.27
353 0.28
354 0.27
355 0.25
356 0.23
357 0.17
358 0.15
359 0.11
360 0.17
361 0.18
362 0.19
363 0.19
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.17
368 0.16
369 0.2
370 0.18
371 0.17
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.19
376 0.15
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.16
385 0.18
386 0.22
387 0.28
388 0.29
389 0.33
390 0.43
391 0.5
392 0.56
393 0.65
394 0.72
395 0.76
396 0.83
397 0.87
398 0.88
399 0.88
400 0.88
401 0.88
402 0.87
403 0.84
404 0.81
405 0.77
406 0.7
407 0.6
408 0.5
409 0.41
410 0.31
411 0.24
412 0.18
413 0.14
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.06
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.06
428 0.06
429 0.08
430 0.08
431 0.1
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.12
437 0.11
438 0.11
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.05
445 0.06
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.11
453 0.13
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.12
459 0.14
460 0.19
461 0.18
462 0.19
463 0.19
464 0.19
465 0.2
466 0.26
467 0.35
468 0.36
469 0.41
470 0.43
471 0.45
472 0.49
473 0.55
474 0.55
475 0.54
476 0.55
477 0.56
478 0.63
479 0.65
480 0.6
481 0.57
482 0.52
483 0.46
484 0.42
485 0.41
486 0.37
487 0.36
488 0.41
489 0.39
490 0.4
491 0.36
492 0.31
493 0.29
494 0.24
495 0.25
496 0.2
497 0.19
498 0.19
499 0.19
500 0.19
501 0.15
502 0.15
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.13
512 0.14
513 0.13
514 0.11
515 0.13
516 0.17
517 0.18
518 0.18
519 0.17
520 0.17
521 0.17
522 0.16
523 0.14
524 0.1
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.08
530 0.1
531 0.12
532 0.14
533 0.14
534 0.17
535 0.21
536 0.28
537 0.3
538 0.3
539 0.31
540 0.37
541 0.43
542 0.46
543 0.45
544 0.42
545 0.46
546 0.44
547 0.43
548 0.36
549 0.34
550 0.31
551 0.3
552 0.3
553 0.24
554 0.25
555 0.24
556 0.22
557 0.17
558 0.14
559 0.15
560 0.16
561 0.15
562 0.13
563 0.15
564 0.15
565 0.16
566 0.18
567 0.16
568 0.11
569 0.13
570 0.16
571 0.15
572 0.16
573 0.17
574 0.2
575 0.22
576 0.29
577 0.35
578 0.4
579 0.47
580 0.56
581 0.65
582 0.7
583 0.77
584 0.78
585 0.8
586 0.8
587 0.82